Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(5-5)-Internal loop cluster 78 (cutoff=1.0 Å with sequence identity)
Cluster size 120 structure(s)
Representative structure 1m90:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence GAACA-ACGAA
Cluster members
GAACA-ACGAA
1ffk:0, 1826-1855, 1ffk:0, 1834-1847, 1jj2:0, 1876-1905, 1jj2:0, 1884-1897, 1k73:A, 1876-1905, 1k73:A, 1884-1897, 1k8a:A, 1876-1905, 1k8a:A, 1884-1897, 1k9m:A, 1876-1905, 1k9m:A, 1884-1897, 1kc8:A, 1876-1905, 1kc8:A, 1884-1897, 1kd1:A, 1876-1905, 1kd1:A, 1884-1897, 1kqs:0, 1876-1905, 1kqs:0, 1884-1897, 1m1k:A, 1876-1905, 1m1k:A, 1884-1897, 1m90:A, 1876-1905, 1m90:A, 1884-1897, 1n8r:A, 1876-1905, 1n8r:A, 1884-1897, 1nji:A, 1876-1905, 1nji:A, 1884-1897, 1q7y:A, 1876-1905, 1q7y:A, 1884-1897, 1q81:A, 1876-1905, 1q81:A, 1884-1897, 1q82:A, 1876-1905, 1q82:A, 1884-1897, 1q86:A, 1876-1905, 1q86:A, 1884-1897, 1qvf:0, 1876-1905, 1qvf:0, 1884-1897, 1qvg:0, 1876-1905, 1qvg:0, 1884-1897, 1s1i:3, 1984-2013, 1s1i:3, 1992-2005, 1s72:0, 1876-1905, 1s72:0, 1884-1897, 1vq4:0, 1876-1905, 1vq4:0, 1884-1897, 1vq5:0, 1876-1905, 1vq5:0, 1884-1897, 1vq6:0, 1876-1905, 1vq6:0, 1884-1897, 1vq7:0, 1876-1905, 1vq7:0, 1884-1897, 1vq8:0, 1876-1905, 1vq8:0, 1884-1897, 1vq9:0, 1876-1905, 1vq9:0, 1884-1897, 1vqk:0, 1876-1905, 1vqk:0, 1884-1897, 1vql:0, 1876-1905, 1vql:0, 1884-1897, 1vqm:0, 1876-1905, 1vqm:0, 1884-1897, 1vqn:0, 1876-1905, 1vqn:0, 1884-1897, 1vqo:0, 1876-1905, 1vqo:0, 1884-1897, 1vqp:0, 1876-1905, 1vqp:0, 1884-1897, 1w2b:0, 1876-1905, 1w2b:0, 1884-1897, 1yhq:0, 1876-1905, 1yhq:0, 1884-1897, 1yi2:0, 1876-1905, 1yi2:0, 1884-1897, 1yij:0, 1876-1905, 1yij:0, 1884-1897, 1yit:0, 1876-1905, 1yit:0, 1884-1897, 1yj9:0, 1876-1905, 1yj9:0, 1884-1897, 1yjn:0, 1876-1905, 1yjn:0, 1884-1897, 1yjw:0, 1876-1905, 1yjw:0, 1884-1897, 2otj:0, 1876-1905, 2otj:0, 1884-1897, 2otl:0, 1876-1905, 2otl:0, 1884-1897, 2qa4:0, 1881-1910, 2qa4:0, 1889-1902, 2qex:0, 1876-1905, 2qex:0, 1884-1897, 3cc2:0, 1876-1905, 3cc2:0, 1884-1897, 3cc4:0, 1876-1905, 3cc4:0, 1884-1897, 3cc7:0, 1876-1905, 3cc7:0, 1884-1897, 3cce:0, 1876-1905, 3cce:0, 1884-1897, 3ccj:0, 1876-1905, 3ccj:0, 1884-1897, 3ccl:0, 1876-1905, 3ccl:0, 1884-1897, 3ccm:0, 1876-1905, 3ccm:0, 1884-1897, 3ccq:0, 1876-1905, 3ccq:0, 1884-1897, 3ccr:0, 1876-1905, 3ccr:0, 1884-1897, 3ccs:0, 1876-1905, 3ccs:0, 1884-1897, 3ccu:0, 1876-1905, 3ccu:0, 1884-1897, 3ccv:0, 1876-1905, 3ccv:0, 1884-1897, 3cd6:0, 1876-1905, 3cd6:0, 1884-1897, 3cma:0, 1876-1905, 3cma:0, 1884-1897, 3cme:0, 1876-1905, 3cme:0, 1884-1897, 3cpw:0, 1876-1905, 3cpw:0, 1884-1897