Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(007)-Segment cluster 1327 (cutoff=1.0 Å)
Cluster size 66 structure(s)
Representative structure 2zjp:Z (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence RANRRUK
Cluster members
AAAAAUA
1mnx:A, 31-39
AAAAGUC
1nkw:9, 97-105, 1nwx:9, 97-105, 1nwy:9, 97-105, 1pnu:9, 97-105, 1pny:9, 97-105, 1sm1:9, 97-105, 1xbp:9, 97-105, 1y69:9, 97-105, 2zjp:Z, 99-107, 2zjq:Y, 99-107, 2zjr:Y, 99-107, 3cf5:Z, 99-107, 3dll:Z, 99-107
AAUGAUA
2zjp:Z, 72-80, 2zjr:Y, 72-80
GACGAUA
1mnx:A, 4-12
GAGAGUA
1vs6:A, 96-104, 1vs8:A, 96-104, 1vsp:x, 98-106, 2aw4:A, 96-104, 2awb:A, 96-104, 2hgj:B, 100-108, 2i2t:A, 96-104, 2i2v:A, 96-104, 2j28:A, 96-104, 2jl6:B, 98-106, 2jl8:B, 98-106, 2qam:A, 96-104, 2qao:A, 96-104, 2qba:A, 96-104, 2qbc:A, 96-104, 2qbe:A, 96-104, 2qbg:A, 96-104, 2qbi:A, 96-104, 2qbk:A, 96-104, 2qov:A, 96-104, 2qox:A, 96-104, 2qoz:A, 96-104, 2qp1:A, 96-104, 2v47:B, 98-106, 2v49:B, 98-106, 2z4l:A, 96-104, 2z4n:A, 96-104, 3bbx:A, 96-104, 3d5b:B, 98-106, 3d5d:B, 98-106, 3df2:A, 96-104, 3df4:A, 96-104
GAUGGUA
1vs8:A, 70-78, 2awb:A, 70-78, 2i2t:A, 70-78, 2i2v:A, 70-78, 2j28:A, 70-78, 2jl6:B, 71-79, 2jl8:B, 71-79, 2qam:A, 70-78, 2qao:A, 70-78, 2qbc:A, 70-78, 2qbg:A, 70-78, 2qbk:A, 70-78, 2qox:A, 70-78, 2qp1:A, 70-78, 2z4l:A, 70-78, 2z4n:A, 70-78, 3df4:A, 70-78