Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(1-1)-Internal loop cluster 3102 (cutoff=1.0 Å with sequence identity)
Cluster size 279 structure(s)
Representative structure 2vhn:B (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence U-G
Cluster members
U-G
1c2w:B, 2136-2155, 1c2w:B, 2140-2151, 1c2w:B, 375-399, 1c2w:B, 378-396, 1fka:A, 111-230, 1fka:A, 115-226, 1foq:A, 1-109, 1foq:A, 13-97, 1foq:A, 21-89, 1foq:B, 1-109, 1foq:B, 13-97, 1foq:B, 21-89, 1foq:C, 1-109, 1foq:C, 13-97, 1foq:C, 21-89, 1foq:D, 1-109, 1foq:D, 13-97, 1foq:D, 21-89, 1foq:E, 1-109, 1foq:E, 13-97, 1foq:E, 21-89, 1i94:A, 811-833, 1i94:A, 816-828, 1i94:A, 819-825, 1i97:A, 816-828, 1i97:A, 819-825, 1ibm:A, 1397-1454, 1j5a:A, 343-367, 1j5a:A, 348-362, 1jzx:A, 343-367, 1jzx:A, 348-362, 1jzy:A, 343-367, 1jzy:A, 348-362, 1jzz:A, 343-367, 1jzz:A, 348-362, 1k01:A, 343-367, 1k01:A, 348-362, 1n34:A, 919-1212, 1n34:A, 924-1207, 1n36:A, 920-1211, 1n36:A, 924-1207, 1njm:0, 1432-1456, 1njm:0, 1435-1453, 1njm:0, 2010-2092, 1njm:0, 652-736, 1njm:0, 658-730, 1njm:0, 338-362, 1njm:0, 343-357, 1njm:0, 493-519, 1njm:0, 500-512, 1njn:0, 1432-1456, 1njn:0, 1435-1453, 1njn:0, 2010-2092, 1njn:0, 652-736, 1njn:0, 658-730, 1njn:0, 338-362, 1njn:0, 343-357, 1njn:0, 493-519, 1njn:0, 500-512, 1njo:0, 1432-1456, 1njo:0, 1435-1453, 1njo:0, 2010-2092, 1njo:0, 652-736, 1njo:0, 658-730, 1njo:0, 338-362, 1njo:0, 343-357, 1njp:0, 1432-1456, 1njp:0, 1435-1453, 1njp:0, 2010-2092, 1njp:0, 652-736, 1njp:0, 658-730, 1njp:0, 338-362, 1njp:0, 343-357, 1njp:0, 493-519, 1njp:0, 500-512, 1nkw:0, 1432-1456, 1nkw:0, 1435-1453, 1nkw:0, 1717-1753, 1nkw:9, 2-117, 1nkw:9, 8-111, 1nkw:0, 2050-2062, 1nkw:0, 2053-2059, 1nkw:0, 2415-2432, 1nkw:0, 2419-2428, 1nkw:0, 338-362, 1nkw:0, 343-357, 1nwx:0, 1432-1456, 1nwx:0, 1435-1453, 1nwx:0, 1717-1753, 1nwx:9, 2-117, 1nwx:9, 8-111, 1nwx:0, 2050-2062, 1nwx:0, 2053-2059, 1nwx:0, 2415-2432, 1nwx:0, 2419-2428, 1nwx:0, 338-362, 1nwx:0, 343-357, 1nwy:0, 1432-1456, 1nwy:0, 1435-1453, 1nwy:0, 1717-1753, 1nwy:9, 2-117, 1nwy:9, 8-111, 1nwy:0, 2050-2062, 1nwy:0, 2053-2059, 1nwy:0, 2415-2432, 1nwy:0, 2419-2428, 1nwy:0, 338-362, 1nwy:0, 343-357, 1ond:0, 1432-1456, 1ond:0, 1435-1453, 1ond:0, 1716-1752, 1ond:0, 2049-2061, 1ond:0, 2052-2058, 1ond:0, 2414-2431, 1ond:0, 2418-2427, 1ond:0, 338-362, 1ond:0, 343-357, 1ond:0, 493-519, 1ond:0, 499-513, 1p9x:0, 956-1043, 1pnu:0, 1448-1472, 1pnu:0, 1451-1469, 1pnu:0, 339-361, 1pnu:0, 343-357, 1pnu:0, 493-519, 1pnu:0, 500-512, 1pny:0, 1448-1472, 1pny:0, 1451-1469, 1pny:0, 339-361, 1pny:0, 343-357, 1pny:0, 493-519, 1pny:0, 500-512, 1sm1:0, 1432-1456, 