Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(005)-Hairpin cluster 1063 (cutoff=3.0 Å)
Cluster size 1747 structure(s)
Representative structure 2o45:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NNNNN
Cluster members
AAAAU
2zjp:X, 1420-1426, 2zjq:X, 1420-1426, 2zjr:X, 1417-1423, 3cf5:X, 1420-1426, 3dll:X, 1420-1426
AGCUU
2gy9:A, 74-80, 2gyb:A, 74-80
AGUAG
2ihx:B, 45-51
AGUAU
1ffk:0, 661-667, 1jj2:0, 662-668, 1k73:A, 662-668, 1k8a:A, 662-668, 1k9m:A, 662-668, 1kc8:A, 662-668, 1kd1:A, 662-668, 1kqs:0, 662-668, 1m1k:A, 662-668, 1m90:A, 662-668, 1n8r:A, 662-668, 1nji:A, 662-668, 1q7y:A, 662-668, 1q81:A, 662-668, 1q82:A, 662-668, 1q86:A, 662-668, 1qvf:0, 662-668, 1qvg:0, 662-668, 1s1i:3, 664-670, 1s72:0, 662-668, 1vq4:0, 662-668, 1vq5:0, 662-668, 1vq6:0, 662-668, 1vq7:0, 662-668, 1vq8:0, 662-668, 1vq9:0, 662-668, 1vqk:0, 662-668, 1vql:0, 662-668, 1vqm:0, 662-668, 1vqn:0, 662-668, 1vqo:0, 662-668, 1vqp:0, 662-668, 1w2b:0, 662-668, 1yhq:0, 662-668, 1yi2:0, 662-668, 1yij:0, 662-668, 1yit:0, 662-668, 1yj9:0, 662-668, 1yjn:0, 662-668, 1yjw:0, 662-668, 2otj:0, 662-668, 2otl:0, 662-668, 2qa4:0, 661-667, 2qex:0, 662-668, 3cc2:0, 662-668, 3cc4:0, 662-668, 3cc7:0, 662-668, 3cce:0, 662-668, 3ccj:0, 662-668, 3ccl:0, 662-668, 3ccm:0, 662-668, 3ccq:0, 662-668, 3ccr:0, 662-668, 3ccs:0, 662-668, 3ccu:0, 662-668, 3ccv:0, 662-668, 3cd6:0, 662-668, 3cma:0, 662-668, 3cme:0, 662-668, 3cpw:0, 662-668
AUCCA
2gya:0, 120-126, 2gyc:0, 120-126
AUCCC
1c2w:B, 885-891
AUCUU
1l8v:A, 131-137, 1l8v:B, 131-137
AUUAA
1c2w:B, 1779-1785
CAAAU
1c2w:B, 1492-1498, 1vs6:B, 1476-1482, 1vs8:B, 1476-1482, 1vsa:w, 1517-1523, 1vsp:w, 1517-1523, 2aw4:B, 1476-1482, 2awb:B, 1476-1482, 2hgj:A, 1516-1522, 2hgq:A, 1516-1522, 2hgu:A, 1516-1522, 2i2t:B, 1476-1482, 2i2v:B, 1476-1482, 2j01:A, 1442-1448, 2j03:A, 1442-1448, 2j28:B, 1476-1482, 2jl6:A, 1521-1527, 2jl8:A, 1521-1527, 2qam:B, 1476-1482, 2qao:B, 1476-1482, 2qba:B, 1476-1482, 2qbc:B, 1476-1482, 2qbe:B, 1476-1482, 2qbg:B, 1476-1482, 2qbi:B, 1476-1482, 2qbk:B, 1476-1482, 2qov:B, 1476-1482, 2qox:B, 1476-1482, 2qoz:B, 1476-1482, 2qp1:B, 1476-1482, 2v47:A, 1442-1448, 2v49:A, 1442-1448, 2vhm:B, 1476-1482, 2vhn:B, 1476-1482, 2z4l:B, 1476-1482, 2z4n:B, 1476-1482, 3bbx:B, 1557-1563, 3d5b:A, 1512-1518, 3d5d:A, 1512-1518, 3df2:B, 1476-1482, 3df4:B, 1476-1482
CAACU
1ffk:0, 1390-1396, 1jj2:0, 1437-1443, 1k73:A, 1437-1443, 1k8a:A, 1437-1443, 1k9m:A, 1437-1443, 1kc8:A, 1437-1443, 1kd1:A, 1437-1443, 1kqs:0, 1437-1443, 1m1k:A, 1437-1443, 1m90:A, 1437-1443, 1n8r:A, 1437-1443, 1nji:A, 1437-1443, 1q7y:A, 1437-1443, 1q81:A, 1437-1443, 1q82:A, 1437-1443, 1q86:A, 1437-1443, 1qvf:0, 1437-1443, 1qvg:0, 1437-1443, 1s1i:3, 1548-1554, 1s72:0, 1437-1443, 1vq4:0, 1437-1443, 1vq5:0, 1437-1443, 1vq6:0, 1437-1443, 1vq7:0, 1437-1443, 1vq8:0, 1437-1443, 1vq9:0, 1437-1443, 1vqk:0, 1437-1443, 1vql:0, 1437-1443, 1vqm:0, 1437-1443, 1vqn:0, 1437-1443, 1vqo:0, 1437-1443, 1vqp:0, 1437-1443, 1w2b:0, 1437-1443, 1yhq:0, 1437-1443, 1yi2:0, 1437-1443, 1yij:0, 1437-1443, 1yit:0, 1437-1443, 1yj9:0, 1437-1443, 1yjn:0, 1437-1443, 1yjw:0, 1437-1443, 2j37:Z, 135-141, 2otj:0, 1437-1443, 2otl:0, 1437-1443, 2qa4:0, 1442-1448, 2qex:0, 1437-1443, 3cc2:0, 1437-1443, 3cc4:0, 1437-1443, 3cc7:0, 1437-1443, 3cce:0, 1437-1443, 3ccj:0, 1437-1443, 3ccl:0, 1437-1443, 3ccm:0, 1437-1443, 3ccq:0, 1437-1443, 3ccr:0, 1437-1443, 3ccs:0, 1437-1443, 3ccu:0, 1437-1443, 3ccv:0, 1437-1443, 3cd6:0, 1437-1443, 3cma:0, 1437-1443, 3cme:0, 1437-1443, 3cpw:0, 1437-1443
CAGAA
