Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(2-2)-Internal loop cluster 89 (cutoff=1.0 Å)
Cluster size 47 structure(s)
Representative structure 1i97:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence VD-RR
Cluster members
AA-GG
1vs6:B, 1018-1105, 1vs8:B, 1018-1105, 2aw4:B, 1018-1105, 2awb:B, 1018-1105, 2i2t:B, 1018-1105, 2i2v:B, 1018-1105, 2j28:B, 1018-1105, 2qam:B, 1018-1105, 2qao:B, 1018-1105, 2qba:B, 1018-1105, 2qbc:B, 1018-1105, 2qbe:B, 1018-1105, 2qbg:B, 1018-1105, 2qbi:B, 1018-1105, 2qbk:B, 1018-1105, 2qov:B, 1018-1105, 2qox:B, 1018-1105, 2qoz:B, 1018-1105, 2qp1:B, 1018-1105, 2z4l:B, 1018-1105, 2z4n:B, 1018-1105, 3bbx:B, 1096-1183, 3df2:B, 1018-1105, 3df4:B, 1018-1105
CU-GG
1i97:A, 984-999, 1i97:A, 988-995
GG-AA
1vs6:B, 1018-1105, 1vs8:B, 1018-1105, 2aw4:B, 1018-1105, 2awb:B, 1018-1105, 2i2t:B, 1018-1105, 2i2v:B, 1018-1105, 2j28:B, 1018-1105, 2qam:B, 1018-1105, 2qao:B, 1018-1105, 2qba:B, 1018-1105, 2qbe:B, 1018-1105, 2qbg:B, 1018-1105, 2qbi:B, 1018-1105, 2qbk:B, 1018-1105, 2qov:B, 1018-1105, 2qox:B, 1018-1105, 2qp1:B, 1018-1105, 2z4l:B, 1018-1105, 2z4n:B, 1018-1105, 3bbx:B, 1096-1183, 3df2:B, 1018-1105