Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(1-1)-Internal loop cluster 1237 (cutoff=1.0 Å)
Cluster size 240 structure(s)
Representative structure 1vq8:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence C-A
Cluster members
C-A
1ffk:0, 1655-1957, 1ffk:0, 1664-1948, 1j5a:A, 1615-1929, 1j5a:A, 1624-1920, 1jj2:0, 1705-2007, 1jj2:0, 1714-1998, 1jzx:A, 1615-1929, 1jzx:A, 1624-1920, 1jzy:A, 1615-1929, 1jzy:A, 1624-1920, 1jzz:A, 1615-1929, 1jzz:A, 1624-1920, 1k01:A, 1615-1929, 1k01:A, 1624-1920, 1k73:A, 1705-2007, 1k73:A, 1714-1998, 1k8a:A, 1705-2007, 1k8a:A, 1714-1998, 1k9m:A, 1705-2007, 1k9m:A, 1714-1998, 1kc8:A, 1705-2007, 1kc8:A, 1714-1998, 1kd1:A, 1705-2007, 1kd1:A, 1714-1998, 1kqs:0, 1705-2007, 1kqs:0, 1714-1998, 1m1k:A, 1705-2007, 1m1k:A, 1714-1998, 1m90:A, 1705-2007, 1m90:A, 1714-1998, 1n8r:A, 1705-2007, 1n8r:A, 1714-1998, 1nji:A, 1705-2007, 1nji:A, 1714-1998, 1nwx:0, 1607-1921, 1nwx:0, 1616-1912, 1nwy:0, 1607-1921, 1nwy:0, 1616-1912, 1ond:0, 1606-1920, 1ond:0, 1615-1911, 1q7y:A, 1705-2007, 1q7y:A, 1714-1998, 1q81:A, 1705-2007, 1q81:A, 1714-1998, 1q82:A, 1705-2007, 1q82:A, 1714-1998, 1q86:A, 1705-2007, 1q86:A, 1714-1998, 1qvf:0, 1705-2007, 1qvf:0, 1714-1998, 1qvg:0, 1705-2007, 1qvg:0, 1714-1998, 1s1i:3, 1813-2193, 1s1i:3, 1822-2184, 1s72:0, 1705-2007, 1s72:0, 1714-1998, 1sm1:0, 1607-1921, 1sm1:0, 1616-1912, 1vq4:0, 1705-2007, 1vq4:0, 1714-1998, 1vq5:0, 1705-2007, 1vq5:0, 1714-1998, 1vq6:0, 1705-2007, 1vq6:0, 1714-1998, 1vq7:0, 1705-2007, 1vq7:0, 1714-1998, 1vq8:0, 1705-2007, 1vq8:0, 1714-1998, 1vq9:0, 1705-2007, 1vq9:0, 1714-1998, 1vqk:0, 1705-2007, 1vqk:0, 1714-1998, 1vql:0, 1705-2007, 1vql:0, 1714-1998, 1vqm:0, 1705-2007, 1vqm:0, 1714-1998, 1vqn:0, 1705-2007, 1vqn:0, 1714-1998, 1vqo:0, 1705-2007, 1vqo:0, 1714-1998, 1vqp:0, 1705-2007, 1vqp:0, 1714-1998, 1vs6:B, 1640-1988, 1vs6:B, 1649-1979, 1vs8:B, 1640-1988, 1vs8:B, 1649-1979, 1w2b:0, 1705-2007, 1w2b:0, 1714-1998, 1y69:0, 1607-1921, 1y69:0, 1616-1912, 1yhq:0, 1705-2007, 1yhq:0, 1714-1998, 1yi2:0, 1705-2007, 1yi2:0, 1714-1998, 1yij:0, 1705-2007, 1yij:0, 1714-1998, 1yit:0, 1705-2007, 1yit:0, 1714-1998, 1yj9:0, 1705-2007, 1yj9:0, 1714-1998, 1yjn:0, 1705-2007, 1yjn:0, 1714-1998, 1yjw:0, 1705-2007, 1yjw:0, 1714-1998, 2aar:0, 1607-1921, 2aar:0, 1616-1912, 2aw4:B, 1640-1988, 2aw4:B, 1649-1979, 2awb:B, 1640-1988, 2awb:B, 1649-1979, 2b66:A, 1681-2004, 2b66:A, 1690-1995, 2b9n:A, 1681-2004, 2b9n:A, 