Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(003)-Hairpin cluster 98 (cutoff=3.0 Å)
Cluster size 291 structure(s)
Representative structure 1s1h:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NNN
Cluster members
AAU
1ffk:0, 109-113, 1jj2:0, 109-113, 1k73:A, 109-113, 1k8a:A, 109-113, 1k9m:A, 109-113, 1kc8:A, 109-113, 1kd1:A, 109-113, 1kqs:0, 109-113, 1m1k:A, 109-113, 1m90:A, 109-113, 1n8r:A, 109-113, 1nji:A, 109-113, 1q7y:A, 109-113, 1q81:A, 109-113, 1q82:A, 109-113, 1q86:A, 109-113, 1qvf:0, 109-113, 1qvg:0, 109-113, 1s1i:3, 109-113, 1s72:0, 109-113, 1vq4:0, 109-113, 1vq5:0, 109-113, 1vq6:0, 109-113, 1vq7:0, 109-113, 1vq8:0, 109-113, 1vq9:0, 109-113, 1vqk:0, 109-113, 1vql:0, 109-113, 1vqm:0, 109-113, 1vqn:0, 109-113, 1vqo:0, 109-113, 1vqp:0, 109-113, 1w2b:0, 109-113, 1yhq:0, 109-113, 1yi2:0, 109-113, 1yij:0, 109-113, 1yit:0, 109-113, 1yj9:0, 109-113, 1yjn:0, 109-113, 1yjw:0, 109-113, 2otj:0, 109-113, 2otl:0, 109-113, 2qa4:0, 109-113, 2qex:0, 109-113, 3cc2:0, 109-113, 3cc4:0, 109-113, 3cc7:0, 109-113, 3cce:0, 109-113, 3ccj:0, 109-113, 3ccl:0, 109-113, 3ccm:0, 109-113, 3ccq:0, 109-113, 3ccr:0, 109-113, 3ccs:0, 109-113, 3ccu:0, 109-113, 3ccv:0, 109-113, 3cd6:0, 109-113, 3cma:0, 109-113, 3cme:0, 109-113, 3cpw:0, 109-113
AUA
1esh:A, 5-9
AUC
1ffk:0, 1480-1484, 1s1i:3, 1638-1642, 2j37:Z, 205-209
AUG
1jzc:A, 5-9
CCC
2jtp:A, 16-20
CUC
1j5a:A, 1491-1495, 1jzx:A, 1491-1495, 1jzy:A, 1491-1495, 1jzz:A, 1491-1495, 1k01:A, 1491-1495, 1ond:0, 1483-1487, 1p9x:0, 1459-1463
GAA
1j5a:A, 1127-1131, 1jzx:A, 1127-1131, 1jzy:A, 1127-1131, 1jzz:A, 1127-1131, 1k01:A, 1127-1131, 1njm:0, 1119-1123, 1njn:0, 1119-1123, 1njo:0, 1119-1123, 1njp:0, 1119-1123, 1nkw:0, 1119-1123, 1nwx:0, 1119-1123, 1nwy:0, 1119-1123, 1ond:0, 1119-1123, 1p9x:0, 1096-1100, 1pnu:0, 1135-1139, 1pny:0, 1135-1139, 1y69:0, 1119-1123, 2aar:0, 1119-1123, 2gya:0, 106-110, 2gyc:0, 106-110, 2o45:A, 1116-1120, 2ogm:0, 1119-1123, 2ogn:0, 1119-1123, 2uxd:A, 1122-1126, 2zjp:X, 1097-1101, 2zjq:X, 1097-1101, 2zjr:X, 1094-1098, 3cf5:X, 1097-1101, 3dll:X, 1097-1101
GGG
1c2w:B, 2250-2254
GUA
1i46:A, 5-9
UAA
1zse:R, 4-8, 2b2d:R, 3-7, 2bs0:R, 4-8, 2bs0:S, 3-7, 2bs1:R, 4-8, 2bs1:S, 4-8
UAU
1ik1:A, 5-9
UCA
6msf:R, 6-10, 6msf:S, 3-7
UCU
1fjg:A, 817-821, 1fka:A, 809-813, 1gid:A, 133-137, 1gid:B, 133-137, 1hnw:A, 817-821, 1hnx:A, 817-821, 1hnz:A, 817-821, 1hr0:A, 817-821, 1hr2:A, 132-136, 1hr2:B, 133-137, 1i94:A, 820-824, 1i95:A, 820-824, 1i96:A, 820-824, 1i97:A, 820-824, 1ibk:A, 817-821, 1ibl:A, 817-821, 1j5e:A, 817-821, 1n32:A, 817-821, 1n33:A, 817-821, 1n34:A, 817-821, 1s1h:A, 822-826, 1vs6:A, 85-89, 1vs8:A, 85-89, 1xmo:A, 817-821, 1xmq:A, 817-821, 1xnq:A, 