Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(005)-Hairpin cluster 225 (cutoff=1.0 Å)
Cluster size 66 structure(s)
Representative structure 1n32:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence GABRA
Cluster members
GACGA
1fjg:A, 448-454, 1hnw:A, 448-454, 1hnx:A, 448-454, 1hnz:A, 448-454, 1hr0:A, 448-454, 1i94:A, 451-457, 1i95:A, 451-457, 1i96:A, 451-457, 1i97:A, 451-457, 1ibl:A, 448-454, 1ibm:A, 448-454, 1j5e:A, 448-454, 1n32:A, 448-454, 1n33:A, 448-454, 1s1h:A, 455-461, 1xmq:A, 448-454, 1yl4:A, 448-454, 2b64:A, 448-454, 2b9m:A, 448-454, 2b9o:A, 448-454, 2e5l:A, 449-455, 2f4v:A, 448-454, 2gy9:A, 435-441, 2gyb:A, 435-441, 2hgi:A, 448-454, 2hgp:A, 448-454, 2hgr:A, 448-454, 2hhh:A, 448-454, 2jl5:A, 448-454, 2jl7:A, 448-454, 2uu9:A, 448-454, 2uua:A, 448-454, 2uub:A, 448-454, 2uuc:A, 448-454, 2uxb:A, 448-454, 2uxc:A, 448-454, 2vqe:A, 448-454, 2vqf:A, 448-454
GAGGA
3d5a:A, 448-454, 3d5c:A, 448-454
GAUAA
1vs5:A, 1161-1167, 1vs7:A, 1161-1167, 2avy:A, 1161-1167, 2aw7:A, 1161-1167, 2i2p:A, 1161-1167, 2i2u:A, 1161-1167, 2qal:A, 1161-1167, 2qan:A, 1161-1167, 2qb9:A, 1161-1167, 2qbb:A, 1161-1167, 2qbd:A, 1161-1167, 2qbf:A, 1161-1167, 2qbh:A, 1161-1167, 2qbj:A, 1161-1167, 2qou:A, 1161-1167, 2qow:A, 1161-1167, 2qoy:A, 1161-1167, 2qp0:A, 1161-1167, 2z4k:A, 1161-1167, 2z4m:A, 1161-1167, 3bbn:A, 1108-1114, 3df1:A, 1161-1167, 3df3:A, 1161-1167
GAUGA
1vsp:w, 1196-1202, 3d5b:A, 1738-1744, 3d5d:A, 1738-1744