Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(013)-Segment cluster 326 (cutoff=3.0 Å)
Cluster size 130 structure(s)
Representative structure 2ogo:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence MGMYHUAGYGAWC
Cluster members
GGGCCUAGUGAAC
1vsa:w, 2371-2385, 1vsp:w, 2371-2385, 1yl3:A, 2357-2371, 2b66:A, 2299-2313, 2b9n:A, 2299-2313, 2b9p:A, 2299-2313, 2hgj:A, 2371-2385, 2hgq:A, 2371-2385, 2hgu:A, 2371-2385, 2j01:A, 2259-2273, 2j03:A, 2259-2273, 2jl6:A, 2338-2352, 2jl8:A, 2338-2352, 3d5b:A, 2366-2380, 3d5d:A, 2366-2380
GGGCUUAGUGAAC
1njm:0, 2273-2287, 1njn:0, 2273-2287, 1njo:0, 2273-2287, 1njp:0, 2273-2287, 1nkw:0, 2273-2287, 1nwx:0, 2273-2287, 1nwy:0, 2273-2287, 1ond:0, 2272-2286, 1pnu:0, 2317-2331, 1pny:0, 2317-2331, 1sm1:0, 2273-2287, 1vor:B, 2317-2331, 1vou:B, 2317-2331, 1vow:B, 2317-2331, 1voy:B, 2317-2331, 1vp0:B, 2317-2331, 1xbp:0, 2273-2287, 1y69:0, 2273-2287, 1z58:2, 2252-2266, 2aar:0, 2273-2287, 2d3o:0, 2294-2308, 2o43:A, 2273-2287, 2o44:A, 2273-2287, 2o45:A, 2261-2275, 2ogm:0, 2273-2287, 2ogn:0, 2273-2287, 2ogo:0, 2272-2286, 2zjp:X, 2184-2198, 2zjq:X, 2184-2198, 2zjr:X, 2181-2195, 3cf5:X, 2184-2198, 3dll:X, 2184-2198
GGUCAUAGUGAUC
1vs6:B, 2328-2342, 1vs8:B, 2328-2342, 2aw4:B, 2328-2342, 2awb:B, 2328-2342, 2i2t:B, 2328-2342, 2i2v:B, 2328-2342, 2j28:B, 2328-2342, 2qam:B, 2328-2342, 2qao:B, 2328-2342, 2qba:B, 2328-2342, 2qbc:B, 2328-2342, 2qbe:B, 2328-2342, 2qbg:B, 2328-2342, 2qbi:B, 2328-2342, 2qbk:B, 2328-2342, 2qov:B, 2328-2342, 2qox:B, 2328-2342, 2qoz:B, 2328-2342, 2qp1:B, 2328-2342, 2z4l:B, 2328-2342, 2z4n:B, 2328-2342, 3df2:B, 2328-2342, 3df4:B, 2328-2342
UGGUCUAGCGAAC
1ffk:0, 2231-2245, 1ffz:A, 257-271, 1fg0:A, 257-271, 1jj2:0, 2281-2295, 1k73:A, 2281-2295, 1k8a:A, 2281-2295, 1k9m:A, 2281-2295, 1kc8:A, 2281-2295, 1kd1:A, 2281-2295, 1m1k:A, 2281-2295, 1m90:A, 2281-2295, 1n8r:A, 2281-2295, 1nji:A, 2281-2295, 1q7y:A, 2281-2295, 1q81:A, 2281-2295, 1q82:A, 2281-2295, 1q86:A, 2281-2295, 1qvf:0, 2281-2295, 1qvg:0, 2281-2295, 1s1i:3, 2598-2612, 1s72:0, 2281-2295, 1vq4:0, 2281-2295, 1vq5:0, 2281-2295, 1vq6:0, 2281-2295, 1vq7:0, 2281-2295, 1vq8:0, 2281-2295, 1vq9:0, 2281-2295, 1vqk:0, 2281-2295, 1vql:0, 2281-2295, 1vqm:0, 2281-2295, 1vqn:0, 2281-2295, 1vqo:0, 2281-2295, 1vqp:0, 2281-2295, 1w2b:0, 2281-2295, 1yhq:0, 2281-2295, 1yi2:0, 2281-2295, 1yij:0, 2281-2295, 1yit:0, 2281-2295, 1yj9:0, 2281-2295, 1yjn:0, 2281-2295, 1yjw:0, 2281-2295, 2otj:0, 2281-2295, 2otl:0, 2281-2295, 2qa4:0, 2286-2300, 2qex:0, 2281-2295, 3cc2:0, 2281-2295, 3cc4:0, 2281-2295, 3cc7:0, 2281-2295, 3cce:0, 2281-2295, 3ccl:0, 2281-2295, 3ccm:0, 2281-2295, 3ccq:0, 2281-2295, 3ccr:0, 2281-2295, 3ccs:0, 2281-2295, 3ccu:0, 2281-2295, 3ccv:0, 2281-2295, 3cd6:0, 2281-2295, 3cma:0, 2281-2295, 3cme:0, 2281-2295, 3cpw:0, 2281-2295