1ffk:0, 484-490, 1jj2:0, 485-491, 1k73:A, 485-491, 1k8a:A, 485-491, 1k9m:A, 485-491, 1kc8:A, 485-491, 1kd1:A, 485-491, 1kqs:0, 485-491, 1m1k:A, 485-491, 1m90:A, 485-491, 1n8r:A, 485-491, 1nji:A, 485-491, 1q7y:A, 485-491, 1q81:A, 485-491, 1q82:A, 485-491, 1q86:A, 485-491, 1qvf:0, 485-491, 1qvg:0, 485-491, 1s1i:3, 484-490, 1s72:0, 485-491, 1vq4:0, 485-491, 1vq5:0, 485-491, 1vq6:0, 485-491, 1vq7:0, 485-491, 1vq8:0, 485-491, 1vq9:0, 485-491, 1vqk:0, 485-491, 1vql:0, 485-491, 1vqm:0, 485-491, 1vqn:0, 485-491, 1vqo:0, 485-491, 1vqp:0, 485-491, 1w2b:0, 485-491, 1yhq:0, 485-491, 1yi2:0, 485-491, 1yij:0, 485-491, 1yit:0, 485-491, 1yj9:0, 485-491, 1yjn:0, 485-491, 1yjw:0, 485-491, 2j37:Z, 14-20, 2otj:0, 485-491, 2otl:0, 485-491, 2qa4:0, 485-491, 2qex:0, 485-491, 3cc2:0, 485-491, 3cc4:0, 485-491, 3cc7:0, 485-491, 3cce:0, 485-491, 3ccj:0, 485-491, 3ccl:0, 485-491, 3ccm:0, 485-491, 3ccq:0, 485-491, 3ccr:0, 485-491, 3ccs:0, 485-491, 3ccu:0, 485-491, 3ccv:0, 485-491, 3cd6:0, 485-491, 3cma:0, 485-491, 3cme:0, 485-491, 3cpw:0, 485-491
CAGCC
2noq:A, 112-118
CGAAG
1sm1:0, 1118-1124, 1xbp:0, 1118-1124, 2d3o:0, 1118-1124, 2o43:A, 1118-1124, 2ogo:0, 1117-1123
CGCGA
1ffk:0, 208-214, 1jj2:0, 209-215, 1k73:A, 209-215, 1k8a:A, 209-215, 1k9m:A, 209-215, 1kc8:A, 209-215, 1kd1:A, 209-215, 1kqs:0, 209-215, 1m1k:A, 209-215, 1m90:A, 209-215, 1n8r:A, 209-215, 1nji:A, 209-215, 1q7y:A, 209-215, 1q81:A, 209-215, 1q82:A, 209-215, 1q86:A, 209-215, 1qvf:0, 209-215, 1qvg:0, 209-215, 1s1i:3, 208-214, 1s72:0, 209-215, 1vq4:0, 209-215, 1vq5:0, 209-215, 1vq6:0, 209-215, 1vq7:0, 209-215, 1vq8:0, 209-215, 1vq9:0, 209-215, 1vqk:0, 209-215, 1vql:0, 209-215, 1vqm:0, 209-215, 1vqn:0, 209-215, 1vqo:0, 209-215, 1vqp:0, 209-215, 1w2b:0, 209-215, 1yhq:0, 209-215, 1yi2:0, 209-215, 1yij:0, 209-215, 1yit:0, 209-215, 1yj9:0, 209-215, 1yjn:0, 209-215, 1yjw:0, 209-215, 2otj:0, 209-215, 2otl:0, 209-215, 2qa4:0, 209-215, 2qex:0, 209-215, 3cc2:0, 209-215, 3cc4:0, 209-215, 3cc7:0, 209-215, 3cce:0, 209-215, 3ccj:0, 209-215, 3ccl:0, 209-215, 3ccm:0, 209-215, 3ccq:0, 209-215, 3ccr:0, 209-215, 3ccs:0, 209-215, 3ccu:0, 209-215, 3ccv:0, 209-215, 3cd6:0, 209-215, 3cma:0, 209-215, 3cme:0, 209-215, 3cpw:0, 209-215
CUCAA
1fjg:A, 596-602, 1fka:A, 588-594, 1hnw:A, 596-602, 1hnz:A, 596-602, 1hr0:A, 596-602, 1i94:A, 599-605, 1i95:A, 599-605, 1i96:A, 599-605, 1ibk:A, 596-602, 1ibl:A, 596-602, 1ibm:A, 596-602, 1j5e:A, 596-602, 1k5i:A, 9-15, 1n32:A, 596-602, 1n33:A, 596-602, 1n34:A, 596-602, 1n36:A, 596-602, 1pns:A, 610-616, 1pns:A, 833-839, 1pnx:A, 610-616, 1pnx:A, 833-839, 1s1h:A, 601-607, 1voq:A, 610-616, 1vos:A, 610-616, 1vov:A, 610-616, 1vox:A, 610-616, 1voz:A, 610-616, 1vs5:A, 613-619, 1vs7:A, 613-619, 1xmo:A, 596-602, 1xmq:A, 596-602, 1xnq:A, 596-602, 1xnr:A, 596-602, 1yl4:A, 596-602, 2avy:A, 613-619, 2aw7:A, 613-619, 2b64:A, 596-602, 2b9m:A, 596-602, 2b9o:A, 596-602, 2e5l:A, 597-603, 2f4v:A, 596-602, 2gy9:A, 583-589, 2gyb:A, 583-589, 2hgi:A, 596-602, 2hgp:A, 596-602, 2hgr:A, 596-602, 2hhh:A, 596-602, 2i2p:A, 613-619, 2i2u:A, 613-619, 2jl5:A, 596-602, 2jl7:A, 596-602, 2ow8:y, 596-602, 2qal:A, 613-619, 2qan:A, 613-619, 2qb9:A, 613-619, 2qbb:A, 613-619, 2qbd:A, 613-619, 2qbf:A, 613-619, 2qbh:A, 613-619, 2qbj:A, 613-619, 2qnh:y, 596-602, 2qou:A, 613-619, 2qow:A, 613-619, 2qoy:A, 613-619, 2qp0:A, 613-619, 2uu9:A, 596-602, 2uua:A, 596-602, 2uub:A, 596-602, 2uuc:A, 596-602, 2uxb:A, 596-602, 2uxc:A, 596-602, 2uxd:A, 574-580, 2v46:A, 596-602, 2v48:A, 596-602, 2vho:A, 613-619, 2vhp:A, 613-619, 2vqe:A, 596-602, 2vqf:A, 596-602, 2z4k:A, 613-619, 2z4m:A, 613-619, 3bbn:A, 560-566, 3d5a:A, 596-602, 3d5c:A, 596-602, 3df1:A, 613-619, 3df3:A, 613-619
CUCGC
1c2w:B, 1727-1733, 1vs6:B, 1711-1717, 1vs8:B, 1711-1717, 2aw4:B, 1711-1717, 2awb:B, 1711-1717, 2gya:0, 1635-1641, 2gyc:0, 1635-1641, 2i2t:B, 1711-1717, 2i2v:B, 1711-1717, 2j28:B, 1711-1717, 2qam:B, 1711-1717, 2qao:B, 1711-1717, 2qba:B, 1711-1717, 2qbc:B, 1711-1717, 2qbe:B, 1711-1717, 2qbg:B, 1711-1717, 2qbi:B, 1711-1717, 2qbk:B, 1711-1717, 2qov:B, 1711-1717, 2qox:B, 1711-1717, 2qoz:B, 1711-1717, 2qp1:B, 1711-1717, 2z4l:B, 1711-1717, 2z4n:B, 1711-1717, 3bbx:B, 1798-1804, 3df2:B, 1711-1717, 3df4:B, 1711-1717
CUGAU
