Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(2-1)-Internal loop cluster 617 (cutoff=2.5 Å)
Cluster size 187 structure(s)
Representative structure 1yjw:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence MR-K
Cluster members
GG-A
1c2w:B, 2077-2243
UA-A
1ffk:0, 2006-2464, 1ffk:0, 2009-2460, 1ffz:A, 32-490, 1ffz:A, 35-486, 1fg0:A, 32-490, 1fg0:A, 35-486, 1jj2:0, 2056-2514, 1jj2:0, 2059-2510, 1k73:A, 2056-2514, 1k73:A, 2059-2510, 1k8a:A, 2056-2514, 1k8a:A, 2059-2510, 1k9m:A, 2056-2514, 1k9m:A, 2059-2510, 1kc8:A, 2056-2514, 1kc8:A, 2059-2510, 1kd1:A, 2056-2514, 1kd1:A, 2059-2510, 1kqs:0, 2056-2514, 1kqs:0, 2059-2510, 1m1k:A, 2056-2514, 1m1k:A, 2059-2510, 1m90:A, 2056-2514, 1m90:A, 2059-2510, 1n8r:A, 2056-2514, 1n8r:A, 2059-2510, 1nji:A, 2056-2514, 1nji:A, 2059-2510, 1q7y:A, 2056-2514, 1q7y:A, 2059-2510, 1q81:A, 2056-2514, 1q81:A, 2059-2510, 1q82:A, 2056-2514, 1q82:A, 2059-2510, 1q86:A, 2056-2514, 1q86:A, 2059-2510, 1qvf:0, 2056-2514, 1qvf:0, 2059-2510, 1qvg:0, 2056-2514, 1qvg:0, 2059-2510, 1s1i:3, 2242-2831, 1s1i:3, 2245-2827, 1s72:0, 2056-2514, 1s72:0, 2059-2510, 1vq4:0, 2056-2514, 1vq4:0, 2059-2510, 1vq5:0, 2056-2514, 1vq5:0, 2059-2510, 1vq6:0, 2056-2514, 1vq6:0, 2059-2510, 1vq7:0, 2056-2514, 1vq7:0, 2059-2510, 1vq8:0, 2056-2514, 1vq8:0, 2059-2510, 1vq9:0, 2056-2514, 1vq9:0, 2059-2510, 1vqk:0, 2056-2514, 1vqk:0, 2059-2510, 1vql:0, 2056-2514, 1vql:0, 2059-2510, 1vqm:0, 2056-2514, 1vqm:0, 2059-2510, 1vqn:0, 2056-2514, 1vqn:0, 2059-2510, 1vqo:0, 2056-2514, 1vqo:0, 2059-2510, 1vqp:0, 2056-2514, 1vqp:0, 2059-2510, 1w2b:0, 2056-2514, 1w2b:0, 2059-2510, 1yhq:0, 2056-2514, 1yhq:0, 2059-2510, 1yi2:0, 2056-2514, 1yi2:0, 2059-2510, 1yij:0, 2056-2514, 1yij:0, 2059-2510, 1yit:0, 2056-2514, 1yit:0, 2059-2510, 1yj9:0, 2056-2514, 1yj9:0, 2059-2510, 1yjn:0, 2056-2514, 1yjn:0, 2059-2510, 1yjw:0, 2056-2514, 1yjw:0, 2059-2510, 2otj:0, 2056-2514, 2otj:0, 2059-2510, 2otl:0, 2056-2514, 2otl:0, 2059-2510, 2qa4:0, 2061-2519, 2qa4:0, 2064-2515, 2qex:0, 2056-2514, 2qex:0, 2059-2510, 3cc2:0, 2056-2514, 3cc2:0, 2059-2510, 3cc4:0, 2056-2514, 3cc4:0, 2059-2510, 3cc7:0, 2056-2514, 3cc7:0, 2059-2510, 3cce:0, 2056-2514, 3cce:0, 2059-2510, 3ccj:0, 2056-2514, 3ccj:0, 2059-2510, 3ccl:0, 2056-2514, 3ccl:0, 2059-2510, 3ccm:0, 2056-2514, 3ccm:0, 2059-2510, 3ccq:0, 2056-2514, 3ccq:0, 2059-2510, 3ccr:0, 2056-2514, 3ccr:0, 2059-2510, 3ccs:0, 2056-2514, 3ccs:0, 2059-2510, 3ccu:0, 2056-2514, 3ccu:0, 2059-2510, 3ccv:0, 2056-2514, 3ccv:0, 2059-2510, 3cd6:0, 2056-2514, 3cd6:0, 2059-2510, 3cma:0, 2056-2514, 3cma:0, 2059-2510, 3cme:0, 2056-2514, 3cme:0, 2059-2510, 3cpw:0, 2056-2514, 3cpw:0, 2059-2510
UA-C
1vs6:B, 2036-2564, 1vs6:B, 2040-2559, 1vs8:B, 2036-2564, 1vs8:B, 2040-2559, 1vsa:w, 2052-2607, 1vsa:w, 2056-2602, 1vsp:w, 2052-2607, 1vsp:w, 2056-2602, 2aw4:B, 2036-2564, 2aw4:B, 2040-2559, 2awb:B, 2036-2564, 2awb:B, 2040-2559, 2hgj:A, 2052-2607, 2hgj:A, 2056-2602, 2hgq:A, 2052-2607, 2hgq:A, 2056-2602, 2hgu:A, 2052-2607, 2hgu:A, 2056-2602, 2i2t:B, 2036-2564, 2i2t:B, 2040-2559, 2i2v:B, 2036-2564, 2i2v:B, 2040-2559, 2j28:B, 2036-2564, 2j28:B, 2040-2559, 2qam:B, 2036-2564, 2qam:B, 2040-2559, 2qao:B, 2036-2564, 2qao:B, 2040-2559, 2qba:B, 2036-2564, 2qba:B, 2040-2559, 2qbc:B, 2036-2564, 2qbc:B, 2040-2559, 2qbe:B, 2036-2564, 2qbe:B, 2040-2559, 2qbg:B, 2036-2564, 2qbg:B, 2040-2559, 2qbi:B, 2036-2564, 2qbi:B, 2040-2559, 2qbk:B, 2036-2564, 2qbk:B, 2040-2559, 2qov:B, 2036-2564, 2qov:B, 2040-2559, 2qox:B, 2036-2564, 2qox:B, 2040-2559, 2qoz:B, 2036-2564, 2qoz:B, 2040-2559, 2qp1:B, 2036-2564, 2qp1:B, 2040-2559, 2vhm:B, 2036-2564, 2vhm:B, 2040-2559, 2vhn:B, 2036-2564, 2vhn:B, 2040-2559, 2z4l:B, 2036-2564, 2z4l:B, 2040-2559, 2z4n:B, 2036-2564, 2z4n:B, 2040-2559, 3bbx:B, 2135-2847, 3bbx:B, 2139-2842, 3df2:B, 2036-2564, 3df2:B, 2040-2559, 3df4:B, 2036-2564, 3df4:B, 2040-2559