Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(1-1)-Internal loop cluster 3521 (cutoff=0.5 Å with sequence identity)
Cluster size 97 structure(s)
Representative structure 3cme:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence C-U
Cluster members
C-U
1fjg:A, 173-196, 1fjg:A, 178-191, 1hnw:A, 173-196, 1hnw:A, 178-191, 1hnx:A, 173-196, 1hnx:A, 178-191, 1hnz:A, 173-196, 1hnz:A, 178-191, 1hr0:A, 173-196, 1hr0:A, 178-191, 1i94:A, 176-199, 1i94:A, 181-194, 1i95:A, 176-199, 1i95:A, 181-194, 1i96:A, 176-199, 1i96:A, 181-194, 1ibk:A, 173-196, 1ibk:A, 178-191, 1ibl:A, 173-196, 1ibl:A, 178-191, 1ibm:A, 173-196, 1ibm:A, 178-191, 1j5e:A, 173-196, 1j5e:A, 178-191, 1n32:A, 173-196, 1n32:A, 178-191, 1n33:A, 173-196, 1n33:A, 178-191, 1n36:A, 173-196, 1n36:A, 178-191, 1s1h:A, 175-198, 1s1h:A, 180-193, 1xmq:A, 173-196, 1xnr:A, 173-196, 1yhq:0, 547-594, 1yi2:0, 547-594, 1yij:0, 547-594, 1yit:0, 547-594, 1yj9:0, 547-594, 1yjw:0, 547-594, 2b64:A, 175-194, 2b64:A, 178-191, 2b9m:A, 175-194, 2b9m:A, 178-191, 2b9o:A, 175-194, 2b9o:A, 178-191, 2e5l:A, 174-197, 2e5l:A, 179-192, 2f4v:A, 173-196, 2f4v:A, 178-191, 2gya:0, 1976-2079, 2gya:0, 1988-2067, 2hgi:A, 173-196, 2hgi:A, 178-191, 2hgp:A, 173-196, 2hgp:A, 178-191, 2hgr:A, 173-196, 2hgr:A, 178-191, 2hhh:A, 173-196, 2hhh:A, 178-191, 2j00:A, 173-196, 2j00:A, 178-191, 2j02:A, 173-196, 2j02:A, 178-191, 2qp1:B, 2077-2143, 2uu9:A, 173-196, 2uu9:A, 178-191, 2uua:A, 173-196, 2uua:A, 178-191, 2uub:A, 173-196, 2uub:A, 178-191, 2uuc:A, 173-196, 2uuc:A, 178-191, 2uxb:A, 173-196, 2uxb:A, 178-191, 2uxc:A, 173-196, 2uxc:A, 178-191, 2vqe:A, 173-196, 2vqe:A, 178-191, 2vqf:A, 173-196, 2vqf:A, 178-191, 3cc2:0, 547-594, 3cc4:0, 547-594, 3cce:0, 547-594, 3ccl:0, 547-594, 3ccm:0, 547-594, 3ccq:0, 547-594, 3ccs:0, 547-594, 3ccu:0, 547-594, 3ccv:0, 547-594, 3cd6:0, 547-594, 3cma:0, 547-594, 3cme:0, 547-594, 3d5a:A, 173-196, 3d5a:A, 178-191, 3d5c:A, 173-196, 3d5c:A, 178-191