Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(3-3)-Internal loop cluster 2388 (cutoff=1.0 Å with sequence identity)
Cluster size 212 structure(s)
Representative structure 2i2v:B (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence CAA-GAC
Cluster members
CAA-GAC
1ffk:0, 2308-2338, 1ffk:0, 2318-2328, 1ffz:A, 334-364, 1ffz:A, 344-354, 1fg0:A, 334-364, 1fg0:A, 344-354, 1jj2:0, 2358-2388, 1jj2:0, 2368-2378, 1k73:A, 2358-2388, 1k73:A, 2368-2378, 1k8a:A, 2358-2388, 1k8a:A, 2368-2378, 1k9m:A, 2358-2388, 1k9m:A, 2368-2378, 1kc8:A, 2358-2388, 1kc8:A, 2368-2378, 1kd1:A, 2358-2388, 1kd1:A, 2368-2378, 1kqs:0, 2358-2388, 1kqs:0, 2368-2378, 1m1k:A, 2358-2388, 1m1k:A, 2368-2378, 1m90:A, 2358-2388, 1m90:A, 2368-2378, 1n8r:A, 2358-2388, 1n8r:A, 2368-2378, 1nji:A, 2358-2388, 1nji:A, 2368-2378, 1q7y:A, 2358-2388, 1q7y:A, 2368-2378, 1q81:A, 2358-2388, 1q81:A, 2368-2378, 1q82:A, 2358-2388, 1q82:A, 2368-2378, 1q86:A, 2358-2388, 1q86:A, 2368-2378, 1qvf:0, 2358-2388, 1qvf:0, 2368-2378, 1qvg:0, 2358-2388, 1qvg:0, 2368-2378, 1s1i:3, 2675-2705, 1s1i:3, 2685-2695, 1s72:0, 2358-2388, 1s72:0, 2368-2378, 1vq4:0, 2358-2388, 1vq4:0, 2368-2378, 1vq5:0, 2358-2388, 1vq5:0, 2368-2378, 1vq6:0, 2358-2388, 1vq6:0, 2368-2378, 1vq7:0, 2358-2388, 1vq7:0, 2368-2378, 1vq8:0, 2358-2388, 1vq8:0, 2368-2378, 1vq9:0, 2358-2388, 1vq9:0, 2368-2378, 1vqk:0, 2358-2388, 1vqk:0, 2368-2378, 1vql:0, 2358-2388, 1vql:0, 2368-2378, 1vqm:0, 2358-2388, 1vqm:0, 2368-2378, 1vqn:0, 2358-2388, 1vqn:0, 2368-2378, 1vqo:0, 2358-2388, 1vqo:0, 2368-2378, 1vqp:0, 2358-2388, 1vqp:0, 2368-2378, 1vs5:A, 1254-1273, 1vs5:A, 1259-1268, 1vs6:B, 2408-2436, 1vs6:B, 2417-2427, 1vs7:A, 1254-1273, 1vs7:A, 1259-1268, 1vs8:B, 2408-2436, 1vs8:B, 2417-2427, 1w2b:0, 2359-2387, 1w2b:0, 2368-2378, 1yhq:0, 2358-2388, 1yhq:0, 2368-2378, 1yi2:0, 2358-2388, 1yi2:0, 2368-2378, 1yij:0, 2358-2388, 1yij:0, 2368-2378, 1yit:0, 2358-2388, 1yit:0, 2368-2378, 1yj9:0, 2358-2388, 1yj9:0, 2368-2378, 1yjn:0, 2358-2388, 1yjn:0, 2368-2378, 1yjw:0, 2358-2388, 1yjw:0, 2368-2378, 2avy:A, 1254-1273, 2avy:A, 1259-1268, 2aw4:B, 2408-2436, 2aw4:B, 2417-2427, 2aw7:A, 1254-1273, 2aw7:A, 1259-1268, 2awb:B, 2408-2436, 