Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(006)-Hairpin cluster 1422 (cutoff=2.0 Å)
Cluster size 47 structure(s)
Representative structure 3d2x:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence DMRRND
Cluster members
AUAAUG
2gdi:X, 57-64, 2gdi:Y, 57-64, 2hoj:A, 57-64, 2hok:A, 59-66, 2hol:A, 57-64, 2hom:A, 58-65, 2hoo:A, 58-65
GUAACA
2jq7:B, 42-49
GUAAUG
2cky:A, 54-61, 2cky:B, 54-61, 3d2g:A, 54-61, 3d2v:A, 54-61, 3d2v:B, 54-61, 3d2x:A, 54-61, 3d2x:B, 54-61
UGGAAA
1z58:2, 273-280, 2o43:A, 276-283, 2ogo:0, 275-282
UGGGAA
1vsp:w, 330-337, 1yl3:A, 329-336, 2b66:A, 329-336, 2b9n:A, 329-336, 2b9p:A, 329-336, 2hgj:A, 329-336, 2hgq:A, 329-336, 2hgu:A, 329-336, 3d5b:A, 325-332, 3d5d:A, 325-332
UUAAGU
1fjg:A, 1067-1074, 1i94:A, 1070-1077, 1i96:A, 1070-1077, 1vs7:A, 1085-1092, 1yl4:A, 1067-1074, 2aw7:A, 1085-1092, 2f4v:A, 1067-1074, 2hgr:A, 1067-1074, 2hhh:A, 1067-1074, 2i2p:A, 1085-1092, 2i2u:A, 1085-1092, 2qb9:A, 1085-1092, 2qbb:A, 1085-1092, 2qbd:A, 1085-1092, 2qbf:A, 1085-1092, 2qbh:A, 1085-1092, 2qbj:A, 1085-1092, 2qou:A, 1085-1092, 3bbn:A, 1033-1040