Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(1-1)-Internal loop cluster 3680 (cutoff=0.5 Å)
Cluster size 55 structure(s)
Representative structure 3diz:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence R-R
Cluster members
A-G
1fjg:A, 1387-1464, 1ibl:A, 1387-1464, 1ibm:A, 1387-1464, 1n36:A, 1389-1462, 1xmo:A, 1381-1458, 1xnq:A, 1381-1458, 2f4v:A, 1389-1462, 2gy9:A, 1368-1445, 2hgr:A, 1387-1464, 2i2p:A, 1405-1487, 2i2u:A, 1405-1487, 2j00:A, 1387-1464, 2j02:A, 1387-1464, 2om7:C, 9-86, 2qal:A, 1405-1487, 2qan:A, 1405-1487, 2qbf:A, 1405-1487, 2qou:A, 1405-1487, 2qow:A, 1406-1486, 2qoy:A, 1405-1487, 2qp0:A, 1405-1487, 2uub:A, 1387-1464, 2uxc:A, 1387-1464, 2v46:A, 1387-1464, 2vqf:A, 1387-1464, 2z4k:A, 1406-1486, 3d0x:A, 111-137, 3d0x:A, 114-134, 3df1:A, 1405-1487
G-A
3d0u:A, 111-137, 3d0u:A, 114-134, 3dig:X, 114-140, 3dig:X, 117-137, 3dil:A, 114-140, 3dil:A, 117-137, 3dim:A, 114-140, 3dim:A, 117-137, 3dio:X, 114-140, 3dio:X, 117-137, 3diq:A, 114-140, 3diq:A, 117-137, 3dir:A, 114-140, 3dir:A, 117-137, 3dis:A, 114-140, 3dis:A, 117-137, 3dix:A, 114-140, 3dix:A, 117-137, 3diy:A, 114-140, 3diy:A, 117-137, 3diz:A, 114-140, 3diz:A, 117-137, 3dj0:A, 114-140, 3dj0:A, 117-137, 3dj2:A, 114-140, 3dj2:A, 117-137