Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(1-1)-Internal loop cluster 975 (cutoff=1.0 Å)
Cluster size 228 structure(s)
Representative structure 1vor:B (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence N-N
Cluster members
A-C
1j5a:A, 836-863, 1j5a:A, 840-859, 1jzx:A, 836-863, 1jzx:A, 840-859, 1jzy:A, 836-863, 1jzy:A, 840-859, 1jzz:A, 836-863, 1jzz:A, 840-859, 1k01:A, 836-863, 1k01:A, 840-859, 1p9x:0, 808-832, 1p9x:0, 812-828, 2aar:0, 831-855, 2aar:0, 835-851, 2d3o:0, 831-855, 2d3o:0, 835-851, 2hgj:A, 969-994, 2hgj:A, 977-986, 2j01:A, 947-972, 2j01:A, 955-964, 2j03:A, 947-972, 2j03:A, 955-964, 2o44:A, 831-855, 2o44:A, 835-851, 2o45:A, 831-852, 2o45:A, 835-848, 2ogn:0, 831-855, 2ogn:0, 835-851, 2v47:A, 947-972, 2v47:A, 955-964, 2v49:A, 947-972, 2v49:A, 955-964, 2zjp:X, 809-833, 2zjp:X, 813-829, 2zjq:X, 809-833, 2zjq:X, 813-829, 2zjr:X, 809-830, 2zjr:X, 813-826, 3cf5:X, 809-833, 3cf5:X, 813-829, 3dll:X, 809-833, 3dll:X, 813-829
A-U
2v47:A, 2132-2154, 2v47:A, 2136-2150, 2v49:A, 2132-2154, 2v49:A, 2136-2150, 3bbo:A, 2199-2219, 3bbo:A, 2202-2216
C-A
1p9x:0, 868-893, 1p9x:0, 876-885, 1y69:0, 891-916, 1y69:0, 899-908, 1yl3:A, 970-993, 1yl3:A, 977-986, 2aar:0, 831-855, 2aar:0, 835-851, 2b66:A, 970-993, 2b66:A, 977-986, 2b9n:A, 970-993, 2b9n:A, 977-986, 2b9p:A, 970-993, 2b9p:A, 977-986, 2d3o:0, 831-855, 2d3o:0, 835-851, 2d3o:0, 891-916, 2d3o:0, 899-908, 2hgj:A, 969-994, 2hgj:A, 977-986, 2hgq:A, 969-994, 2hgq:A, 977-986, 2hgu:A, 969-994, 2hgu:A, 977-986, 2j01:A, 947-972, 2j01:A, 955-964, 2j03:A, 947-972, 2j03:A, 955-964, 2o43:A, 891-916, 2o43:A, 899-908, 2o44:A, 831-855, 2o44:A, 835-851, 2v47:A, 947-972, 2v47:A, 955-964, 2v49:A, 947-972, 2v49:A, 955-964, 2zjp:X, 809-833, 2zjp:X, 813-829, 2zjq:X, 809-833, 2zjq:X, 813-829, 2zjr:X, 809-830, 2zjr:X, 813-826, 3cf5:X, 809-833, 3cf5:X, 813-829, 3dll:X, 809-833, 3dll:X, 813-829, 3dll:X, 869-894, 3dll:X, 877-886
G-U
2jl6:A, 904-938, 2jl6:A, 908-934, 2jl8:A, 904-938, 2jl8:A, 908-934, 2v47:A, 877-911, 2v47:A, 881-907, 2v49:A, 877-911, 2v49:A, 881-907, 3d5b:A, 889-929, 3d5d:A, 889-929
U-A
1vor:B, 2566-2725, 1vow:B, 2566-2725, 1voy:B, 2566-2725, 1vp0:B, 2566-2725, 2v47:A, 2132-2154, 2v47:A, 2136-2150, 2v49:A, 2132-2154, 2v49:A, 2136-2150, 3bbo:A, 2199-2219, 3bbo:A, 2202-2216
U-G
2b66:B, 11-114, 2b66:B, 3-122, 2b9n:B, 11-114, 2b9n:B, 3-122, 2b9p:B, 11-114, 2b9p:B, 3-122, 2jl6:A, 904-938, 2jl6:A, 908-934, 2jl8:A, 904-938, 2jl8:A, 908-934, 2v47:A, 877-911, 2v47:A, 881-907, 2v49:A, 877-911, 2v49:A, 881-907, 3d5b:A, 889-929, 3d5d:A, 889-929
U-U
1vs6:B, 868-893, 1vs6:B, 872-889, 1vs6:B, 868-893, 1vs6:B, 872-889, 1vs8:B, 868-893, 1vs8:B, 872-889, 1vs8:B, 868-893, 1vs8:B, 872-889, 2aw4:B, 868-893, 2aw4:B, 872-889, 2aw4:B, 868-893, 2aw4:B, 872-889, 2awb:B, 868-893, 2awb:B, 872-889, 2awb:B, 868-893, 2awb:B, 872-889, 2i2t:B, 868-893, 2i2t:B, 872-889, 2i2t:B, 868-893, 2i2t:B, 872-889, 2i2v:B, 868-893, 2i2v:B, 872-889, 2i2v:B, 868-893, 2i2v:B, 872-889, 2j28:B, 868-893, 2j28:B, 872-889, 2j28:B, 868-893, 2j28:B, 872-889, 2qam:B, 868-893, 2qam:B, 872-889, 2qam:B, 868-893, 2qam:B, 872-889, 2qao:B, 868-893, 2qao:B, 872-889, 2qao:B, 868-893, 2qao:B, 872-889, 2qba:B, 868-893, 2qba:B, 872-889, 2qba:B, 868-893, 2qba:B, 872-889, 2qbc:B, 868-893, 2qbc:B, 872-889, 2qbc:B, 868-893, 2qbc:B, 872-889, 2qbe:B, 868-893, 2qbe:B, 872-889, 2qbe:B, 868-893, 2qbe:B, 872-889, 2qbg:B, 868-893, 2qbg:B, 872-889, 2qbg:B, 868-893, 2qbg:B, 872-889, 2qbi:B, 868-893, 2qbi:B, 872-889, 2qbi:B, 868-893, 2qbi:B, 872-889, 2qbk:B, 868-893, 2qbk:B, 872-889, 2qbk:B, 868-893, 2qbk:B, 872-889, 2qov:B, 868-893, 2qov:B, 872-889, 2qov:B, 868-893, 2qov:B, 872-889, 2qox:B, 868-893, 2qox:B, 872-889, 2qox:B, 868-893, 2qox:B, 872-889, 2qoz:B, 868-893, 2qoz:B, 872-889, 2qoz:B, 868-893, 2qoz:B, 872-889, 2qp1:B, 868-893, 2qp1:B, 872-889, 2qp1:B, 868-893, 2qp1:B, 872-889, 2z4l:B, 868-893, 2z4l:B, 872-889, 2z4l:B, 868-893, 2z4l:B, 872-889, 2z4n:B, 868-893, 2z4n:B, 872-889, 2z4n:B, 868-893, 2z4n:B, 872-889, 3bbx:B, 871-968, 3bbx:B, 875-964, 3bbx:B, 871-968, 3bbx:B, 875-964, 3df2:B, 868-893, 3df2:B, 872-889, 3df2:B, 868-893, 3df2:B, 872-889, 3df4:B, 868-893, 3df4:B, 872-889, 3df4:B, 868-893, 3df4:B, 872-889