Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(1-1)-Internal loop cluster 744 (cutoff=1.0 Å)
Cluster size 133 structure(s)
Representative structure 1ond:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence D-D
Cluster members
A-A
2frl:A, 1-23, 2frl:A, 7-17, 2frl:A, 1-23, 2frl:A, 7-17
A-G
1fjg:A, 62-92, 1fjg:A, 65-89, 1hnw:A, 62-92, 1hnw:A, 65-89, 1hnx:A, 62-92, 1hnx:A, 65-89, 1hnz:A, 62-92, 1hnz:A, 65-89, 1hr0:A, 62-92, 1hr0:A, 65-89, 1ibk:A, 62-92, 1ibk:A, 65-89, 1ibl:A, 62-92, 1ibl:A, 65-89, 1ibm:A, 62-92, 1ibm:A, 65-89, 1j5e:A, 62-92, 1j5e:A, 65-89, 1xmo:A, 62-92, 1xmo:A, 65-89, 1xmq:A, 62-92, 1xmq:A, 65-89, 1xnq:A, 62-92, 1xnq:A, 65-89, 1xnr:A, 62-92, 1xnr:A, 65-89, 2e5l:A, 63-93, 2e5l:A, 66-90, 2hhh:A, 62-92, 2hhh:A, 65-89, 2uu9:A, 62-92, 2uu9:A, 65-89, 2uua:A, 62-92, 2uua:A, 65-89, 2uub:A, 62-92, 2uub:A, 65-89, 2uuc:A, 62-92, 2uuc:A, 65-89, 2uxb:A, 62-92, 2uxc:A, 62-92, 2uxc:A, 65-89, 2vqe:A, 62-92, 2vqe:A, 65-89, 2vqf:A, 62-92, 2vqf:A, 65-89
G-A
1fjg:A, 62-92, 1fjg:A, 65-89, 1hnw:A, 62-92, 1hnw:A, 65-89, 1hnx:A, 62-92, 1hnx:A, 65-89, 1hnz:A, 62-92, 1hnz:A, 65-89, 1hr0:A, 62-92, 1hr0:A, 65-89, 1ibk:A, 62-92, 1ibk:A, 65-89, 1ibl:A, 62-92, 1ibl:A, 65-89, 1ibm:A, 62-92, 1ibm:A, 65-89, 1j5e:A, 62-92, 1j5e:A, 65-89, 1n32:A, 62-92, 1n32:A, 65-89, 1n33:A, 62-92, 1n33:A, 65-89, 1xmo:A, 62-92, 1xmo:A, 65-89, 1xmq:A, 62-92, 1xmq:A, 65-89, 1xnq:A, 62-92, 1xnq:A, 65-89, 1xnr:A, 62-92, 1xnr:A, 65-89, 2b64:A, 62-92, 2b64:A, 65-89, 2b9m:A, 62-92, 2b9m:A, 65-89, 2b9o:A, 62-92, 2b9o:A, 65-89, 2e5l:A, 63-93, 2e5l:A, 66-90, 2f4v:A, 62-92, 2f4v:A, 65-89, 2hgp:A, 62-92, 2hgp:A, 65-89, 2hgr:A, 62-92, 2hgr:A, 65-89, 2hhh:A, 62-92, 2hhh:A, 65-89, 2j00:A, 62-92, 2j00:A, 65-89, 2j02:A, 62-92, 2j02:A, 65-89, 2jl5:A, 62-92, 2jl7:A, 62-92, 2uu9:A, 62-92, 2uu9:A, 65-89, 2uua:A, 62-92, 2uua:A, 65-89, 2uub:A, 62-92, 2uub:A, 65-89, 2uuc:A, 62-92, 2uuc:A, 65-89, 2uxb:A, 62-92, 2uxc:A, 62-92, 2uxc:A, 65-89, 2uxd:A, 62-89, 2v46:A, 62-92, 2v46:A, 65-89, 2v48:A, 62-92, 2v48:A, 65-89, 2vqe:A, 62-92, 2vqe:A, 65-89, 2vqf:A, 62-92, 2vqf:A, 65-89
G-U
1nkw:0, 338-362, 1nkw:0, 343-357, 1nwx:0, 338-362, 1nwx:0, 343-357, 1nwy:0, 338-362, 1nwy:0, 343-357, 1ond:0, 338-362, 1ond:0, 343-357, 2ogn:0, 2048-2064, 2ogn:0, 2051-2061
U-G
2ogn:0, 2048-2064, 2ogn:0, 2051-2061