Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(3-3)-Internal loop cluster 1037 (cutoff=2.5 Å)
Cluster size 60 structure(s)
Representative structure 1voy:B (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NNN-NNN
Cluster members
AAG-CGG
2vhm:B, 1021-1102
AUA-CAG
1o15:A, 1-33
CAG-AUA
1o15:A, 1-33
CCC-GCG
1vor:B, 254-328, 1vou:B, 254-328, 1vow:B, 254-328, 1voy:B, 254-328, 1vp0:B, 254-328
CGG-AAG
2vhm:B, 1021-1102
GAU-GUC
1j5a:A, 987-1074, 1jzx:A, 987-1074, 1jzy:A, 987-1074, 1jzz:A, 987-1074, 1k01:A, 987-1074
GAU-UUC
2vhn:B, 869-892, 2vhn:B, 874-887
GCC-GGC
1n36:A, 900-1368
GCG-CCC
1vor:B, 254-328, 1vou:B, 254-328, 1vow:B, 254-328, 1voy:B, 254-328, 1vp0:B, 254-328
GGA-UCC
1voq:A, 131-222, 1voq:A, 136-217, 1vos:A, 131-222, 1vos:A, 136-217, 1vov:A, 131-222, 1vov:A, 136-217, 1vox:A, 131-222, 1vox:A, 136-217, 1voz:A, 131-222, 1voz:A, 136-217
GGC-GCC
1n36:A, 900-1368
GGG-UCU
1i97:A, 811-833
GUC-GAU
1j5a:A, 987-1074, 1jzx:A, 987-1074, 1jzy:A, 987-1074, 1jzz:A, 987-1074, 1k01:A, 987-1074
GUG-UGU
2gyc:0, 1328-1518
UCC-GGA
1voq:A, 131-222, 1voq:A, 136-217, 1vos:A, 131-222, 1vos:A, 136-217, 1vov:A, 131-222, 1vov:A, 136-217, 1vox:A, 131-222, 1vox:A, 136-217, 1voz:A, 131-222, 1voz:A, 136-217
UCG-UGG
2o45:A, 2007-2080
UCU-GGG
1i97:A, 811-833
UCU-UUU
1txs:A, 14-27, 1txs:A, 7-34
UGG-UCG
2o45:A, 2007-2080
UGU-GUG
2gyc:0, 1328-1518
UUC-GAU
2vhn:B, 869-892, 2vhn:B, 874-887
UUU-UCU
1txs:A, 14-27, 1txs:A, 7-34