Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(3-2)-Internal loop cluster 1029 (cutoff=2.0 Å)
Cluster size 55 structure(s)
Representative structure 3d0x:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NNN-NN
Cluster members
AGA-UC
2gy9:A, 621-717, 2gyb:A, 621-717
CCC-GG
1fka:A, 626-722
CGC-CA
1njm:0, 811-876, 1njn:0, 811-876, 1njo:0, 811-876, 1njp:0, 811-876, 1nkw:0, 811-876, 1nwx:0, 811-876, 1nwy:0, 811-876, 1ond:0, 811-876, 1p9x:0, 789-852, 1pnu:0, 812-891, 1pny:0, 812-891, 1sm1:0, 812-875, 1xbp:0, 812-875, 2aar:0, 811-876, 2d3o:0, 811-876, 2o43:A, 812-875, 2o44:A, 812-875, 2zjp:X, 789-854, 2zjq:X, 789-854, 2zjr:X, 789-851, 3cf5:X, 789-854, 3dll:X, 789-854
CGG-AG
1xbp:0, 1994-2135
GUA-GC
2j01:A, 281-385, 2j03:A, 281-385, 2v47:A, 281-385, 2v49:A, 281-385
UAA-GU
2gya:0, 2678-2715, 2gyc:0, 2678-2715
UCU-GU
1yl4:A, 1036-1176, 1yl4:A, 1041-1170, 2b64:A, 1036-1176, 2b64:A, 1041-1170, 2b9m:A, 1036-1176, 2b9m:A, 1041-1170, 2b9o:A, 1036-1176, 2b9o:A, 1041-1170, 2hgi:A, 1036-1176, 2hgi:A, 1041-1170, 2hgp:A, 1036-1176, 2hgp:A, 1041-1170, 2hgr:A, 1036-1176, 2hgr:A, 1041-1170
UGC-GG
1vor:B, 2768-2814, 1vou:B, 2768-2814, 1vow:B, 2768-2814, 1voy:B, 2768-2814, 1vp0:B, 2768-2814
UUG-GA
3d0u:A, 79-110, 3d0u:A, 84-104, 3d0x:A, 79-110, 3d0x:A, 84-104