1ffk:0, 1352-1358, 1jj2:0, 1399-1405, 1k73:A, 1399-1405, 1k8a:A, 1399-1405, 1k9m:A, 1399-1405, 1kc8:A, 1399-1405, 1kd1:A, 1399-1405, 1kqs:0, 1399-1405, 1m1k:A, 1399-1405, 1m90:A, 1399-1405, 1n8r:A, 1399-1405, 1nji:A, 1399-1405, 1q7y:A, 1399-1405, 1q81:A, 1399-1405, 1q82:A, 1399-1405, 1q86:A, 1399-1405, 1qvf:0, 1399-1405, 1qvg:0, 1399-1405, 1s1i:3, 1510-1516, 1s72:0, 1399-1405, 1vq4:0, 1399-1405, 1vq5:0, 1399-1405, 1vq6:0, 1399-1405, 1vq7:0, 1399-1405, 1vq8:0, 1399-1405, 1vq9:0, 1399-1405, 1vqk:0, 1399-1405, 1vql:0, 1399-1405, 1vqm:0, 1399-1405, 1vqn:0, 1399-1405, 1vqo:0, 1399-1405, 1vqp:0, 1399-1405, 1w2b:0, 1399-1405, 1yhq:0, 1399-1405, 1yi2:0, 1399-1405, 1yij:0, 1399-1405, 1yit:0, 1399-1405, 1yj9:0, 1399-1405, 1yjn:0, 1399-1405, 1yjw:0, 1399-1405, 2b63:R, 5-11, 2j37:Z, 97-103, 2otj:0, 1399-1405, 2otl:0, 1399-1405, 2qa4:0, 1404-1410, 2qex:0, 1399-1405, 3cc2:0, 1399-1405, 3cc4:0, 1399-1405, 3cc7:0, 1399-1405, 3cce:0, 1399-1405, 3ccj:0, 1399-1405, 3ccl:0, 1399-1405, 3ccm:0, 1399-1405, 3ccq:0, 1399-1405, 3ccr:0, 1399-1405, 3ccs:0, 1399-1405, 3ccu:0, 1399-1405, 3ccv:0, 1399-1405, 3cd6:0, 1399-1405, 3cma:0, 1399-1405, 3cme:0, 1399-1405, 3cpw:0, 1399-1405, 3dkn:F, 16-22
CUGGC
2b6g:B, 7-13, 2b7g:A, 7-13, 2es5:A, 9-15, 2ese:B, 9-15
CUUGA
1vs5:A, 836-842, 1vs7:A, 836-842, 2avy:A, 836-842, 2aw7:A, 836-842, 2qal:A, 836-842, 2qan:A, 836-842, 2qb9:A, 836-842, 2qbb:A, 836-842, 2qbd:A, 836-842, 2qbf:A, 836-842, 2qbh:A, 836-842, 2qbj:A, 836-842, 2qoy:A, 836-842, 2qp0:A, 836-842, 2vho:A, 836-842, 2z4k:A, 836-842, 2z4m:A, 836-842, 3df1:A, 836-842, 3df3:A, 836-842
CUUGU
1vsa:w, 270-276, 1vsp:w, 270-276, 1yl3:A, 269-275, 2b66:A, 269-275, 2b9n:A, 269-275, 2b9p:A, 269-275, 2hgq:A, 269-275, 2hgu:A, 269-275, 2jl6:A, 262-268, 2jl8:A, 262-268, 3d5b:A, 265-271, 3d5d:A, 265-271
CUUUG
1i94:A, 205-211, 2uxd:A, 186-192
GAAAA
1hji:A, 5-11, 1jzx:A, 747-753, 1jzy:A, 747-753, 1jzz:A, 747-753, 1k01:A, 747-753, 1qfq:A, 5-11, 1vor:B, 742-748, 1vou:B, 742-748, 1vow:B, 742-748, 1voy:B, 742-748, 1vp0:B, 742-748, 1vsa:w, 805-811, 1vsp:w, 805-811, 1y69:0, 742-748, 2aar:0, 742-748, 2b66:A, 804-810, 2b9n:A, 804-810, 2b9p:A, 804-810, 2d3o:0, 742-748, 2hgj:A, 804-810, 2hgq:A, 804-810, 2hgu:A, 804-810, 2j01:A, 788-794, 2j03:A, 788-794, 2jl6:A, 815-821, 2jl8:A, 815-821, 2o43:A, 742-748, 2o44:A, 742-748, 2o45:A, 742-748, 2ogm:0, 742-748, 2ogn:0, 742-748, 2ogo:0, 741-747, 2v47:A, 788-794, 2v49:A, 788-794, 2zjp:X, 720-726, 2zjq:X, 720-726, 2zjr:X, 720-726, 3cf5:X, 720-726, 3d5b:A, 800-806, 3d5d:A, 800-806, 3dll:X, 720-726
GAAAG
1ffk:0, 862-868, 1jj2:0, 866-872, 1k73:A, 866-872, 1k8a:A, 866-872, 1k9m:A, 866-872, 1kc8:A, 866-872, 1kd1:A, 866-872, 1kqs:0, 866-872, 1m1k:A, 866-872, 1m90:A, 866-872, 1n8r:A, 866-872, 1nji:A, 866-872, 1q7y:A, 866-872, 1q81:A, 866-872, 1q82:A, 866-872, 1q86:A, 866-872, 1qvf:0, 866-872, 1qvg:0, 866-872, 1s1i:3, 865-871, 1s72:0, 866-872, 1vq4:0, 866-872, 1vq5:0, 866-872, 1vq6:0, 866-872, 1vq7:0, 866-872, 1vq8:0, 866-872, 1vq9:0, 866-872, 1vqk:0, 866-872, 1vql:0, 866-872, 1vqm:0, 866-872, 1vqn:0, 866-872, 1vqo:0, 866-872, 1vqp:0, 866-872, 1vs6:B, 779-785, 1vs8:B, 779-785, 1w2b:0, 866-872, 1yhq:0, 866-872, 1yi2:0, 866-872, 1yij:0, 866-872, 1yit:0, 866-872, 1yj9:0, 866-872, 1yjn:0, 866-872, 1yjw:0, 866-872, 2aw4:B, 779-785, 2awb:B, 779-785, 2gya:0, 716-722, 2gyc:0, 716-722, 2i2t:B, 779-785, 2i2v:B, 779-785, 2j28:B, 779-785, 2otj:0, 866-872, 2otl:0, 866-872, 2qa4:0, 865-871, 2qam:B, 779-785, 2qao:B, 779-785, 2qba:B, 779-785, 2qbc:B, 779-785, 2qbe:B, 779-785, 2qbg:B, 779-785, 2qbi:B, 779-785, 2qbk:B, 779-785, 2qex:0, 866-872, 2qov:B, 779-785, 2qox:B, 779-785, 2qoz:B, 779-785, 2qp1:B, 779-785, 2z4l:B, 779-785, 2z4n:B, 779-785, 3bbx:B, 779-785, 3cc2:0, 866-872, 3cc4:0, 866-872, 3cc7:0, 866-872, 3cce:0, 866-872, 3ccj:0, 866-872, 3ccl:0, 866-872, 3ccm:0, 866-872, 3ccq:0, 866-872, 3ccr:0, 866-872, 3ccs:0, 866-872, 3ccu:0, 866-872, 3ccv:0, 866-872, 3cd6:0, 866-872, 3cma:0, 866-872, 3cme:0, 866-872, 3cpw:0, 866-872, 3df2:B, 779-785, 3df4:B, 779-785
GAACA