1690-1995, 2b9p:A, 1681-2004, 2b9p:A, 1690-1995, 2d3o:0, 1607-1921, 2d3o:0, 1616-1912, 2hgj:A, 1681-2004, 2hgj:A, 1690-1995, 2hgq:A, 1681-2004, 2hgq:A, 1690-1995, 2hgu:A, 1681-2004, 2hgu:A, 1690-1995, 2i2t:B, 1640-1988, 2i2t:B, 1649-1979, 2i2v:B, 1640-1988, 2i2v:B, 1649-1979, 2j01:A, 1598-1921, 2j01:A, 1607-1912, 2j03:A, 1598-1921, 2j03:A, 1607-1912, 2j28:B, 1640-1988, 2j28:B, 1649-1979, 2jl6:A, 1677-2000, 2jl6:A, 1686-1991, 2jl8:A, 1677-2000, 2jl8:A, 1686-1991, 2o43:A, 1607-1921, 2o43:A, 1616-1912, 2o44:A, 1607-1921, 2o44:A, 1616-1912, 2o45:A, 1604-1918, 2o45:A, 1613-1909, 2ogm:0, 1607-1921, 2ogm:0, 1616-1912, 2ogn:0, 1607-1921, 2ogn:0, 1616-1912, 2ogo:0, 1606-1920, 2ogo:0, 1615-1911, 2otj:0, 1705-2007, 2otj:0, 1714-1998, 2otl:0, 1705-2007, 2otl:0, 1714-1998, 2qa4:0, 1710-2012, 2qa4:0, 1719-2003, 2qam:B, 1640-1988, 2qam:B, 1649-1979, 2qao:B, 1640-1988, 2qao:B, 1649-1979, 2qba:B, 1640-1988, 2qba:B, 1649-1979, 2qbc:B, 1640-1988, 2qbc:B, 1649-1979, 2qbe:B, 1640-1988, 2qbe:B, 1649-1979, 2qbg:B, 1640-1988, 2qbg:B, 1649-1979, 2qbi:B, 1640-1988, 2qbi:B, 1649-1979, 2qbk:B, 1640-1988, 2qbk:B, 1649-1979, 2qex:0, 1705-2007, 2qex:0, 1714-1998, 2qov:B, 1640-1988, 2qov:B, 1649-1979, 2qox:B, 1640-1988, 2qox:B, 1649-1979, 2qoz:B, 1640-1988, 2qoz:B, 1649-1979, 2qp1:B, 1640-1988, 2qp1:B, 1649-1979, 2z4l:B, 1640-1988, 2z4l:B, 1649-1979, 2z4n:B, 1640-1988, 2z4n:B, 1649-1979, 2zjp:X, 1585-1882, 2zjp:X, 1594-1873, 2zjq:X, 1585-1882, 2zjq:X, 1594-1873, 2zjr:X, 1582-1879, 2zjr:X, 1591-1870, 3bbo:A, 1618-1936, 3bbo:A, 1623-1931, 3bbx:B, 1724-2084, 3bbx:B, 1733-2075, 3cc2:0, 1705-2007, 3cc2:0, 1714-1998, 3cc4:0, 1705-2007, 3cc4:0, 1714-1998, 3cc7:0, 1705-2007, 3cc7:0, 1714-1998, 3cce:0, 1705-2007, 3cce:0, 1714-1998, 3ccj:0, 1705-2007, 3ccj:0, 1714-1998, 3ccl:0, 1705-2007, 3ccl:0, 1714-1998, 3ccm:0, 1705-2007, 3ccm:0, 1714-1998, 3ccq:0, 1705-2007, 3ccq:0, 1714-1998, 3ccr:0, 1705-2007, 3ccr:0, 1714-1998, 3ccs:0, 1705-2007, 3ccs:0, 1714-1998, 3ccu:0, 1705-2007, 3ccu:0, 1714-1998, 3ccv:0, 1705-2007, 3ccv:0, 1714-1998, 3cd6:0, 1705-2007, 3cd6:0, 1714-1998, 3cf5:X, 1585-1882, 3cf5:X, 1594-1873, 3cma:0, 1705-2007, 3cma:0, 1714-1998, 3cme:0, 1705-2007, 3cme:0, 1714-1998, 3cpw:0, 1705-2007, 3cpw:0, 1714-1998, 3d5b:A, 1676-1999, 3d5b:A, 1685-1990, 3d5d:A, 1676-1999, 3d5d:A, 1685-1990, 3df2:B, 1640-1988, 3df2:B, 1649-1979, 3df4:B, 1640-1988, 3df4:B, 1649-1979, 3dll:X, 1585-1882, 3dll:X, 1594-1873