Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(1-4)-Internal loop cluster 326 (cutoff=3.0 Å)
Cluster size 238 structure(s)
Representative structure 3ccs:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence R-RSVA
Cluster members
A-ACCA
1dul:B, 1-49, 1hq1:B, 1-49, 2j28:8, 14-58, 2pxb:B, 1-49, 2pxd:B, 1-49, 2pxe:B, 1-49, 2pxf:B, 1-49, 2pxk:B, 1-49, 2pxl:B, 3-47, 2pxp:B, 1-49, 2pxq:B, 1-49, 2pxt:B, 1-49, 2pxu:B, 1-49, 2pxv:B, 1-49
A-AGAA
1njm:0, 1599-1926, 1njm:0, 1607-1921, 1njn:0, 1599-1926, 1njn:0, 1607-1921, 1njo:0, 1599-1926, 1njo:0, 1607-1921, 1njp:0, 1599-1926, 1njp:0, 1607-1921, 1pnu:0, 1615-1951, 1pny:0, 1615-1951, 1vsp:w, 1673-2009, 2b66:A, 1673-2009, 2b9n:A, 1673-2009, 2b9p:A, 1673-2009, 2hgj:A, 1673-2009, 2hgq:A, 1673-2009, 2hgu:A, 1673-2009, 2o43:A, 1599-1926
A-GGGA
1fjg:A, 1415-1437, 1fjg:A, 1423-1432, 1hnw:A, 1415-1437, 1hnw:A, 1423-1432, 1hnx:A, 1415-1437, 1hnx:A, 1423-1432, 1hnz:A, 1415-1437, 1hnz:A, 1423-1432, 1hr0:A, 1415-1437, 1hr0:A, 1423-1432, 1i94:A, 1418-1440, 1i94:A, 1426-1435, 1i95:A, 1418-1440, 1i95:A, 1426-1435, 1i96:A, 1418-1440, 1i96:A, 1426-1435, 1ibk:A, 1415-1437, 1ibk:A, 1423-1432, 1ibl:A, 1415-1437, 1ibl:A, 1423-1432, 1ibm:A, 1415-1437, 1ibm:A, 1423-1432, 1j5e:A, 1415-1437, 1j5e:A, 1423-1432, 1n32:A, 1415-1437, 1n32:A, 1423-1432, 1n33:A, 1415-1437, 1n33:A, 1423-1432, 1n36:A, 1417-1435, 1n36:A, 1423-1432, 1s1h:A, 1416-1438, 1s1h:A, 1424-1433, 1xmo:A, 1409-1431, 1xmo:A, 1417-1426, 1xmq:A, 1409-1431, 1xmq:A, 1417-1426, 1xnq:A, 1409-1431, 1xnq:A, 1417-1426, 1xnr:A, 1409-1431, 1xnr:A, 1417-1426, 1yl4:A, 1415-1437, 1yl4:A, 1423-1432, 2b64:A, 1415-1437, 2b64:A, 1423-1432, 2b9m:A, 1415-1437, 2b9m:A, 1423-1432, 2b9o:A, 1415-1437, 2b9o:A, 1423-1432, 2e5l:A, 1416-1438, 2e5l:A, 1424-1433, 2f4v:A, 1416-1436, 2f4v:A, 1423-1432, 2hgi:A, 1415-1437, 2hgi:A, 1423-1432, 2hgp:A, 1415-1437, 2hgp:A, 1423-1432, 2hgr:A, 1415-1437, 2hgr:A, 1423-1432, 2hhh:A, 1415-1437, 2hhh:A, 1423-1432, 2jl5:A, 1415-1437, 2jl5:A, 1423-1432, 2jl7:A, 1415-1437, 2jl7:A, 1423-1432, 2qnh:y, 1415-1437, 2qnh:y, 1423-1432, 2uu9:A, 1415-1437, 2uu9:A, 1423-1432, 2uua:A, 1415-1437, 2uua:A, 1423-1432, 2uub:A, 1415-1437, 2uub:A, 1423-1432, 2uuc:A, 1415-1437, 2uuc:A, 1423-1432, 2uxb:A, 1415-1437, 2uxb:A, 1423-1432, 2uxc:A, 1415-1437, 2uxc:A, 1423-1432, 2vqe:A, 1415-1437, 2vqe:A, 1423-1432, 2vqf:A, 1415-1437, 2vqf:A, 1423-1432, 3d5a:A, 1415-1437, 3d5a:A, 1423-1432, 3d5c:A, 1415-1437, 3d5c:A, 1423-1432
