Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(4-4)-Internal loop cluster 919 (cutoff=1.0 Å with sequence identity)
Cluster size 92 structure(s)
Representative structure 3cf5:X (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence GAAG-AUAA
Cluster members
GAAG-AUAA
1j5a:A, 2637-2669, 1j5a:A, 2643-2663, 1jzx:A, 2637-2669, 1jzx:A, 2643-2663, 1jzy:A, 2637-2669, 1jzy:A, 2643-2663, 1jzz:A, 2637-2669, 1jzz:A, 2643-2663, 1k01:A, 2637-2669, 1k01:A, 2643-2663, 1njm:0, 2629-2661, 1njm:0, 2635-2655, 1njn:0, 2629-2661, 1njn:0, 2635-2655, 1njo:0, 2629-2661, 1njo:0, 2635-2655, 1njp:0, 2629-2661, 1njp:0, 2635-2655, 1nkw:0, 2629-2661, 1nkw:0, 2635-2655, 1nwx:0, 2629-2661, 1nwx:0, 2635-2655, 1nwy:0, 2629-2661, 1nwy:0, 2635-2655, 1ond:0, 2628-2660, 1ond:0, 2634-2654, 1pnu:0, 2673-2705, 1pnu:0, 2679-2699, 1pny:0, 2673-2705, 1pny:0, 2679-2699, 1sm1:0, 2629-2661, 1sm1:0, 2635-2655, 1vsa:w, 2726-2760, 1vsa:w, 2733-2753, 1vsp:w, 2726-2760, 1vsp:w, 2733-2753, 1xbp:0, 2629-2661, 1xbp:0, 2635-2655, 1y69:0, 2629-2661, 1y69:0, 2635-2655, 1yl3:A, 2712-2746, 1yl3:A, 2719-2739, 2aar:0, 2629-2661, 2aar:0, 2635-2655, 2b66:A, 2654-2688, 2b66:A, 2661-2681, 2b9n:A, 2654-2688, 2b9n:A, 2661-2681, 2b9p:A, 2654-2688, 2b9p:A, 2661-2681, 2d3o:0, 2650-2682, 2d3o:0, 2656-2676, 2hgj:A, 2726-2760, 2hgj:A, 2733-2753, 2hgq:A, 2726-2760, 2hgq:A, 2733-2753, 2hgu:A, 2726-2760, 2hgu:A, 2733-2753, 2jl6:A, 2693-2727, 2jl6:A, 2700-2720, 2jl8:A, 2693-2727, 2jl8:A, 2700-2720, 2o43:A, 2629-2661, 2o43:A, 2635-2655, 2o44:A, 2629-2661, 2o44:A, 2635-2655, 2o45:A, 2617-2649, 2o45:A, 2623-2643, 2ogm:0, 2629-2661, 2ogm:0, 2635-2655, 2ogn:0, 2629-2661, 2ogn:0, 2635-2655, 2ogo:0, 2628-2660, 2ogo:0, 2634-2654, 2v47:A, 2609-2643, 2v47:A, 2616-2636, 2v49:A, 2609-2643, 2v49:A, 2616-2636, 2zjp:X, 2540-2572, 2zjp:X, 2546-2566, 2zjq:X, 2540-2572, 2zjq:X, 2546-2566, 2zjr:X, 2537-2569, 2zjr:X, 2543-2563, 3cf5:X, 2540-2572, 3cf5:X, 2546-2566, 3d5b:A, 2721-2755, 3d5b:A, 2728-2748, 3d5d:A, 2721-2755, 3d5d:A, 2728-2748, 3dll:X, 2540-2572, 3dll:X, 2546-2566