Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(009)-Segment cluster 807 (cutoff=2.0 Å)
Cluster size 71 structure(s)
Representative structure 2uub:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence AYGACGUCW
Cluster members
ACGACGUCU
1fjg:A, 1164-1174, 1hnw:A, 1164-1174, 1hnx:A, 1164-1174, 1hnz:A, 1164-1174, 1hr0:A, 1164-1174, 1i94:A, 1167-1177, 1i95:A, 1167-1177, 1i96:A, 1167-1177, 1ibk:A, 1164-1174, 1ibl:A, 1164-1174, 1ibm:A, 1164-1174, 1j5e:A, 1164-1174, 1n32:A, 1164-1174, 1n34:A, 1164-1174, 1pns:A, 1180-1190, 1pnx:A, 1180-1190, 1s1h:A, 1165-1175, 1voq:A, 1180-1190, 1vos:A, 1180-1190, 1vov:A, 1180-1190, 1vox:A, 1180-1190, 1voz:A, 1180-1190, 1xmo:A, 1159-1169, 1xmq:A, 1159-1169, 1xnq:A, 1159-1169, 1xnr:A, 1159-1169, 2e5l:A, 1165-1175, 2hhh:A, 1164-1174, 2j00:A, 1164-1174, 2j02:A, 1164-1174, 2jl5:A, 1164-1174, 2jl7:A, 1164-1174, 2ow8:y, 1164-1174, 2qnh:y, 1164-1174, 2uu9:A, 1164-1174, 2uua:A, 1164-1174, 2uub:A, 1164-1174, 2uuc:A, 1164-1174, 2uxc:A, 1164-1174, 2uxd:A, 1142-1152, 2v46:A, 1164-1174, 2v48:A, 1164-1174, 2vqe:A, 1164-1174, 2vqf:A, 1164-1174, 3d5a:A, 1164-1174, 3d5c:A, 1164-1174
AUGACGUCA
1vs5:A, 1183-1193, 1vs7:A, 1183-1193, 2avy:A, 1183-1193, 2aw7:A, 1183-1193, 2gy9:A, 1146-1156, 2gyb:A, 1146-1156, 2i2p:A, 1183-1193, 2i2u:A, 1183-1193, 2qal:A, 1183-1193, 2qan:A, 1183-1193, 2qb9:A, 1183-1193, 2qbb:A, 1183-1193, 2qbd:A, 1183-1193, 2qbf:A, 1183-1193, 2qbh:A, 1183-1193, 2qbj:A, 1183-1193, 2qou:A, 1183-1193, 2qow:A, 1183-1193, 2qoy:A, 1183-1193, 2qp0:A, 1183-1193, 2vho:A, 1183-1193, 2z4k:A, 1183-1193, 2z4m:A, 1183-1193, 3df1:A, 1183-1193, 3df3:A, 1183-1193