Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(1-1)-Internal loop cluster 3133 (cutoff=1.0 Å with sequence identity)
Cluster size 192 structure(s)
Representative structure 2vhn:B (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence A-U
Cluster members
A-U
1fka:A, 1462-1479, 1fka:A, 1467-1474, 1fka:A, 944-1180, 1fka:A, 947-1177, 1fka:A, 638-710, 1grz:B, 47-66, 1grz:B, 50-63, 1i95:A, 1099-1136, 1i95:A, 1104-1131, 1i97:A, 1222-1275, 1i97:A, 1226-1271, 1i97:A, 594-610, 1i97:A, 597-607, 1i97:A, 752-791, 1i97:A, 755-788, 1j5a:A, 2190-2242, 1j5a:A, 2194-2238, 1j5a:A, 1120-1138, 1j5a:A, 1125-1133, 1jzx:A, 2190-2242, 1jzx:A, 2194-2238, 1jzx:A, 1120-1138, 1jzx:A, 1125-1133, 1jzy:A, 2190-2242, 1jzy:A, 2194-2238, 1jzy:A, 1120-1138, 1jzy:A, 1125-1133, 1jzz:A, 2190-2242, 1jzz:A, 2194-2238, 1jzz:A, 1120-1138, 1jzz:A, 1125-1133, 1k01:A, 2190-2242, 1k01:A, 2194-2238, 1k01:A, 1120-1138, 1k01:A, 1125-1133, 1n33:A, 1401-1450, 1n34:A, 748-789, 1n34:A, 752-785, 1n36:A, 126-218, 1n36:A, 131-213, 1n36:A, 1482-1499, 1n36:A, 1487-1494, 1n36:A, 567-630, 1n36:A, 571-626, 1p9x:0, 1937-2490, 1p9x:0, 1941-2486, 1p9x:0, 2166-2184, 1p9x:0, 2169-2181, 1p9x:0, 2262-2288, 1p9x:0, 2515-2539, 1p9x:0, 2518-2536, 1p9x:0, 2558-2586, 1p9x:0, 2561-2583, 1vor:A, 81-94, 1vor:A, 84-91, 1vor:B, 1393-1530, 1vor:B, 1733-1769, 1vor:B, 2566-2725, 1vou:A, 81-94, 1vou:A, 84-91, 1vou:B, 1393-1530, 1vou:B, 1733-1769, 1vow:A, 81-94, 1vow:A, 84-91, 1vow:B, 1393-1530, 1vow:B, 1733-1769, 1vow:B, 2566-2725, 1voy:A, 81-94, 1voy:A, 84-91, 1voy:B, 1393-1530, 1voy:B, 1733-1769, 1voy:B, 2566-2725, 1vp0:A, 81-94, 1vp0:A, 84-91, 1vp0:B, 1393-1530, 1vp0:B, 1733-1769, 1vp0:B, 2566-2725, 1wsu:E, 1-25, 1wsu:E, 6-20, 1wsu:F, 1-25, 1wsu:F, 6-20, 1wsu:G, 1-24, 1wsu:G, 6-19, 1y69:0, 1146-1194, 1y69:0, 1994-2135, 1yl3:A, 847-860, 1yl3:A, 850-857, 1yl3:A, 2077-2219, 1yl3:A, 2622-2650, 1yl3:A, 2626-2646, 1z58:2, 1138-1184, 1z58:2, 1649-1667, 1z58:2, 1654-1662, 1z58:2, 1-2765, 1z58:2, 1252-1276, 1z58:2, 1347-1534, 1z58:2, 4-2762, 1z58:2, 882-907, 1z58:2, 886-903, 1z58:2, 971-1056, 1z58:2, 974-1053, 2aar:0, 1994-2135, 2aar:0, 979-1066, 2b66:A, 2-2816, 2b66:A, 6-2812, 2b66:A, 2564-2592, 2b66:A, 2568-2588, 2b9n:A, 2-2816, 2b9n:A, 6-2812, 2b9n:A, 2564-2592, 2b9n:A, 2568-2588, 2b9p:A, 2-2816, 2b9p:A, 6-2812, 2b9p:A, 2564-2592, 2b9p:A, 2568-2588, 2d3o:0, 1146-1194, 2d3o:0, 1377-1514, 2f4v:A, 1400-1451, 2gy9:A, 795-817, 2gy9:A, 798-814, 2gy9:A, 111-217, 2gy9:A, 564-606, 2gya:0, 2130-2152, 2gya:0, 2134-2148, 2gyb:A, 795-817, 2gyb:A, 798-814, 2gyb:A, 111-217, 2gyc:0, 116-130, 2gyc:0, 119-127, 2gyc:0, 1982-2073, 2gyc:0, 1985-2070, 2nz4:S, 1-22, 2nz4:S, 5-18, 2o44:A, 1352-1547, 2o44:A, 1960-2517, 2o44:A, 1965-2512, 2o44:A, 785-798, 2o44:A, 788-795, 2o45:A, 1714-1750, 2qa4:0, 1520-1615, 2qa4:0, 1523-1612, 2uwm:C, 1-23, 2uwm:C, 6-18, 2uxd:A, 1196-1251, 2uxd:A, 948-1001, 2uxd:A, 953-996, 2v3c:M, 13-34, 2v3c:M, 17-30, 2v47:A, 1649-1677, 2v49:A, 1359-1534, 2v49:A, 1363-1530, 2v49:A, 1649-1677, 2vhm:B, 1466-1491, 2vhm:B, 1470-1487, 2vhm:B, 2061-2190, 2vhm:B, 707-724, 2vhm:B, 710-721, 2vhm:B, 822-835, 2vhm:B, 825-832, 2vhn:B, 1466-1491, 2vhn:B, 1470-1487, 2vhn:B, 2-2848, 2vhn:B, 2061-2190, 2vhn:B, 5-2845, 2vhn:B, 707-724, 2vhn:B, 710-721, 2vhp:A, 1506-1521, 2vhp:A, 1510-1517, 2vpl:D, 1-48, 2zjr:X, 1968-2000, 2zjr:X, 1972-1996, 3bbo:A, 2630-2658, 3bbo:A, 2633-2655, 3bbo:A, 1614-1940, 3bbo:A, 2020-2174, 3bbo:A, 2023-2171, 3bo2:B, 104-119, 3bo2:B, 99-124, 3bo3:B, 104-119, 3bo3:B, 99-124, 3bo4:B, 104-119, 3bo4:B, 99-124, 3d5a:A, 957-1198, 3d5a:A, 960-1195, 3d5a:A, 970-1022, 3d5a:A, 974-1018, 3d5c:A, 957-1198, 3d5c:A, 960-1195, 3d5c:A, 970-1022, 3d5c:A, 974-1018, 3dll:X, 1090-1108, 3dll:X, 1095-1103