1njm:0, 1731-1737, 1njn:0, 1731-1737, 1njo:0, 1731-1737, 1njp:0, 1731-1737, 1nkw:0, 1731-1737, 1nwx:0, 1731-1737, 1nwy:0, 1731-1737, 1ond:0, 1730-1736, 1p9x:0, 1706-1712, 1pnu:0, 1747-1753, 1pny:0, 1747-1753, 1sm1:0, 1731-1737, 1vor:B, 1747-1753, 1vou:B, 1747-1753, 1vow:B, 1747-1753, 1voy:B, 1747-1753, 1vp0:B, 1747-1753, 1vsa:w, 667-673, 1vsp:w, 667-673, 1xbp:0, 1731-1737, 1y69:0, 1731-1737, 2aar:0, 1731-1737, 2d3o:0, 1731-1737, 2j01:A, 653-659, 2j03:A, 653-659, 2jl6:A, 655-661, 2jl8:A, 655-661, 2o43:A, 1731-1737, 2o45:A, 1728-1734, 2ogm:0, 1731-1737, 2ogn:0, 1731-1737, 2ogo:0, 1730-1736, 2v49:A, 653-659, 2zjp:X, 1709-1715, 2zjq:X, 1709-1715, 2zjr:X, 1706-1712, 3cf5:X, 1709-1715, 3d5b:A, 662-668, 3d5d:A, 662-668, 3dll:X, 1709-1715
GAAUA
1c2w:B, 611-617, 1vs6:B, 611-617, 1vs8:B, 611-617, 2aw4:B, 611-617, 2awb:B, 611-617, 2i2t:B, 611-617, 2i2v:B, 611-617, 2j28:B, 611-617, 2qam:B, 611-617, 2qao:B, 611-617, 2qba:B, 611-617, 2qbc:B, 611-617, 2qbe:B, 611-617, 2qbg:B, 611-617, 2qbi:B, 611-617, 2qbk:B, 611-617, 2qov:B, 611-617, 2qox:B, 611-617, 2qoz:B, 611-617, 2qp1:B, 611-617, 2z4l:B, 611-617, 2z4n:B, 611-617, 3bbx:B, 611-617, 3d0u:A, 121-127, 3d0x:A, 121-127, 3df2:B, 611-617, 3df4:B, 611-617, 3dig:X, 124-130, 3dil:A, 124-130, 3dim:A, 124-130, 3dio:X, 124-130, 3diq:A, 124-130, 3dir:A, 124-130, 3dis:A, 124-130, 3dix:A, 124-130, 3diy:A, 124-130, 3diz:A, 124-130, 3dj0:A, 124-130, 3dj2:A, 124-130
GACAA
1a4t:A, 5-11
GACGA
1fjg:A, 448-454, 1hnw:A, 448-454, 1hnx:A, 448-454, 1hnz:A, 448-454, 1hr0:A, 448-454, 1i94:A, 451-457, 1i95:A, 451-457, 1i96:A, 451-457, 1i97:A, 451-457, 1ibl:A, 448-454, 1ibm:A, 448-454, 1j5e:A, 448-454, 1n32:A, 448-454, 1n33:A, 448-454, 1s1h:A, 455-461, 1xmq:A, 448-454, 1yl4:A, 448-454, 2b64:A, 448-454, 2b9m:A, 448-454, 2b9o:A, 448-454, 2e5l:A, 449-455, 2f4v:A, 448-454, 2gy9:A, 435-441, 2gyb:A, 435-441, 2hgi:A, 448-454, 2hgp:A, 448-454, 2hgr:A, 448-454, 2hhh:A, 448-454, 2jl5:A, 448-454, 2jl7:A, 448-454, 2uu9:A, 448-454, 2uua:A, 448-454, 2uub:A, 448-454, 2uuc:A, 448-454, 2uxb:A, 448-454, 2uxc:A, 448-454, 2vqe:A, 448-454, 2vqf:A, 448-454
GAGAA
1nem:A, 9-15, 1vs6:B, 1614-1620, 1vs8:B, 1614-1620, 2aw4:B, 1614-1620, 2awb:B, 1614-1620, 2gya:0, 1551-1557, 2i2t:B, 1614-1620, 2i2v:B, 1614-1620, 2j28:B, 1614-1620, 2qam:B, 1614-1620, 2qao:B, 1614-1620, 2qba:B, 1614-1620, 2qbc:B, 1614-1620, 2qbe:B, 1614-1620, 2qbg:B, 1614-1620, 2qbi:B, 1614-1620, 2qbk:B, 1614-1620, 2qov:B, 1614-1620, 2qox:B, 1614-1620, 2qoz:B, 1614-1620, 2qp1:B, 1614-1620, 2vhm:B, 1614-1620, 2vhn:B, 1614-1620, 2z4l:B, 1614-1620, 2z4n:B, 1614-1620, 3bbx:B, 1695-1701, 3df2:B, 1614-1620, 3df4:B, 1614-1620
GAGGA
2ow8:y, 448-454, 2qnh:y, 448-454, 3d5a:A, 448-454, 3d5c:A, 448-454
GAGUA
1xjr:A, 21-27
GAUAA
1vs5:A, 1161-1167, 1vs7:A, 1161-1167, 2avy:A, 1161-1167, 2aw7:A, 1161-1167, 2i2p:A, 1161-1167, 2i2u:A, 1161-1167, 2qal:A, 1161-1167, 2qan:A, 1161-1167, 2qb9:A, 1161-1167, 2qbb:A, 1161-1167, 2qbd:A, 1161-1167, 2qbf:A, 1161-1167, 2qbh:A, 1161-1167, 2qbj:A, 1161-1167, 2qou:A, 1161-1167, 2qow:A, 1161-1167, 2qoy:A, 1161-1167, 2qp0:A, 1161-1167, 2z4k:A, 1161-1167, 2z4m:A, 1161-1167, 3bbn:A, 1108-1114, 3df1:A, 1161-1167, 3df3:A, 1161-1167
GAUGA
1vsa:w, 1196-1202, 1vsa:w, 1743-1749, 1vsp:w, 1196-1202, 1vsp:w, 1743-1749, 2b66:A, 1196-1202, 2b9n:A, 1196-1202, 2b9p:A, 1196-1202, 2hgj:A, 1196-1202, 2hgq:A, 1196-1202, 2hgu:A, 1196-1202, 2j01:A, 1121-1127, 2j03:A, 1121-1127, 2jl6:A, 1200-1206, 2jl8:A, 1200-1206, 3d5b:A, 1191-1197, 3d5b:A, 1738-1744, 3d5d:A, 1191-1197, 3d5d:A, 1738-1744
GCAAC
1yhq:0, 187-193, 1yi2:0, 187-193, 1yij:0, 187-193, 1yit:0, 187-193, 1yj9:0, 187-193, 1yjn:0, 187-193, 1yjw:0, 187-193, 3cc2:0, 187-193, 3cc4:0, 187-193, 3cc7:0, 187-193, 3cce:0, 187-193, 3ccj:0, 187-193, 3ccl:0, 187-193, 3ccm:0, 187-193, 3ccq:0, 187-193, 3ccr:0, 187-193, 3ccs:0, 187-193, 3ccu:0, 187-193, 3ccv:0, 187-193, 3cd6:0, 187-193, 3cma:0, 187-193, 3cme:0, 187-193
GCAAU
1ffk:0, 186-192, 1jj2:0, 187-193, 1k73:A, 187-193, 1k8a:A, 187-193, 1k9m:A, 187-193, 1kc8:A, 187-193, 1kd1:A, 187-193, 1kqs:0, 187-193, 1m1k:A, 187-193, 1m90:A, 187-193, 1n8r:A, 187-193, 1nji:A, 187-193, 1q7y:A, 187-193, 1q81:A, 187-193, 1q82:A, 187-193, 1q86:A, 187-193, 1qvf:0, 187-193, 1qvg:0, 187-193, 1s1i:3, 186-192, 1s72:0, 187-193, 1vq4:0, 187-193, 1vq5:0, 187-193, 1vq6:0, 187-193, 1vq7:0, 187-193, 1vq8:0, 187-193, 1vq9:0, 187-193, 1vqk:0, 187-193, 1vql:0, 187-193, 1vqm:0, 187-193, 1vqn:0, 187-193, 1vqo:0, 187-193, 1vqp:0, 187-193, 1w2b:0, 187-193, 2otj:0, 187-193, 2otl:0, 187-193, 2qa4:0, 187-193, 2qex:0, 187-193, 3cpw:0, 187-193
