Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(007)-Segment cluster 739 (cutoff=1.5 Å)
Cluster size 44 structure(s)
Representative structure 2aar:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence DVVMYYH
Cluster members
ACAGCCU
2o45:A, 795-803
AGGUUUA
3cd6:0, 2478-2486
GGGUUCA
1njn:0, 2472-2480, 1njo:0, 2472-2480, 1nkw:0, 2472-2480, 1ond:0, 2471-2479, 1p9x:0, 2447-2455, 1pnu:0, 2516-2524, 1pny:0, 2516-2524, 1xbp:0, 2472-2480, 1y69:0, 2472-2480, 1yl3:A, 2556-2564, 2aar:0, 2472-2480, 2d3o:0, 2493-2501, 2hgj:A, 2570-2578, 2hgq:A, 2570-2578, 2hgu:A, 2570-2578, 2j01:A, 2458-2466, 2j03:A, 2458-2466, 2jl6:A, 2537-2545, 2jl8:A, 2537-2545, 2o44:A, 2472-2480, 2o45:A, 2460-2468, 2ogm:0, 2472-2480, 2ogn:0, 2472-2480, 2ogo:0, 2471-2479, 2v47:A, 2453-2461, 2v49:A, 2453-2461, 2zjp:X, 2383-2391, 2zjq:X, 2383-2391, 2zjr:X, 2380-2388, 3cf5:X, 2383-2391, 3d5b:A, 2565-2573, 3d5d:A, 2565-2573, 3dll:X, 2383-2391
GGGUUUA
1qvg:0, 2478-2486, 1vq4:0, 2478-2486, 1vq5:0, 2478-2486, 1vq7:0, 2478-2486, 1vql:0, 2478-2486, 1vqm:0, 2478-2486, 1vqn:0, 2478-2486, 1vqp:0, 2478-2486
UACGCUC
1i97:A, 622-630