Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(006)-Hairpin cluster 1298 (cutoff=0.5 Å)
Cluster size 100 structure(s)
Representative structure 3bbx:B (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence GUAAYA
Cluster members
GUAACA
1jj2:0, 1165-1172, 1k73:A, 1165-1172, 1k8a:A, 1165-1172, 1k9m:A, 1165-1172, 1kc8:A, 1165-1172, 1kd1:A, 1165-1172, 1kqs:0, 1165-1172, 1m1k:A, 1165-1172, 1m90:A, 1165-1172, 1mms:C, 42-49, 1mms:D, 42-49, 1n8r:A, 1165-1172, 1nji:A, 1165-1172, 1oln:C, 42-49, 1q82:A, 1165-1172, 1q86:A, 1165-1172, 1qvf:0, 1165-1172, 1s1i:3, 1267-1274, 1s72:0, 1165-1172, 1vq4:0, 1165-1172, 1vq5:0, 1165-1172, 1vq6:0, 1165-1172, 1vq7:0, 1165-1172, 1vq8:0, 1165-1172, 1vq9:0, 1165-1172, 1vqk:0, 1165-1172, 1vql:0, 1165-1172, 1vqm:0, 1165-1172, 1vqn:0, 1165-1172, 1vqo:0, 1165-1172, 1vqp:0, 1165-1172, 1vs8:B, 712-719, 1w2b:0, 1165-1172, 1yhq:0, 1165-1172, 1yij:0, 1165-1172, 1yit:0, 1165-1172, 1yj9:0, 1165-1172, 1yjn:0, 1165-1172, 2awb:B, 712-719, 2j28:B, 712-719, 2otj:0, 1165-1172, 2otl:0, 1165-1172, 2qa4:0, 1170-1177, 2qam:B, 712-719, 2qao:B, 712-719, 2qba:B, 712-719, 2qbc:B, 712-719, 2qex:0, 1165-1172, 3cc2:0, 1165-1172, 3cc4:0, 1165-1172, 3cc7:0, 1165-1172, 3ccl:0, 1165-1172, 3ccm:0, 1165-1172, 3ccq:0, 1165-1172, 3ccu:0, 1165-1172, 3ccv:0, 1165-1172, 3cd6:0, 1165-1172, 3cma:0, 1165-1172, 3cme:0, 1165-1172, 3cpw:0, 1165-1172
GUAAUA
1c04:E, 42-49, 1c2w:B, 1092-1099, 1hc8:C, 42-49, 1hc8:D, 42-49, 1pnu:0, 1053-1060, 1pny:0, 1053-1060, 1qa6:C, 42-49, 1qa6:D, 42-49, 1vs6:B, 1076-1083, 1vs8:B, 1076-1083, 1y39:C, 42-49, 1y39:D, 42-49, 2aw4:B, 1076-1083, 2awb:B, 1076-1083, 2gya:0, 1019-1026, 2gyc:0, 1019-1026, 2i2t:B, 1076-1083, 2i2v:B, 1076-1083, 2j28:B, 1076-1083, 2qam:B, 1076-1083, 2qao:B, 1076-1083, 2qba:B, 1076-1083, 2qbc:B, 1076-1083, 2qbe:B, 1076-1083, 2qbg:B, 1076-1083, 2qbi:B, 1076-1083, 2qbk:B, 1076-1083, 2qov:B, 1076-1083, 2qox:B, 1076-1083, 2qoz:B, 1076-1083, 2qp1:B, 1076-1083, 2z4l:B, 1076-1083, 2z4n:B, 1076-1083, 3bbo:A, 1065-1072, 3bbx:B, 1154-1161, 3d5b:A, 1112-1119, 3d5d:A, 1112-1119, 3deg:G, 50-57, 3df2:B, 1076-1083, 3df4:B, 1076-1083