GCAUA
1lc6:A, 9-15, 1nz1:A, 9-15, 1sy4:A, 9-15, 1syz:A, 9-15, 1xhp:A, 13-19
GCUAA
1ysv:A, 11-17
GGAAC
1ffk:0, 1714-1720, 1jj2:0, 1764-1770, 1k73:A, 1764-1770, 1k8a:A, 1764-1770, 1k9m:A, 1764-1770, 1kc8:A, 1764-1770, 1kd1:A, 1764-1770, 1kqs:0, 1764-1770, 1m1k:A, 1764-1770, 1m90:A, 1764-1770, 1n8r:A, 1764-1770, 1nji:A, 1764-1770, 1q7y:A, 1764-1770, 1q81:A, 1764-1770, 1q82:A, 1764-1770, 1q86:A, 1764-1770, 1qvf:0, 1764-1770, 1qvg:0, 1764-1770, 1s1i:3, 1872-1878, 1s72:0, 1764-1770, 1vq4:0, 1764-1770, 1vq5:0, 1764-1770, 1vq6:0, 1764-1770, 1vq7:0, 1764-1770, 1vq8:0, 1764-1770, 1vq9:0, 1764-1770, 1vqk:0, 1764-1770, 1vql:0, 1764-1770, 1vqm:0, 1764-1770, 1vqn:0, 1764-1770, 1vqo:0, 1764-1770, 1vqp:0, 1764-1770, 1w2b:0, 1764-1770, 1yhq:0, 1764-1770, 1yi2:0, 1764-1770, 1yij:0, 1764-1770, 1yit:0, 1764-1770, 1yj9:0, 1764-1770, 1yjn:0, 1764-1770, 1yjw:0, 1764-1770, 2otj:0, 1764-1770, 2otl:0, 1764-1770, 2qa4:0, 1769-1775, 2qex:0, 1764-1770, 3cc2:0, 1764-1770, 3cc4:0, 1764-1770, 3cc7:0, 1764-1770, 3cce:0, 1764-1770, 3ccj:0, 1764-1770, 3ccl:0, 1764-1770, 3ccm:0, 1764-1770, 3ccq:0, 1764-1770, 3ccr:0, 1764-1770, 3ccs:0, 1764-1770, 3ccu:0, 1764-1770, 3ccv:0, 1764-1770, 3cd6:0, 1764-1770, 3cma:0, 1764-1770, 3cme:0, 1764-1770, 3cpw:0, 1764-1770
GGAUA
1wks:A, 6-12
GGCGA
1c2w:B, 246-252, 1j5a:A, 223-229, 1jzx:A, 223-229, 1jzy:A, 223-229, 1jzz:A, 223-229, 1k01:A, 223-229, 1njm:0, 223-229, 1njn:0, 223-229, 1njo:0, 223-229, 1njp:0, 223-229, 1nkw:0, 223-229, 1nwx:0, 223-229, 1nwy:0, 223-229, 1ond:0, 223-229, 1p9x:0, 223-229, 1pnu:0, 223-229, 1pny:0, 223-229, 1sm1:0, 223-229, 1vor:B, 223-229, 1vou:B, 223-229, 1vow:B, 223-229, 1voy:B, 223-229, 1vp0:B, 223-229, 1vs6:B, 246-252, 1vs6:B, 487-493, 1vs8:B, 246-252, 1vs8:B, 487-493, 1vsa:w, 236-242, 1vsp:w, 236-242, 1xbp:0, 223-229, 1y69:0, 223-229, 1z58:2, 223-229, 2aar:0, 223-229, 2aw4:B, 246-252, 2aw4:B, 487-493, 2awb:B, 246-252, 2awb:B, 487-493, 2b66:A, 235-241, 2b9n:A, 235-241, 2b9p:A, 235-241, 2d3o:0, 223-229, 2gya:0, 200-206, 2gya:0, 430-436, 2gyc:0, 200-206, 2hgj:A, 235-241, 2hgq:A, 235-241, 2hgu:A, 235-241, 2i2t:B, 246-252, 2i2t:B, 487-493, 2i2v:B, 246-252, 2i2v:B, 487-493, 2j01:A, 228-234, 2j03:A, 228-234, 2j28:B, 246-252, 2j28:B, 487-493, 2jl6:A, 228-234, 2jl8:A, 228-234, 2o43:A, 223-229, 2o44:A, 223-229, 2o45:A, 223-229, 2ogm:0, 223-229, 2ogn:0, 223-229, 2ogo:0, 222-228, 2qam:B, 246-252, 2qam:B, 487-493, 2qao:B, 246-252, 2qao:B, 487-493, 2qba:B, 246-252, 2qba:B, 487-493, 2qbc:B, 246-252, 2qbc:B, 487-493, 2qbe:B, 246-252, 2qbe:B, 487-493, 2qbg:B, 246-252, 2qbg:B, 487-493, 2qbi:B, 246-252, 2qbi:B, 487-493, 2qbk:B, 246-252, 2qbk:B, 487-493, 2qov:B, 246-252, 2qov:B, 487-493, 2qox:B, 246-252, 2qox:B, 487-493, 2qoz:B, 246-252, 2qoz:B, 487-493, 2qp1:B, 246-252, 2qp1:B, 487-493, 2v47:A, 228-234, 2v49:A, 228-234, 2vhm:B, 487-493, 2vhn:B, 487-493, 2z4l:B, 246-252, 2z4l:B, 487-493, 2z4n:B, 246-252, 2z4n:B, 487-493, 2zjp:X, 223-229, 2zjq:X, 223-229, 2zjr:X, 223-229, 3bbx:B, 246-252, 3bbx:B, 487-493, 3bo0:E, 10-16, 3bo1:E, 10-16, 3cf5:X, 223-229, 3d5b:A, 231-237, 3d5d:A, 231-237, 3df2:B, 246-252, 3df2:B, 487-493, 3df4:B, 246-252, 3df4:B, 487-493, 3dll:X, 223-229
GGGGC
2hgj:A, 2239-2245, 2hgq:A, 2239-2245, 2hgu:A, 2239-2245
GGUCU
2ply:C, 9-15, 2ply:E, 9-15, 2rlu:A, 7-13, 2uwm:C, 9-15, 2uwm:D, 9-15
GUAAC
2gya:0, 884-890
GUAAG
