Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(1-1)-Internal loop cluster 997 (cutoff=1.0 Å with sequence identity)
Cluster size 223 structure(s)
Representative structure 1vos:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence C-G
Cluster members
C-G
1fka:A, 178-191, 1fka:A, 181-188, 1fka:A, 66-88, 1fka:A, 71-83, 1i94:A, 1288-1309, 1i94:A, 1292-1305, 1i97:A, 1331-1352, 1i97:A, 1335-1348, 1i97:A, 31-534, 1i97:A, 34-531, 1i97:A, 1288-1309, 1i97:A, 1291-1306, 1i97:A, 246-268, 1i97:A, 249-265, 1i97:A, 252-262, 1jzy:A, 2159-2181, 1jzy:A, 2162-2178, 1n34:A, 1285-1306, 1n34:A, 1288-1303, 1n34:A, 134-168, 1n34:A, 35-394, 1n34:A, 38-391, 1n34:A, 900-1368, 1n36:A, 1218-1273, 1n36:A, 1401-1450, 1n36:A, 1287-1304, 1n36:A, 1290-1301, 1n36:A, 1327-1350, 1n36:A, 1331-1346, 1n36:A, 243-265, 1n36:A, 247-261, 1p9x:0, 959-1040, 1voq:A, 1413-1473, 1vor:B, 652-736, 1vor:B, 656-732, 1vor:B, 369-384, 1vor:B, 372-381, 1vos:A, 1413-1473, 1vou:B, 652-736, 1vou:B, 656-732, 1vou:B, 369-384, 1vou:B, 372-381, 1vov:A, 1413-1473, 1vow:B, 652-736, 1vow:B, 656-732, 1vow:B, 369-384, 1vow:B, 372-381, 1vox:A, 1413-1473, 1voy:B, 652-736, 1voy:B, 656-732, 1voy:B, 369-384, 1voy:B, 372-381, 1voz:A, 1413-1473, 1vp0:B, 652-736, 1vp0:B, 656-732, 1vp0:B, 369-384, 1vp0:B, 372-381, 1xbp:0, 2568-2624, 1xmo:A, 1322-1344, 1xmo:A, 1325-1341, 1xmo:A, 178-191, 1xmo:A, 181-188, 1xnr:A, 178-191, 1xnr:A, 181-188, 1yl3:A, 1189-1209, 1yl3:A, 1192-1206, 1yl3:A, 2093-2182, 1yl3:A, 2437-2465, 1yl3:A, 2441-2461, 1yl3:A, 2489-2547, 1yl3:A, 2492-2544, 1yl3:A, 875-951, 1yl3:A, 1058-1145, 1yl4:A, 645-719, 1yl4:A, 650-714, 1yl4:A, 748-789, 1yl4:A, 751-786, 1z58:2, 1598-1912, 1z58:2, 1603-1907, 1z58:2, 2170-2188, 1z58:2, 2174-2184, 1z58:2, 769-1134, 1z58:2, 773-1130, 1z58:2, 1951-2496, 1z58:2, 1955-2492, 2aar:0, 671-686, 2aar:0, 674-683, 2b64:A, 577-619, 2b64:A, 800-852, 2b64:A, 804-848, 2b64:A, 900-1368, 2b66:A, 1189-1209, 2b66:A, 1192-1206, 2b66:A, 1239-1258, 2b66:A, 1242-1255, 2b66:A, 2093-2124, 2b66:A, 2217-2235, 2b66:A, 2221-2231, 2b9m:A, 577-619, 2b9m:A, 900-1368, 2b9n:A, 1189-1209, 2b9n:A, 1192-1206, 2b9n:A, 1239-1258, 2b9n:A, 1242-1255, 2b9n:A, 2093-2124, 2b9n:A, 2217-2235, 2b9n:A, 2221-2231, 2b9o:A, 577-619, 2b9o:A, 800-852, 2b9o:A, 804-848, 2b9o:A, 900-1368, 2b9p:A, 1189-1209, 2b9p:A, 1192-1206, 2b9p:A, 1239-1258, 2b9p:A, 1242-1255, 2b9p:A, 2093-2124, 2b9p:A, 2217-2235, 2b9p:A, 2221-2231, 2csx:C, 1-73, 2csx:C, 5-69, 2csx:D, 1-73, 2csx:D, 5-69, 2f4v:A, 567-630, 2f4v:A, 35-394, 2f4v:A, 38-391, 2gya:0, 875-899, 2gya:0, 881-893, 2hgj:A, 2136-2155, 2hgj:A, 2139-2152, 2j00:A, 143-158, 2j00:A, 147-154, 2j01:A, 2010-2084, 2j01:A, 1036-1071, 2j01:A, 1040-1067, 2j01:B, 18-65, 2j02:A, 143-158, 2j02:A, 147-154, 2j03:A, 1036-1071, 2j03:A, 1040-1067, 2j03:B, 18-65, 2jl5:A, 808-830, 2jl5:A, 812-826, 2jl6:A, 2089-2163, 2jl6:A, 2094-2158, 2jl7:A, 808-830, 2jl7:A, 812-826, 2jl7:W, 2-71, 2jl7:W, 5-68, 2nre:F, 42-58, 2nre:F, 45-55, 2o44:A, 801-885, 2o44:A, 552-628, 2o45:A, 2427-2441, 2o45:A, 2430-2438, 2ogn:0, 775-1143, 2ogn:0, 779-1139, 2om7:J, 1-73, 2qa4:0, 1509-1626, 2uu9:A, 1327-1350, 2uu9:A, 1330-1347, 2uxb:A, 1285-1306, 2uxb:A, 1289-1302, 2uxb:A, 1397-1454, 2uxd:A, 959-976, 2uxd:A, 962-973, 2v0g:F, 1-78, 2v0g:F, 6-73, 2v46:A, 658-690, 2v46:A, 661-687, 2v46:A, 1399-1452, 2v46:A, 35-394, 2v46:A, 39-390, 2v46:A, 568-629, 2v46:A, 572-625, 2v47:A, 1652-1674, 2v47:A, 1655-1671, 2v47:A, 2083-2096, 2v47:A, 2086-2093, 2v47:A, 549-568, 2v47:A, 555-562, 2v47:A, 145-158, 2v47:A, 148-155, 2v47:A, 861-927, 2v48:A, 1399-1452, 2v48:A, 656-692, 2v48:A, 661-687, 2v48:A, 35-394, 2v48:A, 39-390, 2v48:A, 568-629, 2v48:A, 572-625, 2v49:A, 1652-1674, 2v49:A, 1655-1671, 2v49:A, 2083-2096, 2v49:A, 2086-2093, 2v49:A, 549-568, 2v49:A, 555-562, 2v49:A, 145-158, 2v49:A, 148-155, 2v49:A, 861-927, 2vhm:B, 1148-1169, 2vhm:B, 1155-1162, 2vhm:B, 18-522, 2vhm:B, 23-517, 2vhm:B, 2786-2825, 2vhm:B, 76-110, 2vhm:B, 15-525, 2vhm:B, 37-442, 2vhm:B, 40-439, 2vhm:B, 838-924, 2vhn:A, 1-117, 2vhn:A, 4-114, 2vhn:B, 18-522, 2vhn:B, 23-517, 2vhn:B, 2786-2825, 2vhn:B, 15-525, 2vho:A, 451-473, 2vho:A, 454-470, 2vhp:A, 831-847, 2vhp:A, 835-843, 2vhp:A, 980-1217, 2vhp:A, 984-1213, 3dio:X, 30-63, 3dio:X, 37-56