Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(2-4)-Internal loop cluster 289 (cutoff=1.5 Å)
Cluster size 62 structure(s)
Representative structure 2vqe:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence WH-MRAY
Cluster members
AA-GGAC
1vs5:A, 1249-1280, 1vs7:A, 1249-1280, 2avy:A, 1249-1280, 2aw7:A, 1249-1280, 2i2p:A, 1249-1280, 2i2u:A, 1249-1280, 2qal:A, 1249-1280, 2qan:A, 1249-1280, 2qb9:A, 1249-1280, 2qbb:A, 1249-1280, 2qbd:A, 1249-1280, 2qbf:A, 1249-1280, 2qbh:A, 1249-1280, 2qbj:A, 1249-1280, 2qou:A, 1249-1280, 2qow:A, 1249-1280, 2qoy:A, 1249-1280, 2qp0:A, 1249-1280, 2vho:A, 1249-1280, 2z4k:A, 1249-1280, 2z4m:A, 1249-1280, 3df1:A, 1249-1280, 3df3:A, 1249-1280
AU-UAAU
1fjg:A, 1230-1261, 1hnw:A, 1230-1261, 1hnx:A, 1230-1261, 1hnz:A, 1230-1261, 1hr0:A, 1230-1261, 1i94:A, 1233-1264, 1i95:A, 1233-1264, 1i96:A, 1233-1264, 1ibk:A, 1230-1261, 1ibl:A, 1230-1261, 1j5e:A, 1230-1261, 1n32:A, 1230-1261, 1pns:A, 1246-1277, 1pnx:A, 1246-1277, 1s1h:A, 1231-1262, 1xmo:A, 1225-1256, 1xmq:A, 1225-1256, 1xnq:A, 1225-1256, 1xnr:A, 1225-1256, 1yl4:A, 1230-1261, 2b64:A, 1230-1261, 2b9m:A, 1230-1261, 2b9o:A, 1230-1261, 2e5l:A, 1231-1262, 2hgi:A, 1230-1261, 2hgp:A, 1230-1261, 2hgr:A, 1230-1261, 2hhh:A, 1230-1261, 2uu9:A, 1230-1261, 2uua:A, 1230-1261, 2uub:A, 1230-1261, 2uuc:A, 1230-1261, 2uxc:A, 1230-1261, 2uxd:A, 1208-1239, 2vqe:A, 1230-1261, 2vqf:A, 1230-1261, 3d5a:A, 1230-1261, 3d5c:A, 1230-1261
UC-UAAC
3bbn:A, 1196-1227