Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(3-3)-Internal loop cluster 2273 (cutoff=1.5 Å)
Cluster size 60 structure(s)
Representative structure 2hgu:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence GRK-CRA
Cluster members
GAA-CGA
1e4p:A, 1-24, 1e4p:A, 8-17
GAC-CAA
1vs5:A, 1254-1273, 1vs5:A, 1259-1268, 1vs7:A, 1254-1273, 1vs7:A, 1259-1268, 2avy:A, 1254-1273, 2avy:A, 1259-1268, 2aw7:A, 1254-1273, 2aw7:A, 1259-1268, 2i2p:A, 1254-1273, 2i2p:A, 1259-1268, 2i2u:A, 1254-1273, 2i2u:A, 1259-1268, 2qal:A, 1254-1273, 2qal:A, 1259-1268, 2qan:A, 1254-1273, 2qan:A, 1259-1268, 2qb9:A, 1254-1273, 2qb9:A, 1259-1268, 2qbb:A, 1254-1273, 2qbb:A, 1259-1268, 2qbd:A, 1254-1273, 2qbd:A, 1259-1268, 2qbf:A, 1254-1273, 2qbf:A, 1259-1268, 2qbh:A, 1254-1273, 2qbh:A, 1259-1268, 2qbj:A, 1254-1273, 2qbj:A, 1259-1268, 2qou:A, 1254-1273, 2qou:A, 1259-1268, 2qow:A, 1254-1273, 2qow:A, 1259-1268, 2vho:A, 1254-1273, 2vho:A, 1259-1268, 2z4k:A, 1254-1273, 2z4k:A, 1259-1268, 2z4m:A, 1254-1273, 2z4m:A, 1259-1268, 3df1:A, 1254-1273, 3df1:A, 1259-1268, 3df3:A, 1254-1273, 3df3:A, 1259-1268
GGC-CGA
1njm:0, 2353-2381, 1njm:0, 2362-2372, 1njn:0, 2353-2381, 1njn:0, 2362-2372, 1njo:0, 2353-2381, 1njo:0, 2362-2372, 1njp:0, 2353-2381, 1njp:0, 2362-2372, 1pnu:0, 2397-2425, 1pnu:0, 2406-2416, 1pny:0, 2397-2425, 1pny:0, 2406-2416, 1sm1:0, 2353-2381, 1sm1:0, 2362-2372, 2hgu:A, 2449-2481, 2hgu:A, 2460-2470