817-821, 1xnr:A, 817-821, 1yl4:A, 817-821, 2aw4:A, 85-89, 2awb:A, 85-89, 2b64:A, 817-821, 2b9m:A, 817-821, 2b9o:A, 817-821, 2e5l:A, 818-822, 2f4v:A, 817-821, 2gy9:A, 804-808, 2gya:9, 81-85, 2gyb:A, 804-808, 2gyc:9, 81-85, 2hgi:A, 817-821, 2hgp:A, 817-821, 2hgr:A, 817-821, 2hhh:A, 817-821, 2i2t:A, 85-89, 2i2v:A, 85-89, 2j28:A, 85-89, 2ow8:y, 817-821, 2qam:A, 85-89, 2qao:A, 85-89, 2qba:A, 85-89, 2qbc:A, 85-89, 2qbe:A, 85-89, 2qbg:A, 85-89, 2qbi:A, 85-89, 2qbk:A, 85-89, 2qov:A, 85-89, 2qox:A, 85-89, 2qoz:A, 85-89, 2qp1:A, 85-89, 2uuc:A, 817-821, 2uxb:A, 817-821, 2uxc:A, 817-821, 2uxd:A, 795-799, 2vqe:A, 817-821, 2z4l:A, 85-89, 2z4n:A, 85-89, 3bbx:A, 85-89, 3d5a:A, 817-821, 3d5c:A, 817-821, 3df2:A, 85-89, 3df4:A, 85-89
UGG
1oq0:A, 6-10
UUA
1c2w:B, 2796-2800, 1i4b:A, 5-9, 1i4c:A, 5-9, 1vs6:B, 2743-2747, 1vs8:B, 2743-2747, 2aw4:B, 2743-2747, 2awb:B, 2743-2747, 2i2t:B, 2743-2747, 2i2v:B, 2743-2747, 2j28:B, 2743-2747, 2qam:B, 2743-2747, 2qao:B, 2743-2747, 2qba:B, 2743-2747, 2qbc:B, 2743-2747, 2qbe:B, 2743-2747, 2qbg:B, 2743-2747, 2qbi:B, 2743-2747, 2qbk:B, 2743-2747, 2qov:B, 2743-2747, 2qox:B, 2743-2747, 2qoz:B, 2743-2747, 2qp1:B, 2743-2747, 2z4l:B, 2743-2747, 2z4n:B, 2743-2747, 3bbx:B, 3026-3030, 3df2:B, 2743-2747, 3df4:B, 2743-2747
UUC
1njm:0, 1665-1669, 1njn:0, 1665-1669, 1njo:0, 1665-1669, 1njp:0, 1665-1669, 1nkw:0, 1665-1669, 1nwx:0, 1665-1669, 1nwy:0, 1665-1669, 1ond:0, 1664-1668, 1p9x:0, 1641-1645, 1pnu:0, 1681-1685, 1pny:0, 1681-1685, 1sm1:0, 1665-1669, 1xbp:0, 1665-1669, 1y69:0, 1665-1669, 1z58:2, 1656-1660, 2aar:0, 1665-1669, 2d3o:0, 1665-1669, 2o43:A, 1665-1669, 2o44:A, 1665-1669, 2o45:A, 1662-1666, 2ogm:0, 1665-1669, 2ogn:0, 1665-1669, 2ogo:0, 1664-1668, 2zjp:X, 1643-1647, 2zjq:X, 1643-1647, 2zjr:X, 1640-1644, 3cf5:X, 1643-1647, 3dll:X, 1643-1647
UUU
1fjg:A, 203-207, 1fka:A, 203-207, 1hnw:A, 203-207, 1hnx:A, 203-207, 1hnz:A, 203-207, 1hr0:A, 203-207, 1i95:A, 206-210, 1i96:A, 206-210, 1ibk:A, 203-207, 1ibl:A, 203-207, 1ibm:A, 203-207, 1j5e:A, 203-207, 1n32:A, 203-207, 1n33:A, 203-207, 1n36:A, 203-207, 1s1h:A, 205-209, 1xmq:A, 203-207, 1xnq:A, 203-207, 1xnr:A, 203-207, 1yl4:A, 203-207, 2b64:A, 203-207, 2b9m:A, 203-207, 2b9o:A, 203-207, 2e5l:A, 204-208, 2f4v:A, 203-207, 2gy9:A, 190-194, 2gyb:A, 190-194, 2hgi:A, 203-207, 2hgi:A, 75-79, 2hgp:A, 203-207, 2hgp:A, 75-79, 2hgr:A, 203-207, 2hgr:A, 75-79, 2hhh:A, 203-207, 2j00:A, 203-207, 2j02:A, 203-207, 2jl5:A, 203-207, 2jl7:A, 203-207, 2ow8:y, 203-207, 2qnh:y, 203-207, 2uu9:A, 203-207, 2uua:A, 203-207, 2uub:A, 203-207, 2uuc:A, 203-207, 2uxb:A, 203-207, 2uxc:A, 203-207, 2v46:A, 203-207, 2vqe:A, 203-207, 2vqf:A, 203-207, 3d5a:A, 203-207, 3d5c:A, 203-207