1ffk:0, 1019-1025, 1jj2:0, 1023-1029, 1k73:A, 1023-1029, 1k8a:A, 1023-1029, 1k9m:A, 1023-1029, 1kc8:A, 1023-1029, 1kd1:A, 1023-1029, 1kqs:0, 1023-1029, 1m1k:A, 1023-1029, 1m90:A, 1023-1029, 1n8r:A, 1023-1029, 1nji:A, 1023-1029, 1q7y:A, 1023-1029, 1q81:A, 1023-1029, 1q82:A, 1023-1029, 1q86:A, 1023-1029, 1qvf:0, 1023-1029, 1qvg:0, 1023-1029, 1s1i:3, 1119-1125, 1s72:0, 1023-1029, 1vq4:0, 1023-1029, 1vq5:0, 1023-1029, 1vq6:0, 1023-1029, 1vq7:0, 1023-1029, 1vq8:0, 1023-1029, 1vq9:0, 1023-1029, 1vqk:0, 1023-1029, 1vql:0, 1023-1029, 1vqm:0, 1023-1029, 1vqn:0, 1023-1029, 1vqo:0, 1023-1029, 1vqp:0, 1023-1029, 1w2b:0, 1023-1029, 1yhq:0, 1023-1029, 1yi2:0, 1023-1029, 1yij:0, 1023-1029, 1yit:0, 1023-1029, 1yj9:0, 1023-1029, 1yjn:0, 1023-1029, 1yjw:0, 1023-1029, 2otj:0, 1023-1029, 2otl:0, 1023-1029, 2qa4:0, 1022-1028, 2qex:0, 1023-1029, 3cc2:0, 1023-1029, 3cc4:0, 1023-1029, 3cc7:0, 1023-1029, 3cce:0, 1023-1029, 3ccj:0, 1023-1029, 3ccl:0, 1023-1029, 3ccm:0, 1023-1029, 3ccq:0, 1023-1029, 3ccr:0, 1023-1029, 3ccs:0, 1023-1029, 3ccu:0, 1023-1029, 3ccv:0, 1023-1029, 3cd6:0, 1023-1029, 3cma:0, 1023-1029, 3cme:0, 1023-1029, 3cpw:0, 1023-1029
GUAAU
1ffk:0, 1515-1521, 1jj2:0, 1565-1571, 1k73:A, 1565-1571, 1k8a:A, 1565-1571, 1k9m:A, 1565-1571, 1kc8:A, 1565-1571, 1kd1:A, 1565-1571, 1kqs:0, 1565-1571, 1m1k:A, 1565-1571, 1m90:A, 1565-1571, 1n8r:A, 1565-1571, 1nji:A, 1565-1571, 1pnu:0, 848-854, 1pny:0, 848-854, 1q7y:A, 1565-1571, 1q81:A, 1565-1571, 1q82:A, 1565-1571, 1q86:A, 1565-1571, 1qvf:0, 1565-1571, 1qvg:0, 1565-1571, 1s1i:3, 1673-1679, 1s72:0, 1565-1571, 1vq4:0, 1565-1571, 1vq5:0, 1565-1571, 1vq6:0, 1565-1571, 1vq7:0, 1565-1571, 1vq8:0, 1565-1571, 1vq9:0, 1565-1571, 1vqk:0, 1565-1571, 1vql:0, 1565-1571, 1vqm:0, 1565-1571, 1vqn:0, 1565-1571, 1vqo:0, 1565-1571, 1vqp:0, 1565-1571, 1w2b:0, 1565-1571, 1yhq:0, 1565-1571, 1yi2:0, 1565-1571, 1yij:0, 1565-1571, 1yit:0, 1565-1571, 1yj9:0, 1565-1571, 1yjn:0, 1565-1571, 1yjw:0, 1565-1571, 1ysh:F, 19-25, 2frl:A, 9-15, 2j37:Z, 240-246, 2otj:0, 1565-1571, 2otl:0, 1565-1571, 2qa4:0, 1570-1576, 2qex:0, 1565-1571, 3cc2:0, 1565-1571, 3cc4:0, 1565-1571, 3cc7:0, 1565-1571, 3cce:0, 1565-1571, 3ccj:0, 1565-1571, 3ccl:0, 1565-1571, 3ccm:0, 1565-1571, 3ccq:0, 1565-1571, 3ccr:0, 1565-1571, 3ccs:0, 1565-1571, 3ccu:0, 1565-1571, 3ccv:0, 1565-1571, 3cd6:0, 1565-1571, 3cma:0, 1565-1571, 3cme:0, 1565-1571, 3cpw:0, 1565-1571
GUCAA
1vsa:w, 2785-2791, 1vsp:w, 2785-2791, 2hgj:A, 2785-2791, 2hgu:A, 2785-2791, 3d5b:A, 2780-2786, 3d5d:A, 2780-2786
GUCGU
1j5a:A, 1279-1285, 1jzx:A, 1279-1285, 1jzy:A, 1279-1285, 1jzz:A, 1279-1285, 1k01:A, 1279-1285, 1njm:0, 1271-1277, 1njn:0, 1271-1277, 1njo:0, 1271-1277, 1njp:0, 1271-1277, 1nkw:0, 1271-1277, 1nwx:0, 1271-1277, 1nwy:0, 1271-1277, 1ond:0, 1271-1277, 1p9x:0, 1247-1253, 1pnu:0, 1287-1293, 1pny:0, 1287-1293, 1sm1:0, 1271-1277, 1vor:B, 1287-1293, 1vou:B, 1287-1293, 1vow:B, 1287-1293, 1voy:B, 1287-1293, 1vp0:B, 1287-1293, 1vsa:w, 1349-1355, 1vsp:w, 1349-1355, 1xbp:0, 1271-1277, 1y69:0, 1271-1277, 1yl3:A, 1348-1354, 1z58:2, 1262-1268, 2aar:0, 1271-1277, 2b66:A, 1348-1354, 2b9n:A, 1348-1354, 2b9p:A, 1348-1354, 2d3o:0, 1271-1277, 2hgj:A, 1348-1354, 2hgq:A, 1348-1354, 2hgu:A, 1348-1354, 2j01:A, 1274-1280, 2j03:A, 1274-1280, 2jl6:A, 1353-1359, 2jl8:A, 1353-1359, 2o43:A, 1271-1277, 2o44:A, 1271-1277, 2o45:A, 1268-1274, 2ogm:0, 1271-1277, 2ogn:0, 1271-1277, 2ogo:0, 1270-1276, 2v47:A, 1274-1280, 2v49:A, 1274-1280, 2zjp:X, 1249-1255, 2zjq:X, 1249-1255, 2zjr:X, 1246-1252, 3cf5:X, 1249-1255, 3d5b:A, 1344-1350, 3d5d:A, 1344-1350, 3dll:X, 1249-1255
GUCUC
1a51:A, 18-24, 1c2x:C, 85-91, 1ibm:A, 816-822, 2j00:A, 816-822, 2j02:A, 816-822, 2jl5:A, 816-822, 2jl7:A, 816-822, 2qnh:y, 816-822, 2uu9:A, 816-822, 2uua:A, 816-822, 2uub:A, 816-822, 2vhm:A, 84-90, 2vhn:A, 84-90, 2vqf:A, 816-822
GUUGA
1vsa:w, 636-642, 1vsp:w, 636-642, 2j01:A, 622-628, 2j03:A, 622-628, 2jl6:A, 624-630, 2jl8:A, 624-630, 2v47:A, 622-628, 2v49:A, 622-628, 3d5b:A, 631-637, 3d5d:A, 631-637
UAACG
1u9s:A, 9-15
UAACU
1vs6:B, 641-647, 1vs8:B, 641-647, 2aw4:B, 641-647, 2awb:B, 641-647, 2i2t:B, 641-647, 2i2v:B, 641-647, 2j28:B, 641-647, 2qam:B, 641-647, 2qao:B, 641-647, 2qba:B, 641-647, 2qbc:B, 641-647, 2qbe:B, 641-647, 2qbg:B, 641-647, 2qbi:B, 641-647, 2qbk:B, 641-647, 2qov:B, 641-647, 2qox:B, 641-647, 2qoz:B, 641-647, 2qp1:B, 641-647, 2vhm:B, 641-647, 2vhn:B, 641-647, 2z4l:B, 641-647, 2z4n:B, 641-647, 3bbx:B, 641-647, 3df2:B, 641-647, 3df4:B, 641-647
