Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(015)-Segment cluster 76 (cutoff=2.5 Å)
Cluster size 105 structure(s)
Representative structure 1s1i:3 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence GAAYUHMGCAADHUV
Cluster members
GAACUAGGCAAAAUG
1vs6:B, 1650-1666, 1vs8:B, 1650-1666, 2aw4:B, 1650-1666, 2awb:B, 1650-1666, 2i2t:B, 1650-1666, 2i2v:B, 1650-1666, 2j28:B, 1650-1666, 2qam:B, 1650-1666, 2qao:B, 1650-1666, 2qba:B, 1650-1666, 2qbc:B, 1650-1666, 2qbe:B, 1650-1666, 2qbg:B, 1650-1666, 2qbi:B, 1650-1666, 2qbk:B, 1650-1666, 2qov:B, 1650-1666, 2qox:B, 1650-1666, 2qoz:B, 1650-1666, 2qp1:B, 1650-1666, 2z4l:B, 1650-1666, 2z4n:B, 1650-1666, 3df2:B, 1650-1666, 3df4:B, 1650-1666
GAACUCGGCAAAAUA
3bbo:A, 1624-1640
GAACUCUGCAAGUUG
1vsa:w, 1691-1707, 1vsp:w, 1691-1707, 2j01:A, 1608-1624, 2j03:A, 1608-1624, 2jl6:A, 1687-1703, 2jl8:A, 1687-1703, 3d5b:A, 1686-1702, 3d5d:A, 1686-1702
GAACUUUGCAAUCUC
1j5a:A, 1625-1641, 1jzx:A, 1625-1641, 1jzy:A, 1625-1641, 1jzz:A, 1625-1641, 1k01:A, 1625-1641, 1nwx:0, 1617-1633, 1nwy:0, 1617-1633, 1ond:0, 1616-1632, 1vor:B, 1633-1649, 1vou:B, 1633-1649, 1vow:B, 1633-1649, 1voy:B, 1633-1649, 1vp0:B, 1633-1649, 2ogo:0, 1616-1632
GAAUUCGGCAAGUUA
1ffk:0, 1665-1681, 1jj2:0, 1715-1731, 1k73:A, 1715-1731, 1k8a:A, 1715-1731, 1k9m:A, 1715-1731, 1kc8:A, 1715-1731, 1kd1:A, 1715-1731, 1kqs:0, 1715-1731, 1m1k:A, 1715-1731, 1m90:A, 1715-1731, 1n8r:A, 1715-1731, 1nji:A, 1715-1731, 1q7y:A, 1715-1731, 1q81:A, 1715-1731, 1q82:A, 1715-1731, 1q86:A, 1715-1731, 1qvf:0, 1715-1731, 1qvg:0, 1715-1731, 1s1i:3, 1823-1839, 1s72:0, 1715-1731, 1vq4:0, 1715-1731, 1vq5:0, 1715-1731, 1vq6:0, 1715-1731, 1vq7:0, 1715-1731, 1vq8:0, 1715-1731, 1vq9:0, 1715-1731, 1vqk:0, 1715-1731, 1vql:0, 1715-1731, 1vqm:0, 1715-1731, 1vqn:0, 1715-1731, 1vqo:0, 1715-1731, 1vqp:0, 1715-1731, 1w2b:0, 1715-1731, 1yhq:0, 1715-1731, 1yi2:0, 1715-1731, 1yij:0, 1715-1731, 1yit:0, 1715-1731, 1yj9:0, 1715-1731, 1yjn:0, 1715-1731, 1yjw:0, 1715-1731, 2otj:0, 1715-1731, 2otl:0, 1715-1731, 2qex:0, 1715-1731, 3cc2:0, 1715-1731, 3cc4:0, 1715-1731, 3cc7:0, 1715-1731, 3cce:0, 1715-1731, 3ccj:0, 1715-1731, 3ccl:0, 1715-1731, 3ccm:0, 1715-1731, 3ccq:0, 1715-1731, 3ccr:0, 1715-1731, 3ccs:0, 1715-1731, 3ccu:0, 1715-1731, 3ccv:0, 1715-1731, 3cd6:0, 1715-1731, 3cma:0, 1715-1731, 3cme:0, 1715-1731, 3cpw:0, 1715-1731