Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(5-4)-Internal loop cluster 603 (cutoff=1.0 Å with sequence identity)
Cluster size 150 structure(s)
Representative structure 1yjn:9 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence GAGUA-GAAA
Cluster members
GAGUA-GAAA
1ffk:9, 71-110, 1ffk:9, 81-101, 1fqz:A, 1-27, 1fqz:A, 9-20, 1jj2:9, 71-110, 1jj2:9, 81-101, 1k73:B, 71-110, 1k73:B, 81-101, 1k8a:B, 71-110, 1k8a:B, 81-101, 1k9m:B, 71-110, 1k9m:B, 81-101, 1kc8:B, 71-110, 1kc8:B, 81-101, 1kd1:B, 71-110, 1kd1:B, 81-101, 1kqs:9, 71-110, 1kqs:9, 81-101, 1m1k:B, 71-110, 1m1k:B, 81-101, 1m90:B, 71-110, 1m90:B, 81-101, 1n8r:B, 71-110, 1n8r:B, 81-101, 1nji:B, 71-110, 1nji:B, 81-101, 1q7y:B, 71-110, 1q7y:B, 81-101, 1q81:B, 71-110, 1q81:B, 81-101, 1q82:B, 71-110, 1q82:B, 81-101, 1q86:B, 71-110, 1q86:B, 81-101, 1qvf:9, 71-110, 1qvf:9, 81-101, 1qvg:9, 71-110, 1qvg:9, 81-101, 1s1i:4, 71-110, 1s1i:4, 81-101, 1s72:9, 71-110, 1s72:9, 81-101, 1vq4:9, 71-110, 1vq4:9, 81-101, 1vq5:9, 71-110, 1vq5:9, 81-101, 1vq6:9, 71-110, 1vq6:9, 81-101, 1vq7:9, 71-110, 1vq7:9, 81-101, 1vq8:9, 71-110, 1vq8:9, 81-101, 1vq9:9, 71-110, 1vq9:9, 81-101, 1vqk:9, 71-110, 1vqk:9, 81-101, 1vql:9, 71-110, 1vql:9, 81-101, 1vqm:9, 71-110, 1vqm:9, 81-101, 1vqn:9, 71-110, 1vqn:9, 81-101, 1vqo:9, 71-110, 1vqo:9, 81-101, 1vqp:9, 71-110, 1vqp:9, 81-101, 1vsa:w, 225-252, 1vsa:w, 235-243, 1vsp:w, 225-252, 1vsp:w, 235-243, 1w2b:9, 71-110, 1w2b:9, 81-101, 1yhq:9, 74-107, 1yhq:9, 81-101, 1yi2:9, 74-107, 1yi2:9, 81-101, 1yij:9, 74-107, 1yij:9, 81-101, 1yit:9, 74-107, 1yit:9, 81-101, 1yj9:9, 74-107, 1yj9:9, 81-101, 1yjn:9, 74-107, 1yjn:9, 81-101, 1yjw:9, 74-107, 1yjw:9, 81-101, 2b66:A, 224-251, 2b66:A, 234-242, 2b9n:A, 224-251, 2b9n:A, 234-242, 2b9p:A, 224-251, 2b9p:A, 234-242, 2hgj:A, 224-251, 2hgj:A, 234-242, 2hgq:A, 224-251, 2hgq:A, 234-242, 2hgu:A, 224-251, 2hgu:A, 234-242, 2j01:A, 217-244, 2j01:A, 227-235, 2j03:A, 217-244, 2j03:A, 227-235, 2jl6:A, 217-244, 2jl6:A, 227-235, 2jl8:A, 217-244, 2jl8:A, 227-235, 2otj:9, 71-110, 2otj:9, 81-101, 2otl:9, 71-110, 2otl:9, 81-101, 2qex:9, 71-110, 2qex:9, 81-101, 2v47:A, 217-244, 2v47:A, 227-235, 2v49:A, 217-244, 2v49:A, 227-235, 3cc2:9, 74-107, 3cc2:9, 81-101, 3cc4:9, 74-107, 3cc4:9, 81-101, 3cc7:9, 74-107, 3cc7:9, 81-101, 3cce:9, 74-107, 3cce:9, 81-101, 3ccl:9, 74-107, 3ccl:9, 81-101, 3ccm:9, 74-107, 3ccm:9, 81-101, 3ccq:9, 74-107, 3ccq:9, 81-101, 3ccr:9, 74-107, 3ccr:9, 81-101, 3ccs:9, 74-107, 3ccs:9, 81-101, 3ccu:9, 74-107, 3ccu:9, 81-101, 3ccv:9, 74-107, 3ccv:9, 81-101, 3cd6:9, 74-107, 3cd6:9, 81-101, 3cma:9, 74-107, 3cma:9, 81-101, 3cme:9, 74-107, 3cme:9, 81-101, 3cpw:9, 71-110, 3cpw:9, 81-101, 3d5b:A, 220-247, 3d5b:A, 230-238, 3d5d:A, 220-247, 3d5d:A, 230-238