Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(010)-Segment cluster 875 (cutoff=1.0 Å)
Cluster size 85 structure(s)
Representative structure 3cc7:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence SAAAAUGAUC
Cluster members
CAAAAUGAUC
1ffk:0, 1150-1161, 1jj2:0, 1197-1208, 1k73:A, 1197-1208, 1k8a:A, 1197-1208, 1k9m:A, 1197-1208, 1kc8:A, 1197-1208, 1kd1:A, 1197-1208, 1kqs:0, 1197-1208, 1m1k:A, 1197-1208, 1m90:A, 1197-1208, 1n8r:A, 1197-1208, 1nji:A, 1197-1208, 1q7y:A, 1197-1208, 1q81:A, 1197-1208, 1q82:A, 1197-1208, 1q86:A, 1197-1208, 1qvf:0, 1197-1208, 1qvg:0, 1197-1208, 1s72:0, 1197-1208, 1vq4:0, 1197-1208, 1vq5:0, 1197-1208, 1vq6:0, 1197-1208, 1vq7:0, 1197-1208, 1vq8:0, 1197-1208, 1vq9:0, 1197-1208, 1vqk:0, 1197-1208, 1vql:0, 1197-1208, 1vqm:0, 1197-1208, 1vqn:0, 1197-1208, 1vqo:0, 1197-1208, 1vqp:0, 1197-1208, 1w2b:0, 1197-1208, 1yhq:0, 1197-1208, 1yi2:0, 1197-1208, 1yij:0, 1197-1208, 1yit:0, 1197-1208, 1yj9:0, 1197-1208, 1yjn:0, 1197-1208, 1yjw:0, 1197-1208, 2otj:0, 1197-1208, 2otl:0, 1197-1208, 2qa4:0, 1202-1213, 3cc2:0, 1197-1208, 3cc4:0, 1197-1208, 3cc7:0, 1197-1208, 3cce:0, 1197-1208, 3ccj:0, 1197-1208, 3ccl:0, 1197-1208, 3ccm:0, 1197-1208, 3ccq:0, 1197-1208, 3ccr:0, 1197-1208, 3ccs:0, 1197-1208, 3ccu:0, 1197-1208, 3ccv:0, 1197-1208, 3cd6:0, 1197-1208, 3cma:0, 1197-1208, 3cme:0, 1197-1208, 3cpw:0, 1197-1208
GAAAAUGAUC
1j5a:A, 1077-1088, 1jzx:A, 1077-1088, 1jzy:A, 1077-1088, 1jzz:A, 1077-1088, 1k01:A, 1077-1088, 1vsp:w, 1149-1160, 1y69:0, 1069-1080, 2aar:0, 1069-1080, 2d3o:0, 1069-1080, 2j01:A, 1074-1085, 2j03:A, 1074-1085, 2jl6:A, 1153-1164, 2jl8:A, 1153-1164, 2o43:A, 1069-1080, 2o44:A, 1069-1080, 2ogm:0, 1069-1080, 2ogn:0, 1069-1080, 2ogo:0, 1068-1079, 2v47:A, 1074-1085, 2v49:A, 1074-1085, 2zjp:X, 1047-1058, 2zjq:X, 1047-1058, 2zjr:X, 1044-1055, 3cf5:X, 1047-1058, 3d5b:A, 1144-1155, 3d5d:A, 1144-1155, 3dll:X, 1047-1058