Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(3-3)-Internal loop cluster 3454 (cutoff=1.0 Å with sequence identity)
Cluster size 152 structure(s)
Representative structure 2uxc:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence GUA-GAG
Cluster members
GUA-GAG
1fjg:A, 556-743, 1fjg:A, 563-736, 1hnw:A, 556-743, 1hnw:A, 563-736, 1hnx:A, 556-743, 1hnx:A, 563-736, 1hnz:A, 556-743, 1hnz:A, 563-736, 1hr0:A, 556-743, 1hr0:A, 563-736, 1i94:A, 559-746, 1i94:A, 566-739, 1i95:A, 559-746, 1i95:A, 566-739, 1i96:A, 559-746, 1i96:A, 566-739, 1ibk:A, 556-743, 1ibk:A, 563-736, 1ibl:A, 556-743, 1ibl:A, 563-736, 1ibm:A, 556-743, 1ibm:A, 563-736, 1j5e:A, 556-743, 1j5e:A, 563-736, 1n32:A, 556-743, 1n32:A, 563-736, 1n33:A, 556-743, 1n33:A, 563-736, 1n34:A, 556-743, 1n34:A, 563-736, 1n36:A, 556-743, 1n36:A, 563-736, 1pns:A, 570-757, 1pns:A, 577-750, 1pnx:A, 570-757, 1pnx:A, 577-750, 1s1h:A, 561-748, 1s1h:A, 568-741, 1vs6:B, 1339-1360, 1vs6:B, 1345-1354, 1vs8:B, 1339-1360, 1vs8:B, 1345-1354, 1xmo:A, 556-743, 1xmo:A, 563-736, 1xmq:A, 556-743, 1xmq:A, 563-736, 1xnq:A, 556-743, 1xnq:A, 563-736, 1xnr:A, 556-743, 1xnr:A, 563-736, 1yl4:A, 556-743, 1yl4:A, 563-736, 2aw4:B, 1339-1360, 2aw4:B, 1345-1354, 2awb:B, 1339-1360, 2awb:B, 1345-1354, 2b64:A, 556-743, 2b64:A, 563-736, 2b9m:A, 556-743, 2b9m:A, 563-736, 2b9o:A, 556-743, 2b9o:A, 563-736, 2e5l:A, 557-744, 2e5l:A, 564-737, 2f4v:A, 556-743, 2f4v:A, 563-736, 2hgi:A, 556-743, 2hgi:A, 563-736, 2hgp:A, 556-743, 2hgp:A, 563-736, 2hgr:A, 556-743, 2hgr:A, 563-736, 2hhh:A, 556-743, 2hhh:A, 563-736, 2i2t:B, 1339-1360, 2i2t:B, 1345-1354, 2i2v:B, 1339-1360, 2i2v:B, 1345-1354, 2j00:A, 556-743, 2j00:A, 563-736, 2j02:A, 556-743, 2j02:A, 563-736, 2j28:B, 1339-1360, 2j28:B, 1345-1354, 2jl5:A, 556-743, 2jl5:A, 563-736, 2jl7:A, 556-743, 2jl7:A, 563-736, 2qam:B, 1339-1360, 2qam:B, 1345-1354, 2qao:B, 1339-1360, 2qao:B, 1345-1354, 2qba:B, 1339-1360, 2qba:B, 1345-1354, 2qbc:B, 1339-1360, 2qbc:B, 1345-1354, 2qbe:B, 1339-1360, 2qbe:B, 1345-1354, 2qbg:B, 1339-1360, 2qbg:B, 1345-1354, 2qbi:B, 1339-1360, 2qbi:B, 1345-1354, 2qbk:B, 1339-1360, 2qbk:B, 1345-1354, 2qnh:y, 556-743, 2qnh:y, 563-736, 2qov:B, 1339-1360, 2qov:B, 1345-1354, 2qox:B, 1339-1360, 2qox:B, 1345-1354, 2qoz:B, 1339-1360, 2qoz:B, 1345-1354, 2qp1:B, 1339-1360, 2qp1:B, 1345-1354, 2uu9:A, 556-743, 2uu9:A, 563-736, 2uua:A, 556-743, 2uua:A, 563-736, 2uub:A, 556-743, 2uub:A, 563-736, 2uuc:A, 556-743, 2uuc:A, 563-736, 2uxb:A, 556-743, 2uxb:A, 563-736, 2uxc:A, 556-743, 2uxc:A, 563-736, 2uxd:A, 534-721, 2uxd:A, 541-714, 2v46:A, 556-743, 2v46:A, 563-736, 2v48:A, 556-743, 2v48:A, 563-736, 2vqe:A, 556-743, 2vqe:A, 563-736, 2vqf:A, 556-743, 2vqf:A, 563-736, 2z4l:B, 1339-1360, 2z4l:B, 1345-1354, 2z4n:B, 1339-1360, 2z4n:B, 1345-1354, 3bbn:A, 520-707, 3bbn:A, 527-700, 3bbx:B, 1420-1441, 3bbx:B, 1426-1435, 3d5a:A, 556-743, 3d5a:A, 563-736, 3d5c:A, 556-743, 3d5c:A, 563-736, 3df2:B, 1339-1360, 3df2:B, 1345-1354, 3df4:B, 1339-1360, 3df4:B, 1345-1354