Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(009)-Segment cluster 994 (cutoff=3.0 Å)
Cluster size 98 structure(s)
Representative structure 3cme:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence SRVRWRRVS
Cluster members
CGAAAAGAC
1njm:0, 1971-1981, 1njn:0, 1971-1981, 1njo:0, 1971-1981, 1njp:0, 1971-1981, 1nkw:0, 1971-1981, 1nwx:0, 1971-1981, 1ond:0, 1970-1980, 1p9x:0, 1946-1956, 1pnu:0, 1996-2006, 1pny:0, 1996-2006, 1xbp:0, 1971-1981, 1y69:0, 1971-1981, 1z58:2, 1962-1972, 2aar:0, 1971-1981, 2d3o:0, 1971-1981, 2j01:A, 1971-1981, 2j03:A, 1971-1981, 2jl6:A, 2050-2060, 2jl8:A, 2050-2060, 2o43:A, 1971-1981, 2o44:A, 1971-1981, 2o45:A, 1968-1978, 2ogm:0, 1971-1981, 2ogn:0, 1971-1981, 2ogo:0, 1970-1980, 2zjq:X, 1932-1942, 2zjr:X, 1929-1939, 3cf5:X, 1932-1942, 3d5b:A, 2049-2059, 3d5d:A, 2049-2059, 3dll:X, 1932-1942
CGAAUGACC
1ffk:0, 553-563, 1jj2:0, 554-564, 1k73:A, 554-564, 1k8a:A, 554-564, 1k9m:A, 554-564, 1kc8:A, 554-564, 1kd1:A, 554-564, 1kqs:0, 554-564, 1m1k:A, 554-564, 1m90:A, 554-564, 1n8r:A, 554-564, 1nji:A, 554-564, 1q7y:A, 554-564, 1q81:A, 554-564, 1q82:A, 554-564, 1q86:A, 554-564, 1qvf:0, 554-564, 1qvg:0, 554-564, 1s72:0, 554-564, 1vq4:0, 554-564, 1vq5:0, 554-564, 1vq6:0, 554-564, 1vq7:0, 554-564, 1vq8:0, 554-564, 1vq9:0, 554-564, 1vqk:0, 554-564, 1vql:0, 554-564, 1vqm:0, 554-564, 1vqn:0, 554-564, 1vqo:0, 554-564, 1vqp:0, 554-564, 1w2b:0, 554-564, 1yhq:0, 554-564, 1yi2:0, 554-564, 1yij:0, 554-564, 1yit:0, 554-564, 1yj9:0, 554-564, 1yjn:0, 554-564, 1yjw:0, 554-564, 2otj:0, 554-564, 2otl:0, 554-564, 2qex:0, 554-564, 3cc2:0, 554-564, 3cc4:0, 554-564, 3cc7:0, 554-564, 3cce:0, 554-564, 3ccj:0, 554-564, 3ccl:0, 554-564, 3ccm:0, 554-564, 3ccq:0, 554-564, 3ccr:0, 554-564, 3ccs:0, 554-564, 3ccu:0, 554-564, 3ccv:0, 554-564, 3cd6:0, 554-564, 3cma:0, 554-564, 3cme:0, 554-564, 3cpw:0, 554-564
CGGAAAGAC
2gya:0, 1937-1947
GACGAAACC
1voq:A, 440-450, 1vos:A, 440-450, 1vov:A, 440-450, 1vox:A, 440-450, 1voz:A, 440-450, 2hgp:A, 436-446
GAGGAAGGG
2gy9:A, 423-433, 2gyb:A, 423-433