2awb:B, 2417-2427, 2gya:0, 2323-2351, 2gya:0, 2332-2342, 2i2p:A, 1254-1273, 2i2p:A, 1259-1268, 2i2t:B, 2407-2437, 2i2t:B, 2417-2427, 2i2u:A, 1254-1273, 2i2u:A, 1259-1268, 2i2v:B, 2407-2437, 2i2v:B, 2417-2427, 2j28:B, 2408-2436, 2j28:B, 2417-2427, 2otj:0, 2358-2388, 2otj:0, 2368-2378, 2otl:0, 2358-2388, 2otl:0, 2368-2378, 2qa4:0, 2363-2393, 2qa4:0, 2373-2383, 2qal:A, 1254-1273, 2qal:A, 1259-1268, 2qam:B, 2408-2436, 2qam:B, 2417-2427, 2qan:A, 1254-1273, 2qan:A, 1259-1268, 2qao:B, 2408-2436, 2qao:B, 2417-2427, 2qb9:A, 1254-1273, 2qb9:A, 1259-1268, 2qba:B, 2408-2436, 2qba:B, 2417-2427, 2qbb:A, 1254-1273, 2qbb:A, 1259-1268, 2qbc:B, 2408-2436, 2qbc:B, 2417-2427, 2qbd:A, 1254-1273, 2qbd:A, 1259-1268, 2qbe:B, 2408-2436, 2qbe:B, 2417-2427, 2qbf:A, 1254-1273, 2qbf:A, 1259-1268, 2qbg:B, 2408-2436, 2qbg:B, 2417-2427, 2qbh:A, 1254-1273, 2qbh:A, 1259-1268, 2qbi:B, 2408-2436, 2qbi:B, 2417-2427, 2qbj:A, 1254-1273, 2qbj:A, 1259-1268, 2qbk:B, 2408-2436, 2qbk:B, 2417-2427, 2qex:0, 2358-2388, 2qex:0, 2368-2378, 2qou:A, 1254-1273, 2qou:A, 1259-1268, 2qov:B, 2407-2437, 2qov:B, 2417-2427, 2qow:A, 1254-1273, 2qow:A, 1259-1268, 2qox:B, 2408-2436, 2qox:B, 2417-2427, 2qoy:A, 1254-1273, 2qoy:A, 1259-1268, 2qp0:A, 1254-1273, 2qp0:A, 1259-1268, 2vhp:A, 1254-1273, 2vhp:A, 1259-1268, 2z4k:A, 1254-1273, 2z4k:A, 1259-1268, 2z4m:A, 1254-1273, 2z4m:A, 1259-1268, 3bbx:B, 2691-2719, 3bbx:B, 2700-2710, 3cc2:0, 2358-2388, 3cc2:0, 2368-2378, 3cc4:0, 2358-2388, 3cc4:0, 2368-2378, 3cc7:0, 2358-2388, 3cc7:0, 2368-2378, 3cce:0, 2358-2388, 3cce:0, 2368-2378, 3ccj:0, 2358-2388, 3ccj:0, 2368-2378, 3ccl:0, 2358-2388, 3ccl:0, 2368-2378, 3ccm:0, 2358-2388, 3ccm:0, 2368-2378, 3ccq:0, 2358-2388, 3ccq:0, 2368-2378, 3ccr:0, 2358-2388, 3ccr:0, 2368-2378, 3ccs:0, 2358-2388, 3ccs:0, 2368-2378, 3ccu:0, 2358-2388, 3ccu:0, 2368-2378, 3ccv:0, 2358-2388, 3ccv:0, 2368-2378, 3cd6:0, 2358-2388, 3cd6:0, 2368-2378, 3cma:0, 2358-2388, 3cma:0, 2368-2378, 3cme:0, 2358-2388, 3cme:0, 2368-2378, 3cpw:0, 2358-2388, 3cpw:0, 2368-2378, 3df1:A, 1254-1273, 3df1:A, 1259-1268, 3df2:B, 2408-2436, 3df2:B, 2417-2427, 3df3:A, 1254-1273, 3df3:A, 1259-1268, 3df4:B, 2408-2436, 3df4:B, 2417-2427