1sm1:0, 1435-1453, 1sm1:0, 2049-2063, 1sm1:0, 2053-2059, 1sm1:0, 979-1066, 1voq:A, 1417-1469, 1vor:B, 2331-2357, 1vor:B, 2334-2354, 1vos:A, 1417-1469, 1vou:B, 2331-2357, 1vou:B, 2334-2354, 1vow:B, 2331-2357, 1vow:B, 2334-2354, 1voy:B, 2331-2357, 1voy:B, 2334-2354, 1vp0:B, 2331-2357, 1vp0:B, 2334-2354, 1xbp:0, 1717-1753, 1xbp:0, 2588-2603, 1xbp:0, 2591-2600, 1xbp:0, 552-628, 1xbp:9, 2-117, 1xbp:9, 8-111, 1xbp:0, 1786-1799, 1xbp:0, 1789-1796, 1xbp:0, 2050-2062, 1xbp:0, 2053-2059, 1xbp:0, 338-362, 1xbp:0, 343-357, 1xbp:0, 979-1066, 1xnq:A, 1391-1448, 1y69:0, 1432-1456, 1y69:0, 1435-1453, 1y69:0, 552-628, 1y69:0, 816-870, 1y69:0, 1786-1799, 1y69:0, 1789-1796, 1y69:0, 2287-2313, 1yl4:1, 12-32, 1yl4:1, 17-27, 1yl4:A, 111-230, 1yl4:A, 115-226, 1yl4:A, 577-619, 1yl4:A, 811-827, 1yl4:A, 816-822, 1z43:A, 3-101, 1z43:A, 7-97, 1z58:2, 2266-2292, 1z58:2, 2269-2289, 1z58:2, 269-284, 1z58:2, 272-281, 2azx:D, 3-69, 2azx:D, 6-66, 2b66:B, 11-114, 2b66:B, 3-122, 2b9n:B, 11-114, 2b9n:B, 3-122, 2b9p:B, 11-114, 2b9p:B, 3-122, 2d3o:0, 1432-1456, 2d3o:0, 1435-1453, 2d3o:0, 552-628, 2d3o:0, 555-625, 2d3o:0, 2559-2587, 2d3o:0, 2562-2584, 2d3o:0, 339-361, 2d3o:0, 343-357, 2f4v:A, 919-1212, 2f4v:A, 924-1207, 2f4v:A, 808-830, 2f4v:A, 816-822, 2gyc:0, 1405-1429, 2gyc:0, 1408-1426, 2hgi:A, 111-230, 2hgi:A, 115-226, 2hgj:A, 875-951, 2hgq:A, 875-951, 2hgr:A, 111-230, 2hgr:A, 115-226, 2o43:A, 552-628, 2o43:A, 555-625, 2o43:A, 816-870, 2o43:A, 272-287, 2o43:A, 275-284, 2o43:A, 339-361, 2o43:A, 343-357, 2o43:A, 493-519, 2o43:A, 499-513, 2o44:A, 1432-1456, 2o44:A, 1435-1453, 2o45:A, 2275-2301, 2o45:A, 495-517, 2o45:A, 499-513, 2o45:A, 652-736, 2o45:A, 655-733, 2ogm:0, 2048-2064, 2ogm:0, 2053-2059, 2ogm:0, 338-362, 2ogm:0, 343-357, 2ogm:0, 652-736, 2ogm:0, 655-733, 2ogm:0, 891-916, 2ogn:0, 1432-1456, 2ogn:0, 1435-1453, 2ogn:0, 1717-1753, 2ogn:0, 2287-2313, 2ogn:0, 2290-2310, 2ogn:0, 979-1066, 2ogo:0, 1431-1455, 2ogo:0, 1434-1452, 2ogo:0, 2009-2091, 2ogo:0, 271-286, 2ogo:0, 274-283, 2ow8:y, 808-830, 2ow8:y, 811-827, 2qa4:0, 721-736, 2qa4:0, 725-732, 2uxb:A, 65-89, 2uxb:A, 70-84, 2v48:A, 1482-1499, 2v48:A, 1486-1495, 2vhm:B, 1199-1218, 2vhm:B, 1202-1215, 2vhm:B, 592-665, 2vhm:B, 599-658, 2vhm:B, 1018-1105, 2vhm:B, 930-955, 2vhm:B, 935-950, 2vhn:B, 1199-1218, 2vhn:B, 1202-1215, 2vhn:B, 592-665, 2vhn:B, 599-658, 2vhn:B, 930-955, 2vhn:B, 935-950, 2vho:A, 1417-1475, 2vho:A, 1432-1461, 2vho:A, 1435-1458, 2zjq:X, 1410-1434, 2zjr:X, 630-714, 2zjr:X, 637-707, 3cf5:X, 2449-2477, 3cf5:X, 2452-2474, 3d5b:A, 2088-2191, 3d5d:A, 2088-2191, 3dll:X, 1410-1434, 3dll:X, 630-714, 3dll:X, 637-707