Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(2-3)-Internal loop cluster 286 (cutoff=1.5 Å)
Cluster size 69 structure(s)
Representative structure 1vqo:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence MV-BVV
Cluster members
GC-GAC
3bbo:A, 717-741, 3bbo:A, 722-737
GC-GCA
2d3o:0, 1960-2538, 2d3o:0, 1969-2530
UA-GGG
1ffk:0, 1996-2473, 1ffz:A, 23-498, 1fg0:A, 23-498, 1jj2:0, 2046-2523, 1k73:A, 2046-2523, 1k8a:A, 2046-2523, 1k9m:A, 2046-2523, 1kc8:A, 2046-2523, 1kd1:A, 2046-2523, 1kqs:0, 2046-2523, 1m1k:A, 2046-2523, 1m90:A, 2046-2523, 1n8r:A, 2046-2523, 1nji:A, 2046-2523, 1q7y:A, 2046-2523, 1q81:A, 2046-2523, 1q82:A, 2046-2523, 1q86:A, 2046-2523, 1qvf:0, 2046-2523, 1qvg:0, 2046-2523, 1s1i:3, 2232-2840, 1s72:0, 2046-2523, 1vq4:0, 2046-2523, 1vq5:0, 2046-2523, 1vq6:0, 2046-2523, 1vq7:0, 2046-2523, 1vq8:0, 2046-2523, 1vq9:0, 2046-2523, 1vqk:0, 2046-2523, 1vql:0, 2046-2523, 1vqm:0, 2046-2523, 1vqn:0, 2046-2523, 1vqo:0, 2046-2523, 1vqp:0, 2046-2523, 1w2b:0, 2046-2523, 1yhq:0, 2046-2523, 1yi2:0, 2046-2523, 1yij:0, 2046-2523, 1yit:0, 2046-2523, 1yj9:0, 2046-2523, 1yjn:0, 2046-2523, 1yjw:0, 2046-2523, 2otj:0, 2046-2523, 2otl:0, 2046-2523, 2qa4:0, 2051-2528, 2qex:0, 2046-2523, 3cc2:0, 2046-2523, 3cc4:0, 2046-2523, 3cc7:0, 2046-2523, 3cce:0, 2046-2523, 3ccj:0, 2046-2523, 3ccl:0, 2046-2523, 3ccm:0, 2046-2523, 3ccq:0, 2046-2523, 3ccr:0, 2046-2523, 3ccs:0, 2046-2523, 3ccu:0, 2046-2523, 3ccv:0, 2046-2523, 3cd6:0, 2046-2523, 3cma:0, 2046-2523, 3cme:0, 2046-2523, 3cpw:0, 2046-2523
UA-UCA
1voy:B, 952-1124
UG-CAA
2gya:0, 1931-2482, 2gya:0, 1936-2478