Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(3-3)-Internal loop cluster 3431 (cutoff=0.5 Å)
Cluster size 134 structure(s)
Representative structure 2uub:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence SAG-GYA
Cluster members
CAG-GCA
1vs5:A, 573-760, 1vs5:A, 580-753, 1vs7:A, 573-760, 1vs7:A, 580-753, 2avy:A, 573-760, 2avy:A, 580-753, 2aw7:A, 573-760, 2aw7:A, 580-753, 2gy9:A, 543-730, 2gy9:A, 550-723, 2i2p:A, 573-760, 2i2p:A, 580-753, 2i2u:A, 573-760, 2i2u:A, 580-753, 2qal:A, 573-760, 2qal:A, 580-753, 2qan:A, 573-760, 2qan:A, 580-753, 2qb9:A, 573-760, 2qb9:A, 580-753, 2qbb:A, 573-760, 2qbb:A, 580-753, 2qbd:A, 573-760, 2qbd:A, 580-753, 2qbf:A, 573-760, 2qbf:A, 580-753, 2qbh:A, 573-760, 2qbh:A, 580-753, 2qbj:A, 573-760, 2qbj:A, 580-753, 2qou:A, 573-760, 2qou:A, 580-753, 2qow:A, 573-760, 2qow:A, 580-753, 2qoy:A, 573-760, 2qoy:A, 580-753, 2qp0:A, 573-760, 2qp0:A, 580-753, 2z4k:A, 573-760, 2z4k:A, 580-753, 2z4m:A, 573-760, 2z4m:A, 580-753, 3df1:A, 573-760, 3df1:A, 580-753, 3df3:A, 573-760, 3df3:A, 580-753
GAG-GUA
1fjg:A, 556-743, 1fjg:A, 563-736, 1hnw:A, 556-743, 1hnw:A, 563-736, 1hnx:A, 556-743, 1hnx:A, 563-736, 1hnz:A, 556-743, 1hnz:A, 563-736, 1hr0:A, 556-743, 1hr0:A, 563-736, 1i94:A, 559-746, 1i94:A, 566-739, 1i95:A, 559-746, 1i95:A, 566-739, 1i96:A, 559-746, 1i96:A, 566-739, 1ibk:A, 556-743, 1ibk:A, 563-736, 1ibl:A, 556-743, 1ibl:A, 563-736, 1ibm:A, 556-743, 1ibm:A, 563-736, 1j5e:A, 556-743, 1j5e:A, 563-736, 1n32:A, 556-743, 1n32:A, 563-736, 1n33:A, 556-743, 1n33:A, 563-736, 1n34:A, 556-743, 1n34:A, 563-736, 1n36:A, 556-743, 1n36:A, 563-736, 1pns:A, 570-757, 1pns:A, 577-750, 1pnx:A, 570-757, 1pnx:A, 577-750, 1s1h:A, 561-748, 1s1h:A, 568-741, 1xmo:A, 556-743, 1xmo:A, 563-736, 1xmq:A, 556-743, 1xmq:A, 563-736, 1xnq:A, 556-743, 1xnq:A, 563-736, 1xnr:A, 556-743, 1xnr:A, 563-736, 2e5l:A, 557-744, 2e5l:A, 564-737, 2f4v:A, 556-743, 2f4v:A, 563-736, 2hhh:A, 556-743, 2hhh:A, 563-736, 2j00:A, 556-743, 2j00:A, 563-736, 2j02:A, 556-743, 2j02:A, 563-736, 2jl5:A, 556-743, 2jl5:A, 563-736, 2jl7:A, 556-743, 2jl7:A, 563-736, 2uu9:A, 556-743, 2uu9:A, 563-736, 2uua:A, 556-743, 2uua:A, 563-736, 2uub:A, 556-743, 2uub:A, 563-736, 2uuc:A, 556-743, 2uuc:A, 563-736, 2uxb:A, 556-743, 2uxb:A, 563-736, 2uxc:A, 556-743, 2uxc:A, 563-736, 2uxd:A, 534-721, 2uxd:A, 541-714, 2v46:A, 556-743, 2v46:A, 563-736, 2v48:A, 556-743, 2v48:A, 563-736, 2vqe:A, 556-743, 2vqe:A, 563-736, 2vqf:A, 556-743, 2vqf:A, 563-736, 3bbn:A, 520-707, 3bbn:A, 527-700, 3d5a:A, 556-743, 3d5a:A, 563-736, 3d5c:A, 556-743, 3d5c:A, 563-736