Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(006)-Hairpin cluster 890 (cutoff=1.5 Å)
Cluster size 90 structure(s)
Representative structure 2jl5:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence BHDDND
Cluster members
CCUUGG
1n36:A, 181-188
GAGUUA
2qh4:A, 6-13
UCAAUU
1hs8:A, 3-10
UUAAAU
1hs4:A, 3-10
UUAACU
1hs1:A, 3-10
UUAAGU
1fjg:A, 1067-1074, 1hnw:A, 1067-1074, 1hnx:A, 1067-1074, 1hnz:A, 1067-1074, 1hr0:A, 1067-1074, 1hs2:A, 3-10, 1i94:A, 1070-1077, 1i95:A, 1070-1077, 1i96:A, 1070-1077, 1ibk:A, 1067-1074, 1ibl:A, 1067-1074, 1ibm:A, 1067-1074, 1j5e:A, 1067-1074, 1n32:A, 1067-1074, 1n33:A, 1067-1074, 1n34:A, 1067-1074, 1pns:A, 1083-1090, 1pnx:A, 1083-1090, 1s1h:A, 1068-1075, 1voq:A, 1083-1090, 1vos:A, 1083-1090, 1vov:A, 1083-1090, 1vox:A, 1083-1090, 1voz:A, 1083-1090, 1vs5:A, 1085-1092, 1vs7:A, 1085-1092, 1xmo:A, 1062-1069, 1xmq:A, 1062-1069, 1xnq:A, 1062-1069, 1xnr:A, 1062-1069, 1yl4:A, 1067-1074, 2avy:A, 1085-1092, 2aw7:A, 1085-1092, 2b64:A, 1067-1074, 2b9m:A, 1067-1074, 2b9o:A, 1067-1074, 2e5l:A, 1068-1075, 2f4v:A, 1067-1074, 2gy9:A, 1049-1056, 2hgi:A, 1067-1074, 2hgp:A, 1067-1074, 2hgr:A, 1067-1074, 2hhh:A, 1067-1074, 2i2p:A, 1085-1092, 2i2u:A, 1085-1092, 2j00:A, 1067-1074, 2j02:A, 1067-1074, 2jl5:A, 1067-1074, 2jl7:A, 1067-1074, 2ow8:y, 1067-1074, 2qal:A, 1085-1092, 2qan:A, 1085-1092, 2qb9:A, 1085-1092, 2qbb:A, 1085-1092, 2qbd:A, 1085-1092, 2qbf:A, 1085-1092, 2qbh:A, 1085-1092, 2qbj:A, 1085-1092, 2qnh:y, 1067-1074, 2qou:A, 1085-1092, 2qow:A, 1085-1092, 2qoy:A, 1085-1092, 2qp0:A, 1085-1092, 2uu9:A, 1067-1074, 2uua:A, 1067-1074, 2uub:A, 1067-1074, 2uuc:A, 1067-1074, 2uxb:A, 1067-1074, 2uxc:A, 1067-1074, 2uxd:A, 1046-1053, 2v46:A, 1067-1074, 2v48:A, 1067-1074, 2vho:A, 1085-1092, 2vhp:A, 1085-1092, 2vqe:A, 1067-1074, 2vqf:A, 1067-1074, 2z4k:A, 1085-1092, 2z4m:A, 1085-1092, 3bbn:A, 1033-1040, 3d5a:A, 1067-1074, 3d5c:A, 1067-1074, 3df1:A, 1085-1092, 3df3:A, 1085-1092
UUAAUU
1hs3:A, 3-10
UUAGCU
1tob:A, 10-17