Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(011)-Segment cluster 491 (cutoff=2.0 Å)
Cluster size 73 structure(s)
Representative structure 2uub:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence BYAGUYCGGAU
Cluster members
CCAGUUCGGAU
1fjg:A, 1273-1285, 1hnw:A, 1273-1285, 1hnx:A, 1273-1285, 1hnz:A, 1273-1285, 1hr0:A, 1273-1285, 1i94:A, 1276-1288, 1i95:A, 1276-1288, 1i96:A, 1276-1288, 1ibk:A, 1273-1285, 1ibl:A, 1273-1285, 1ibm:A, 1273-1285, 1j5e:A, 1273-1285, 1n32:A, 1273-1285, 1n33:A, 1273-1285, 1n34:A, 1273-1285, 1pns:A, 1289-1301, 1pnx:A, 1289-1301, 1s1h:A, 1274-1286, 1xmo:A, 1268-1280, 1xmq:A, 1268-1280, 1xnq:A, 1268-1280, 1xnr:A, 1268-1280, 1yl4:A, 1273-1285, 2b64:A, 1273-1285, 2b9m:A, 1273-1285, 2b9o:A, 1273-1285, 2e5l:A, 1274-1286, 2f4v:A, 1273-1285, 2hgi:A, 1273-1285, 2hgp:A, 1273-1285, 2hgr:A, 1273-1285, 2hhh:A, 1273-1285, 2j00:A, 1273-1285, 2j02:A, 1273-1285, 2jl5:A, 1273-1285, 2jl7:A, 1273-1285, 2ow8:y, 1273-1285, 2qnh:y, 1273-1285, 2uu9:A, 1273-1285, 2uua:A, 1273-1285, 2uub:A, 1273-1285, 2uuc:A, 1273-1285, 2uxb:A, 1273-1285, 2uxc:A, 1273-1285, 2uxd:A, 1251-1263, 2vqe:A, 1273-1285, 2vqf:A, 1273-1285, 3d5a:A, 1273-1285, 3d5c:A, 1273-1285
GUAGUCCGGAU
1vs5:A, 1292-1304, 1vs7:A, 1292-1304, 2avy:A, 1292-1304, 2aw7:A, 1292-1304, 2gy9:A, 1255-1267, 2i2p:A, 1292-1304, 2i2u:A, 1292-1304, 2qal:A, 1292-1304, 2qan:A, 1292-1304, 2qb9:A, 1292-1304, 2qbb:A, 1292-1304, 2qbd:A, 1292-1304, 2qbf:A, 1292-1304, 2qbh:A, 1292-1304, 2qbj:A, 1292-1304, 2qou:A, 1292-1304, 2qow:A, 1292-1304, 2qoy:A, 1292-1304, 2qp0:A, 1292-1304, 2z4k:A, 1292-1304, 2z4m:A, 1292-1304, 3df1:A, 1292-1304, 3df3:A, 1292-1304
UCAGUUCGGAU
3bbn:A, 1239-1251