UAAGU
1vs6:B, 1934-1940, 1vs8:B, 1934-1940, 2aw4:B, 1934-1940, 2awb:B, 1934-1940, 2d3o:0, 1867-1873, 2hgj:A, 1950-1956, 2hgq:A, 1950-1956, 2hgu:A, 1950-1956, 2i2t:B, 1934-1940, 2i2v:B, 1934-1940, 2j01:A, 1867-1873, 2j03:A, 1867-1873, 2j28:B, 1934-1940, 2jl6:A, 1946-1952, 2jl8:A, 1946-1952, 2o45:A, 1864-1870, 2ogm:0, 1867-1873, 2ogn:0, 1867-1873, 2ogo:0, 1866-1872, 2qam:B, 1934-1940, 2qao:B, 1934-1940, 2qba:B, 1934-1940, 2qbc:B, 1934-1940, 2qbe:B, 1934-1940, 2qbg:B, 1934-1940, 2qbi:B, 1934-1940, 2qbk:B, 1934-1940, 2qov:B, 1934-1940, 2qox:B, 1934-1940, 2qoz:B, 1934-1940, 2qp1:B, 1934-1940, 2v47:A, 1867-1873, 2v49:A, 1867-1873, 2z4l:B, 1934-1940, 2z4n:B, 1934-1940, 2zjp:X, 1828-1834, 2zjq:X, 1828-1834, 2zjr:X, 1825-1831, 3bbx:B, 2027-2033, 3cf5:X, 1828-1834, 3d5b:A, 1945-1951, 3d5d:A, 1945-1951, 3deg:J, 7-13, 3df2:B, 1934-1940, 3df4:B, 1934-1940
UAAUC
1vs6:B, 2156-2162, 1vs8:B, 2156-2162, 2aw4:B, 2156-2162, 2awb:B, 2156-2162, 2i2t:B, 2156-2162, 2i2v:B, 2156-2162, 2j28:B, 2156-2162, 2qam:B, 2156-2162, 2qao:B, 2156-2162, 2qba:B, 2156-2162, 2qbc:B, 2156-2162, 2qbe:B, 2156-2162, 2qbg:B, 2156-2162, 2qbi:B, 2156-2162, 2qbk:B, 2156-2162, 2qov:B, 2156-2162, 2qox:B, 2156-2162, 2qoz:B, 2156-2162, 2qp1:B, 2156-2162, 2vhm:B, 2156-2162, 2vhn:B, 2156-2162, 2z4l:B, 2156-2162, 2z4n:B, 2156-2162, 3bbx:B, 2430-2436, 3df2:B, 2156-2162, 3df4:B, 2156-2162
UCAGU
1q75:A, 5-11
UCAUA
3bbo:A, 623-629
UCCGG
1vs5:A, 1130-1136, 1vs7:A, 1130-1136, 2avy:A, 1130-1136, 2aw7:A, 1130-1136, 2gy9:A, 1094-1100, 2gyb:A, 1094-1100, 2i2p:A, 1130-1136, 2i2u:A, 1130-1136, 2qal:A, 1130-1136, 2qan:A, 1130-1136, 2qb9:A, 1130-1136, 2qbb:A, 1130-1136, 2qbd:A, 1130-1136, 2qbf:A, 1130-1136, 2qbh:A, 1130-1136, 2qbj:A, 1130-1136, 2qou:A, 1130-1136, 2qow:A, 1130-1136, 2qoy:A, 1130-1136, 2qp0:A, 1130-1136, 2vho:A, 1130-1136, 2vhp:A, 1130-1136, 2z4k:A, 1130-1136, 2z4m:A, 1130-1136, 3df1:A, 1130-1136, 3df3:A, 1130-1136
UCGCU
1na2:A, 12-18
UGAAA
1j4y:A, 6-12, 1kka:A, 6-12, 2hgp:D, 32-38
UGACU
1tbk:A, 6-12, 1yn1:A, 6-12, 1yn2:A, 6-12
UGCAA
1u0b:A, 31-37, 3eph:E, 30-36, 3eph:F, 30-36, 3epj:F, 30-36, 3epl:E, 30-36
UGCGU
2gdi:X, 18-24
UGGCU
2g1w:A, 4-10
UGUAU
1grz:A, 190-196, 1grz:B, 190-196
UGUUC
1ffk:0, 2399-2405, 1ffz:A, 425-431, 1fg0:A, 425-431, 1i3x:A, 7-13, 1i3y:A, 7-13, 1j5a:A, 2451-2457, 1jj2:0, 2449-2455, 1jzx:A, 2451-2457, 1jzy:A, 2451-2457, 1jzz:A, 2451-2457, 1k01:A, 2451-2457, 1k73:A, 2449-2455, 1k8a:A, 2449-2455, 1k9m:A, 2449-2455, 1kc8:A, 2449-2455, 1kd1:A, 2449-2455, 1kqs:0, 2449-2455, 1m1k:A, 2449-2455, 1m90:A, 2449-2455, 1n8r:A, 2449-2455, 1nji:A, 2449-2455, 1njm:0, 2443-2449, 1njn:0, 2443-2449, 1njo:0, 2443-2449, 1njp:0, 2443-2449, 1nkw:0, 2443-2449, 1nwx:0, 2443-2449, 1nwy:0, 2443-2449, 1ond:0, 2442-2448, 1p9x:0, 2418-2424, 1pnu:0, 2487-2493, 1pny:0, 2487-2493, 1q7y:A, 2449-2455, 1q81:A, 2449-2455, 1q82:A, 2449-2455, 1q86:A, 2449-2455, 1qvf:0, 2449-2455, 1qvg:0, 2449-2455, 1s1i:3, 2766-2772, 1s72:0, 2449-2455, 1sm1:0, 2443-2449, 1vow:B, 2487-2493, 1voy:B, 2487-2493, 1vp0:B, 2487-2493, 1vq4:0, 2449-2455, 1vq5:0, 2449-2455, 1vq6:0, 2449-2455, 1vq7:0, 2449-2455, 1vq8:0, 2449-2455, 1vq9:0, 2449-2455, 1vqk:0, 2449-2455, 1vql:0, 2449-2455, 1vqm:0, 2449-2455, 1vqn:0, 2449-2455, 1vqo:0, 2449-2455, 1vqp:0, 2449-2455, 1vs6:B, 2498-2504, 1vs8:B, 2498-2504, 1vsa:w, 2541-2547, 1vsp:w, 2541-2547, 1w2b:0, 2449-2455, 1y69:0, 2443-2449, 1yhq:0, 2449-2455, 1yi2:0, 2449-2455, 1yij:0, 2449-2455, 1yit:0, 2449-2455, 1yj9:0, 2449-2455, 1yjn:0, 2449-2455, 1yjw:0, 2449-2455, 1yl3:A, 2527-2533, 1z58:2, 2422-2428, 2aar:0, 2443-2449, 2aw4:B, 2498-2504, 2awb:B, 2498-2504, 2b66:A, 2469-2475, 2b9n:A, 2469-2475, 2b9p:A, 2469-2475, 2d3o:0, 2464-2470, 2gya:0, 2413-2419, 2hgj:A, 2541-2547, 2hgq:A, 2541-2547, 2hgu:A, 2541-2547, 2i2t:B, 2498-2504, 2i2v:B, 2498-2504, 2j01:A, 2429-2435, 2j03:A, 2429-2435, 2j28:B, 2498-2504, 2jl6:A, 2508-2514, 2jl8:A, 2508-2514, 2o43:A, 2443-2449, 2o44:A, 2443-2449, 2o45:A, 2431-2437, 2ogm:0, 2443-2449, 2ogn:0, 