Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(1-1)-Internal loop cluster 2533 (cutoff=1.5 Å)
Cluster size 78 structure(s)
Representative structure 2ogn:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence N-N
Cluster members
A-C
1j5a:A, 836-863, 1j5a:A, 840-859, 1jzx:A, 836-863, 1jzx:A, 840-859, 1jzy:A, 836-863, 1jzy:A, 840-859, 1jzz:A, 836-863, 1jzz:A, 840-859, 1k01:A, 836-863, 1k01:A, 840-859, 1njm:0, 831-855, 1njm:0, 835-851, 1njn:0, 831-855, 1njn:0, 835-851, 1njo:0, 831-855, 1njo:0, 835-851, 1njp:0, 831-855, 1njp:0, 835-851, 1p9x:0, 808-832, 1p9x:0, 812-828, 1pnu:0, 831-871, 1pny:0, 831-871, 1sm1:0, 831-855, 1sm1:0, 835-851, 1vor:B, 832-870, 1vou:B, 832-870, 1vow:B, 832-870, 1voy:B, 832-870, 1vp0:B, 832-870, 2aar:0, 831-855, 2aar:0, 835-851, 2d3o:0, 831-855, 2d3o:0, 835-851, 2o45:A, 831-852, 2o45:A, 835-848, 2ogn:0, 831-855, 2ogn:0, 835-851
A-G
1hr0:A, 1387-1464
C-A
1j5a:A, 836-863, 1j5a:A, 840-859, 1jzx:A, 836-863, 1jzx:A, 840-859, 1jzy:A, 836-863, 1jzy:A, 840-859, 1jzz:A, 836-863, 1jzz:A, 840-859, 1k01:A, 836-863, 1k01:A, 840-859, 1njm:0, 831-855, 1njm:0, 835-851, 1njn:0, 831-855, 1njn:0, 835-851, 1njo:0, 831-855, 1njo:0, 835-851, 1njp:0, 831-855, 1njp:0, 835-851, 1p9x:0, 808-832, 1p9x:0, 812-828, 1pnu:0, 831-871, 1pny:0, 831-871, 1sm1:0, 831-855, 1sm1:0, 835-851, 1vor:B, 832-870, 1vou:B, 832-870, 1vow:B, 832-870, 1voy:B, 832-870, 1vp0:B, 832-870, 2aar:0, 831-855, 2aar:0, 835-851, 2d3o:0, 831-855, 2d3o:0, 835-851, 2o45:A, 831-852, 2o45:A, 835-848, 2ogn:0, 831-855, 2ogn:0, 835-851
G-A
1hr0:A, 1387-1464
U-U
2gya:0, 805-838, 2gya:0, 805-838