Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(2-2)-Internal loop cluster 855 (cutoff=1.0 Å)
Cluster size 84 structure(s)
Representative structure 1xmq:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence RA-SA
Cluster members
AA-CA
2zjq:X, 1402-1446, 2zjq:X, 1406-1442, 2zjr:X, 1399-1443, 2zjr:X, 1403-1439
GA-CA
1fjg:A, 1235-1254, 1fjg:A, 1239-1250, 1hnw:A, 1235-1254, 1hnw:A, 1239-1250, 1hnx:A, 1235-1254, 1hnx:A, 1239-1250, 1hnz:A, 1235-1254, 1hnz:A, 1239-1250, 1hr0:A, 1235-1254, 1hr0:A, 1239-1250, 1i95:A, 1238-1257, 1i95:A, 1242-1253, 1i96:A, 1238-1257, 1i96:A, 1242-1253, 1ibk:A, 1235-1254, 1ibk:A, 1239-1250, 1ibl:A, 1235-1254, 1ibl:A, 1239-1250, 1j5e:A, 1235-1254, 1j5e:A, 1239-1250, 1n32:A, 1235-1254, 1n32:A, 1239-1250, 1pns:A, 1251-1270, 1pns:A, 1255-1266, 1pnx:A, 1251-1270, 1pnx:A, 1255-1266, 1s1h:A, 1236-1255, 1s1h:A, 1240-1251, 1xmo:A, 1230-1249, 1xmo:A, 1234-1245, 1xmq:A, 1230-1249, 1xmq:A, 1234-1245, 1xnq:A, 1230-1249, 1xnq:A, 1234-1245, 1xnr:A, 1230-1249, 1xnr:A, 1234-1245, 1yl4:A, 1235-1254, 1yl4:A, 1239-1250, 2e5l:A, 1236-1255, 2e5l:A, 1240-1251, 2f4v:A, 1235-1254, 2f4v:A, 1239-1250, 2hgi:A, 1235-1254, 2hgi:A, 1239-1250, 2hhh:A, 1235-1254, 2hhh:A, 1239-1250, 2ow8:y, 1235-1254, 2ow8:y, 1239-1250, 2qnh:y, 1235-1254, 2qnh:y, 1239-1250, 2uu9:A, 1235-1254, 2uu9:A, 1239-1250, 2uua:A, 1235-1254, 2uua:A, 1239-1250, 2uub:A, 1235-1254, 2uub:A, 1239-1250, 2uuc:A, 1235-1254, 2uuc:A, 1239-1250, 2uxc:A, 1235-1254, 2uxc:A, 1239-1250, 2vqe:A, 1235-1254, 2vqe:A, 1239-1250, 2vqf:A, 1235-1254, 2vqf:A, 1239-1250, 3d5a:A, 1235-1254, 3d5a:A, 1239-1250, 3d5c:A, 1235-1254, 3d5c:A, 1239-1250
GA-GA
1nkw:0, 2239-2262, 1nkw:0, 2245-2256, 1nwx:0, 2239-2262, 1nwx:0, 2245-2256, 1nwy:0, 2239-2262, 1nwy:0, 2245-2256, 1ond:0, 2238-2261, 1ond:0, 2244-2255, 1sm1:0, 2239-2262, 1sm1:0, 2245-2256, 2d3o:0, 2260-2283, 2d3o:0, 2266-2277