2443-2449, 2ogo:0, 2442-2448, 2otj:0, 2449-2455, 2otl:0, 2449-2455, 2qa4:0, 2454-2460, 2qam:B, 2498-2504, 2qao:B, 2498-2504, 2qba:B, 2498-2504, 2qbc:B, 2498-2504, 2qbe:B, 2498-2504, 2qbg:B, 2498-2504, 2qbi:B, 2498-2504, 2qbk:B, 2498-2504, 2qex:0, 2449-2455, 2qov:B, 2498-2504, 2qox:B, 2498-2504, 2qoz:B, 2498-2504, 2qp1:B, 2498-2504, 2v47:A, 2424-2430, 2v49:A, 2424-2430, 2vhm:B, 2498-2504, 2vhn:B, 2498-2504, 2z4l:B, 2498-2504, 2z4n:B, 2498-2504, 2zjp:X, 2354-2360, 2zjq:X, 2354-2360, 2zjr:X, 2351-2357, 3bbx:B, 2781-2787, 3cc2:0, 2449-2455, 3cc4:0, 2449-2455, 3cc7:0, 2449-2455, 3cce:0, 2449-2455, 3ccj:0, 2449-2455, 3ccl:0, 2449-2455, 3ccm:0, 2449-2455, 3ccq:0, 2449-2455, 3ccr:0, 2449-2455, 3ccs:0, 2449-2455, 3ccu:0, 2449-2455, 3ccv:0, 2449-2455, 3cd6:0, 2449-2455, 3cf5:X, 2354-2360, 3cma:0, 2449-2455, 3cme:0, 2449-2455, 3cpw:0, 2449-2455, 3d5b:A, 2536-2542, 3d5d:A, 2536-2542, 3deg:K, 5-11, 3df2:B, 2498-2504, 3df4:B, 2498-2504, 3dll:X, 2354-2360
UUAAU
1vs6:B, 1308-1314, 1vs8:B, 1308-1314, 2aw4:B, 1308-1314, 2awb:B, 1308-1314, 2gya:0, 1248-1254, 2gyc:0, 1248-1254, 2i2t:B, 1308-1314, 2i2v:B, 1308-1314, 2j28:B, 1308-1314, 2qam:B, 1308-1314, 2qao:B, 1308-1314, 2qba:B, 1308-1314, 2qbc:B, 1308-1314, 2qbe:B, 1308-1314, 2qbg:B, 1308-1314, 2qbi:B, 1308-1314, 2qbk:B, 1308-1314, 2qov:B, 1308-1314, 2qox:B, 1308-1314, 2qoz:B, 1308-1314, 2qp1:B, 1308-1314, 2vhm:B, 1308-1314, 2vhn:B, 1308-1314, 2z4l:B, 1308-1314, 2z4n:B, 1308-1314, 3bbx:B, 1389-1395, 3df2:B, 1308-1314, 3df4:B, 1308-1314
UUAGU
1foq:A, 47-53, 1foq:B, 47-53, 1foq:C, 47-53, 1foq:D, 47-53, 1foq:E, 47-53
UUCGC
1ffk:0, 127-133, 1jj2:0, 128-134, 1k73:A, 128-134, 1k8a:A, 128-134, 1k9m:A, 128-134, 1kc8:A, 128-134, 1kd1:A, 128-134, 1kqs:0, 128-134, 1m1k:A, 128-134, 1m90:A, 128-134, 1n8r:A, 128-134, 1nji:A, 128-134, 1q7y:A, 128-134, 1q81:A, 128-134, 1q82:A, 128-134, 1q86:A, 128-134, 1qvf:0, 128-134, 1qvg:0, 128-134, 1s1i:3, 127-133, 1s72:0, 128-134, 1vq4:0, 128-134, 1vq5:0, 128-134, 1vq6:0, 128-134, 1vq7:0, 128-134, 1vq8:0, 128-134, 1vq9:0, 128-134, 1vqk:0, 128-134, 1vql:0, 128-134, 1vqm:0, 128-134, 1vqn:0, 128-134, 1vqo:0, 128-134, 1vqp:0, 128-134, 1w2b:0, 128-134, 1yhq:0, 128-134, 1yi2:0, 128-134, 1yij:0, 128-134, 1yit:0, 128-134, 1yj9:0, 128-134, 1yjn:0, 128-134, 1yjw:0, 128-134, 2otj:0, 128-134, 2otl:0, 128-134, 2qa4:0, 128-134, 2qex:0, 128-134, 3cc2:0, 128-134, 3cc4:0, 128-134, 3cc7:0, 128-134, 3cce:0, 128-134, 3ccj:0, 128-134, 3ccl:0, 128-134, 3ccm:0, 128-134, 3ccq:0, 128-134, 3ccr:0, 128-134, 3ccs:0, 128-134, 3ccu:0, 128-134, 3ccv:0, 128-134, 3cd6:0, 128-134, 3cma:0, 128-134, 3cme:0, 128-134, 3cpw:0, 128-134
UUCGG
1fjg:A, 1112-1118, 1hnx:A, 1112-1118, 1hnz:A, 1112-1118, 1ibl:A, 1112-1118, 1ibm:A, 1112-1118, 1j5e:A, 1112-1118, 1n32:A, 1112-1118, 1n33:A, 1112-1118, 1pns:A, 1128-1134, 1pnx:A, 1128-1134, 1s1h:A, 1113-1119, 1voq:A, 1128-1134, 1vos:A, 1128-1134, 1vov:A, 1128-1134, 1vox:A, 1128-1134, 1voz:A, 1128-1134, 1xnq:A, 1107-1113, 1xnr:A, 1107-1113, 1yl4:A, 1112-1118, 2b64:A, 1112-1118, 2b9m:A, 1112-1118, 2b9o:A, 1112-1118, 2e5l:A, 1113-1119, 2hgi:A, 1112-1118, 2hgp:A, 1112-1118, 2hgr:A, 1112-1118, 2hhh:A, 1112-1118, 2ow8:y, 1112-1118, 2qnh:y, 1112-1118, 2uu9:A, 1112-1118, 2uub:A, 1112-1118, 2uxc:A, 1112-1118, 2vqe:A, 1112-1118, 2vqf:A, 1112-1118, 3d5a:A, 1112-1118, 3d5c:A, 1112-1118
UUUAA
2vhm:B, 2742-2748, 2vhn:B, 2742-2748
UUUAU
2d3o:0, 2707-2713, 2ozb:F, 16-22
UUUUA
1fjg:A, 74-80, 1hnw:A, 74-80, 1hnx:A, 74-80, 1hnz:A, 74-80, 1hr0:A, 74-80, 1i94:A, 77-83, 1i95:A, 77-83, 1i96:A, 77-83, 1ibk:A, 74-80, 1ibl:A, 74-80, 1ibm:A, 74-80, 1j5e:A, 74-80, 1n32:A, 74-80, 1n33:A, 74-80, 1n34:A, 74-80, 1xmo:A, 74-80, 1xmq:A, 74-80, 1xnq:A, 74-80, 1xnr:A, 74-80, 2b64:A, 74-80, 2b9m:A, 74-80, 2b9o:A, 74-80, 2e5l:A, 75-81, 2hhh:A, 74-80, 2ow8:y, 74-80, 2qnh:y, 74-80, 2uu9:A, 74-80, 2uua:A, 74-80, 2uub:A, 74-80, 2uuc:A, 74-80, 2uxb:A, 74-80, 2uxc:A, 74-80, 2uxd:A, 72-78, 2vqe:A, 74-80, 2vqf:A, 74-80
UUUUU
1vsa:w, 155-161, 1vsp:w, 155-161, 3d5b:A, 150-156, 3d5d:A, 150-156