Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(5-4)-Internal loop cluster 65 (cutoff=1.0 Å with sequence identity)
Cluster size 84 structure(s)
Representative structure 1ibm:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence CUAAU-ACAA
Cluster members
CUAAU-ACAA
1fjg:A, 134-168, 1fjg:A, 143-158, 1hnw:A, 134-168, 1hnw:A, 143-158, 1hnx:A, 134-168, 1hnx:A, 143-158, 1hnz:A, 134-168, 1hnz:A, 143-158, 1hr0:A, 134-168, 1hr0:A, 143-158, 1i95:A, 137-171, 1i95:A, 146-161, 1i96:A, 137-171, 1i96:A, 146-161, 1ibk:A, 134-168, 1ibk:A, 143-158, 1ibl:A, 134-168, 1ibl:A, 143-158, 1ibm:A, 134-168, 1ibm:A, 143-158, 1j5e:A, 134-168, 1j5e:A, 143-158, 1n32:A, 134-168, 1n32:A, 143-158, 1n33:A, 134-168, 1n33:A, 143-158, 1n34:A, 137-165, 1n34:A, 143-158, 1pns:A, 139-173, 1pns:A, 148-163, 1s1h:A, 133-167, 1s1h:A, 142-157, 1xmo:A, 134-168, 1xmo:A, 143-158, 1xmq:A, 134-168, 1xmq:A, 143-158, 1xnq:A, 134-168, 1xnq:A, 143-158, 1xnr:A, 134-168, 1xnr:A, 143-158, 1yl4:A, 134-168, 1yl4:A, 143-158, 2b64:A, 134-168, 2b64:A, 143-158, 2b9m:A, 134-168, 2b9m:A, 143-158, 2b9o:A, 134-168, 2b9o:A, 143-158, 2e5l:A, 135-169, 2e5l:A, 144-159, 2f4v:A, 134-168, 2f4v:A, 143-158, 2hgi:A, 134-168, 2hgi:A, 143-158, 2hgp:A, 134-168, 2hgp:A, 143-158, 2hgr:A, 134-168, 2hgr:A, 143-158, 2hhh:A, 134-168, 2hhh:A, 143-158, 2qnh:y, 134-168, 2qnh:y, 143-158, 2uu9:A, 134-168, 2uu9:A, 143-158, 2uua:A, 134-168, 2uua:A, 143-158, 2uub:A, 134-168, 2uub:A, 143-158, 2uuc:A, 134-168, 2uuc:A, 143-158, 2uxb:A, 134-168, 2uxb:A, 143-158, 2uxc:A, 134-168, 2uxc:A, 143-158, 2uxd:A, 130-164, 2uxd:A, 139-154, 2vqe:A, 134-168, 2vqe:A, 143-158, 2vqf:A, 134-168, 2vqf:A, 143-158, 3d5a:A, 134-168, 3d5a:A, 143-158, 3d5c:A, 134-168, 3d5c:A, 143-158