G-ACAA
1ffk:0, 530-608, 1ffk:0, 544-597, 1jj2:0, 531-609, 1jj2:0, 545-598, 1k73:A, 531-609, 1k73:A, 545-598, 1k8a:A, 531-609, 1k8a:A, 545-598, 1k9m:A, 531-609, 1k9m:A, 545-598, 1kc8:A, 531-609, 1kc8:A, 545-598, 1kd1:A, 531-609, 1kd1:A, 545-598, 1kqs:0, 531-609, 1kqs:0, 545-598, 1m1k:A, 531-609, 1m1k:A, 545-598, 1m90:A, 531-609, 1m90:A, 545-598, 1n8r:A, 531-609, 1n8r:A, 545-598, 1nji:A, 531-609, 1nji:A, 545-598, 1q7y:A, 531-609, 1q7y:A, 545-598, 1q81:A, 531-609, 1q81:A, 545-598, 1q82:A, 531-609, 1q82:A, 545-598, 1q86:A, 531-609, 1q86:A, 545-598, 1qvf:0, 531-609, 1qvf:0, 545-598, 1qvg:0, 531-609, 1qvg:0, 545-598, 1s1i:3, 530-611, 1s1i:3, 544-600, 1s72:0, 531-609, 1s72:0, 545-598, 1vq4:0, 531-609, 1vq4:0, 545-598, 1vq5:0, 531-609, 1vq5:0, 545-598, 1vq6:0, 531-609, 1vq6:0, 545-598, 1vq7:0, 531-609, 1vq7:0, 545-598, 1vq8:0, 531-609, 1vq8:0, 545-598, 1vq9:0, 531-609, 1vq9:0, 545-598, 1vqk:0, 531-609, 1vqk:0, 545-598, 1vql:0, 531-609, 1vql:0, 545-598, 1vqm:0, 531-609, 1vqm:0, 545-598, 1vqn:0, 531-609, 1vqn:0, 545-598, 1vqo:0, 531-609, 1vqo:0, 545-598, 1vqp:0, 531-609, 1vqp:0, 545-598, 1w2b:0, 531-609, 1w2b:0, 545-598, 1yhq:0, 531-609, 1yhq:0, 545-598, 1yi2:0, 531-609, 1yi2:0, 545-598, 1yij:0, 531-609, 1yij:0, 545-598, 1yit:0, 531-609, 1yit:0, 545-598, 1yj9:0, 531-609, 1yj9:0, 545-598, 1yjn:0, 531-609, 1yjn:0, 545-598, 1yjw:0, 531-609, 1yjw:0, 545-598, 2otj:0, 531-609, 2otj:0, 545-598, 2otl:0, 531-609, 2otl:0, 545-598, 2qa4:0, 531-609, 2qa4:0, 545-598, 2qex:0, 531-609, 2qex:0, 545-598, 3cc2:0, 531-609, 3cc2:0, 545-598, 3cc4:0, 531-609, 3cc4:0, 545-598, 3cc7:0, 531-609, 3cc7:0, 545-598, 3cce:0, 531-609, 3cce:0, 545-598, 3ccj:0, 531-609, 3ccj:0, 545-598, 3ccl:0, 531-609, 3ccl:0, 545-598, 3ccm:0, 531-609, 3ccm:0, 545-598, 3ccq:0, 531-609, 3ccq:0, 545-598, 3ccr:0, 531-609, 3ccr:0, 545-598, 3ccs:0, 531-609, 3ccs:0, 545-598, 3ccu:0, 531-609, 3ccu:0, 545-598, 3ccv:0, 531-609, 3ccv:0, 545-598, 3cd6:0, 531-609, 3cd6:0, 545-598, 3cma:0, 531-609, 3cma:0, 545-598, 3cme:0, 531-609, 3cme:0, 545-598, 3cpw:0, 531-609, 3cpw:0, 545-598