Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(2-2)-Internal loop cluster 988 (cutoff=1.5 Å)
Cluster size 59 structure(s)
Representative structure 2b64:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence MV-MV
Cluster members
GA-GA
1njm:0, 2239-2262, 1njm:0, 2245-2256, 1njn:0, 2239-2262, 1njn:0, 2245-2256, 1njo:0, 2239-2262, 1njo:0, 2245-2256, 1njp:0, 2239-2262, 1njp:0, 2245-2256, 1voq:A, 1408-1478, 1vos:A, 1408-1478, 1vov:A, 1408-1478, 1vox:A, 1408-1478, 1voz:A, 1408-1478, 1vs5:A, 1410-1482, 1vs5:A, 1410-1482, 2avy:A, 1410-1482, 2avy:A, 1410-1482, 2b64:A, 1392-1459, 2b64:A, 1392-1459, 2b9m:A, 1392-1459, 2b9m:A, 1392-1459, 2b9o:A, 1392-1459, 2b9o:A, 1392-1459, 2i2p:A, 1410-1482, 2i2p:A, 1410-1482, 2i2u:A, 1410-1482, 2i2u:A, 1410-1482, 2j00:A, 1392-1459, 2j00:A, 1392-1459, 2j02:A, 1392-1459, 2j02:A, 1392-1459, 2jl5:A, 1392-1459, 2jl5:A, 1392-1459, 2jl7:A, 1392-1459, 2jl7:A, 1392-1459, 2om7:C, 14-81, 2om7:C, 14-81, 2ow8:y, 1392-1459, 2ow8:y, 1392-1459, 2qal:A, 1410-1482, 2qal:A, 1410-1482, 2qbf:A, 1410-1482, 2qbf:A, 1410-1482, 2qbj:A, 1410-1482, 2qbj:A, 1410-1482, 2qnh:y, 1392-1459, 2qnh:y, 1392-1459, 2z4k:A, 1410-1482, 2z4k:A, 1410-1482, 2z4m:A, 1410-1482, 2z4m:A, 1410-1482, 3d5a:A, 1392-1459, 3d5a:A, 1392-1459, 3d5c:A, 1392-1459, 3d5c:A, 1392-1459
GG-UC
1t28:A, 1-34, 1t28:A, 5-30
UC-GG
1t28:A, 1-34, 1t28:A, 5-30