Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(2-2)-Internal loop cluster 1131 (cutoff=1.5 Å)
Cluster size 107 structure(s)
Representative structure 2hgp:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence VA-VA
Cluster members
AA-CA
2zjq:X, 1402-1446, 2zjq:X, 1406-1442, 3dll:X, 1402-1446, 3dll:X, 1406-1442
CA-AA
3dll:X, 1402-1446, 3dll:X, 1406-1442
CA-GA
2b64:A, 1235-1254, 2b64:A, 1239-1250, 2b9m:A, 1235-1254, 2b9m:A, 1239-1250, 2b9o:A, 1235-1254, 2b9o:A, 1239-1250, 2f4v:A, 1235-1254, 2f4v:A, 1239-1250, 2ow8:y, 1235-1254, 2ow8:y, 1239-1250, 2qnh:y, 1235-1254, 2qnh:y, 1239-1250
GA-CA
1xnr:A, 1230-1249, 1xnr:A, 1234-1245, 1yl4:A, 1235-1254, 1yl4:A, 1239-1250, 2b64:A, 1235-1254, 2b64:A, 1239-1250, 2b9m:A, 1235-1254, 2b9m:A, 1239-1250, 2b9o:A, 1235-1254, 2b9o:A, 1239-1250, 2f4v:A, 1235-1254, 2f4v:A, 1239-1250, 2hgi:A, 1235-1254, 2hgi:A, 1239-1250, 2hgp:A, 1235-1254, 2hgp:A, 1239-1250, 2ow8:y, 1235-1254, 2ow8:y, 1239-1250, 2qnh:y, 1235-1254, 2qnh:y, 1239-1250, 3d5a:A, 1235-1254, 3d5a:A, 1239-1250, 3d5c:A, 1235-1254, 3d5c:A, 1239-1250
GA-GA
1hr0:A, 1392-1459, 1njm:0, 2239-2262, 1njm:0, 2245-2256, 1njn:0, 2239-2262, 1njn:0, 2245-2256, 1njo:0, 2239-2262, 1njo:0, 2245-2256, 1njp:0, 2239-2262, 1njp:0, 2245-2256, 1nkw:0, 2239-2262, 1nkw:0, 2245-2256, 1nwx:0, 2239-2262, 1nwx:0, 2245-2256, 1nwy:0, 2239-2262, 1nwy:0, 2245-2256, 1ond:0, 2238-2261, 1ond:0, 2244-2255, 1pns:A, 1408-1488, 1pns:A, 1408-1488, 1pnu:0, 2283-2306, 1pnu:0, 2289-2300, 1pnu:0, 2283-2306, 1pnu:0, 2289-2300, 1pnx:A, 1408-1485, 1pnx:A, 1408-1485, 1pny:0, 2283-2306, 1pny:0, 2289-2300, 1pny:0, 2283-2306, 1pny:0, 2289-2300, 1vsa:w, 2337-2360, 1vsa:w, 2343-2354, 1vsa:w, 2337-2360, 1vsa:w, 2343-2354, 1vsp:w, 2337-2360, 1vsp:w, 2343-2354, 1vsp:w, 2337-2360, 1vsp:w, 2343-2354, 1y69:0, 2239-2262, 1y69:0, 2245-2256, 1yl3:A, 2323-2346, 1yl3:A, 2329-2340, 2b66:A, 2267-2286, 2b66:A, 2271-2282, 2b66:A, 2267-2286, 2b66:A, 2271-2282, 2b9n:A, 2267-2286, 2b9n:A, 2271-2282, 2b9n:A, 2267-2286, 2b9n:A, 2271-2282, 2b9p:A, 2267-2286, 2b9p:A, 2271-2282, 2b9p:A, 2267-2286, 2b9p:A, 2271-2282, 2hgj:A, 2337-2360, 2hgj:A, 2343-2354, 2hgj:A, 2337-2360, 2hgj:A, 2343-2354, 2hgq:A, 2337-2360, 2hgq:A, 2343-2354, 2hgq:A, 2337-2360, 2hgq:A, 2343-2354, 2hgu:A, 2337-2360, 2hgu:A, 2343-2354, 2ogm:0, 2239-2262, 2ogm:0, 2245-2256