Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(1-2)-Internal loop cluster 331 (cutoff=1.0 Å)
Cluster size 150 structure(s)
Representative structure 1s72:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence D-NH
Cluster members
A-CC
3bo4:B, 10-34, 3bo4:B, 19-26
G-AC
2gya:0, 673-697, 2gya:0, 678-693, 2gyc:0, 674-696, 2gyc:0, 678-693
G-CA
1yl4:A, 48-350, 1yl4:A, 52-347
U-GU
1vsa:w, 762-786, 1vsa:w, 767-782, 1vsp:w, 762-786, 1vsp:w, 767-782, 2hgj:A, 761-785, 2hgj:A, 766-781, 2hgq:A, 761-785, 2hgq:A, 766-781, 2hgu:A, 761-785, 2hgu:A, 766-781, 2jl6:A, 772-796, 2jl6:A, 777-792, 2jl8:A, 772-796, 2jl8:A, 777-792, 2v47:A, 745-769, 2v47:A, 750-765, 2v49:A, 745-769, 2v49:A, 750-765, 3d5b:A, 757-781, 3d5b:A, 762-777, 3d5d:A, 757-781, 3d5d:A, 762-777
U-UU
1ffk:0, 818-843, 1ffk:0, 823-839, 1jj2:0, 822-847, 1jj2:0, 827-843, 1k73:A, 822-847, 1k73:A, 827-843, 1k8a:A, 822-847, 1k8a:A, 827-843, 1k9m:A, 822-847, 1k9m:A, 827-843, 1kc8:A, 822-847, 1kc8:A, 827-843, 1kd1:A, 822-847, 1kd1:A, 827-843, 1kqs:0, 822-847, 1kqs:0, 827-843, 1m1k:A, 822-847, 1m1k:A, 827-843, 1m90:A, 822-847, 1m90:A, 827-843, 1n8r:A, 822-847, 1n8r:A, 827-843, 1nji:A, 822-847, 1nji:A, 827-843, 1q7y:A, 822-847, 1q7y:A, 827-843, 1q81:A, 822-847, 1q81:A, 827-843, 1q82:A, 822-847, 1q82:A, 827-843, 1q86:A, 822-847, 1q86:A, 827-843, 1qvf:0, 822-847, 1qvf:0, 827-843, 1qvg:0, 822-847, 1qvg:0, 827-843, 1s1i:3, 821-846, 1s1i:3, 826-842, 1s72:0, 822-847, 1s72:0, 827-843, 1vq4:0, 822-847, 1vq4:0, 827-843, 1vq5:0, 822-847, 1vq5:0, 827-843, 1vq6:0, 822-847, 1vq6:0, 827-843, 1vq7:0, 822-847, 1vq7:0, 827-843, 1vq8:0, 822-847, 1vq8:0, 827-843, 1vq9:0, 822-847, 1vq9:0, 827-843, 1vqk:0, 822-847, 1vqk:0, 827-843, 1vql:0, 822-847, 1vql:0, 827-843, 1vqm:0, 822-847, 1vqm:0, 827-843, 1vqn:0, 822-847, 1vqn:0, 827-843, 1vqo:0, 822-847, 1vqo:0, 827-843, 1vqp:0, 822-847, 1vqp:0, 827-843, 1w2b:0, 822-847, 1w2b:0, 827-843, 1yhq:0, 822-847, 1yhq:0, 827-843, 1yi2:0, 822-847, 1yi2:0, 827-843, 1yij:0, 822-847, 1yij:0, 827-843, 1yit:0, 822-847, 1yit:0, 827-843, 1yj9:0, 822-847, 1yj9:0, 827-843, 1yjn:0, 822-847, 1yjn:0, 827-843, 1yjw:0, 822-847, 1yjw:0, 827-843, 2otj:0, 822-847, 2otj:0, 827-843, 2otl:0, 822-847, 2otl:0, 827-843, 2qa4:0, 821-846, 2qa4:0, 826-842, 2qex:0, 822-847, 2qex:0, 827-843, 3cc2:0, 822-847, 3cc2:0, 827-843, 3cc4:0, 822-847, 3cc4:0, 827-843, 3cc7:0, 822-847, 3cc7:0, 827-843, 3cce:0, 822-847, 3cce:0, 827-843, 3ccj:0, 822-847, 3ccj:0, 827-843, 3ccl:0, 822-847, 3ccl:0, 827-843, 3ccm:0, 822-847, 3ccm:0, 827-843, 3ccq:0, 822-847, 3ccq:0, 827-843, 3ccr:0, 822-847, 3ccr:0, 827-843, 3ccs:0, 822-847, 3ccs:0, 827-843, 3ccu:0, 822-847, 3ccu:0, 827-843, 3ccv:0, 822-847, 3ccv:0, 827-843, 3cd6:0, 822-847, 3cd6:0, 827-843, 3cma:0, 822-847, 3cma:0, 827-843, 3cme:0, 822-847, 3cme:0, 827-843, 3cpw:0, 822-847, 3cpw:0, 827-843