Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(3-3)-Internal loop cluster 1863 (cutoff=1.0 Å)
Cluster size 52 structure(s)
Representative structure 1yl4:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NNN-NNN
Cluster members
AAC-CAA
2gya:0, 808-835, 2gya:0, 815-828, 2gyc:0, 810-833, 2gyc:0, 815-828
ACA-GCU
1mfy:A, 11-22, 1mfy:A, 5-28
ACU-GGU
1z58:2, 1708-1744, 1z58:2, 1713-1739
CAA-AAC
2gya:0, 808-835, 2gya:0, 815-828, 2gyc:0, 810-833, 2gyc:0, 815-828
CCA-UGG
1n34:A, 1218-1273, 1n34:A, 1223-1268, 2vho:A, 980-1217, 2vho:A, 985-1212
CCC-GUG
2jl5:A, 173-196, 2jl5:A, 179-190, 2jl7:A, 173-196, 2jl7:A, 179-190
CCG-UGU
1i97:A, 178-197, 1i97:A, 183-192, 1yl4:A, 173-196, 1yl4:A, 180-189
CGA-UCC
1j5a:A, 1156-1200, 1jzx:A, 1156-1200, 1jzz:A, 1156-1200, 2o43:A, 1146-1194
CGG-UCG
2j01:A, 2015-2079, 2om7:J, 5-69
GCU-ACA
1mfy:A, 11-22, 1mfy:A, 5-28
GGU-ACU
1z58:2, 1708-1744, 1z58:2, 1713-1739
GUG-CCC
2jl5:A, 173-196, 2jl5:A, 179-190, 2jl7:A, 173-196, 2jl7:A, 179-190
UCC-CGA
1j5a:A, 1156-1200, 1jzx:A, 1156-1200, 1jzz:A, 1156-1200, 2o43:A, 1146-1194
UCG-CGG
2j01:A, 2015-2079, 2om7:J, 5-69
UGG-CCA
1n34:A, 1218-1273, 1n34:A, 1223-1268, 2vho:A, 980-1217, 2vho:A, 985-1212
UGU-CCG
1i97:A, 178-197, 1i97:A, 183-192, 1yl4:A, 173-196, 1yl4:A, 180-189