Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(007)-Segment cluster 1428 (cutoff=1.5 Å)
Cluster size 145 structure(s)
Representative structure 3ccq:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence VHKGABR
Cluster members
AUAGACA
2zjp:X, 966-974, 2zjq:X, 966-974, 3cf5:X, 966-974
CCAGACA
1vs6:B, 1027-1035, 1vs8:B, 1027-1035, 2aw4:B, 1027-1035, 2awb:B, 1027-1035, 2i2t:B, 1027-1035, 2i2v:B, 1027-1035, 2j28:B, 1027-1035, 2qam:B, 1027-1035, 2qao:B, 1027-1035, 2qba:B, 1027-1035, 2qbc:B, 1027-1035, 2qbe:B, 1027-1035, 2qbg:B, 1027-1035, 2qbi:B, 1027-1035, 2qbk:B, 1027-1035, 2qov:B, 1027-1035, 2qox:B, 1027-1035, 2qoz:B, 1027-1035, 2qp1:B, 1027-1035, 2z4l:B, 1027-1035, 2z4n:B, 1027-1035, 3bbx:B, 1105-1113, 3df2:B, 1027-1035, 3df4:B, 1027-1035
CUAGACA
1ffk:0, 1112-1120, 1jj2:0, 1116-1124, 1k73:A, 1116-1124, 1k8a:A, 1116-1124, 1k9m:A, 1116-1124, 1kc8:A, 1116-1124, 1kd1:A, 1116-1124, 1kqs:0, 1116-1124, 1m1k:A, 1116-1124, 1m90:A, 1116-1124, 1n8r:A, 1116-1124, 1nji:A, 1116-1124, 1q7y:A, 1116-1124, 1q81:A, 1116-1124, 1q82:A, 1116-1124, 1q86:A, 1116-1124, 1qvf:0, 1116-1124, 1qvg:0, 1116-1124, 1s72:0, 1116-1124, 1vq4:0, 1116-1124, 1vq5:0, 1116-1124, 1vq6:0, 1116-1124, 1vq7:0, 1116-1124, 1vq8:0, 1116-1124, 1vq9:0, 1116-1124, 1vqk:0, 1116-1124, 1vql:0, 1116-1124, 1vqm:0, 1116-1124, 1vqn:0, 1116-1124, 1vqo:0, 1116-1124, 1vqp:0, 1116-1124, 1w2b:0, 1116-1124, 1yhq:0, 1116-1124, 1yi2:0, 1116-1124, 1yij:0, 1116-1124, 1yit:0, 1116-1124, 1yj9:0, 1116-1124, 1yjn:0, 1116-1124, 1yjw:0, 1116-1124, 2otj:0, 1116-1124, 2otl:0, 1116-1124, 2qa4:0, 1115-1123, 2qex:0, 1116-1124, 3cc2:0, 1116-1124, 3cc4:0, 1116-1124, 3cc7:0, 1116-1124, 3cce:0, 1116-1124, 3ccj:0, 1116-1124, 3ccl:0, 1116-1124, 3ccm:0, 1116-1124, 3ccq:0, 1116-1124, 3ccr:0, 1116-1124, 3ccs:0, 1116-1124, 3ccu:0, 1116-1124, 3ccv:0, 1116-1124, 3cd6:0, 1116-1124, 3cma:0, 1116-1124, 3cme:0, 1116-1124, 3cpw:0, 1116-1124
GAAGACA
3d5b:A, 1063-1071, 3d5d:A, 1063-1071
GACGACG
1yl4:A, 268-276
GCAGAUA
1fjg:A, 678-686, 1hnw:A, 678-686, 1hnx:A, 678-686, 1hnz:A, 678-686, 1hr0:A, 678-686, 1i94:A, 681-689, 1i95:A, 681-689, 1i96:A, 681-689, 1ibk:A, 678-686, 1ibl:A, 678-686, 1ibm:A, 678-686, 1j5e:A, 678-686, 1n32:A, 678-686, 1n33:A, 678-686, 1n34:A, 678-686, 1n36:A, 678-686, 1pns:A, 692-700, 1pnx:A, 692-700, 1s1h:A, 683-691, 1voq:A, 692-700, 1vos:A, 692-700, 1vov:A, 692-700, 1vox:A, 692-700, 1voz:A, 692-700, 1xmo:A, 678-686, 1xmq:A, 678-686, 1xnq:A, 678-686, 1xnr:A, 678-686, 1yl4:A, 678-686, 1ysh:B, 48-56, 2b64:A, 678-686, 2b9m:A, 678-686, 2b9o:A, 678-686, 2e5l:A, 679-687, 2f4v:A, 678-686, 2hgr:A, 678-686, 2hhh:A, 678-686, 2j00:A, 678-686, 2j02:A, 678-686, 2jl5:A, 678-686, 2jl7:A, 678-686, 2ow8:y, 678-686, 2qnh:y, 678-686, 2uu9:A, 678-686, 2uua:A, 678-686, 2uub:A, 678-686, 2uuc:A, 678-686, 2uxb:A, 678-686, 2uxc:A, 678-686, 2uxd:A, 656-664, 2vqe:A, 678-686, 2vqf:A, 678-686, 3d5a:A, 678-686, 3d5c:A, 678-686
GUAGAGA
2gy9:A, 665-673, 2gyb:A, 665-673