Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(005)-Hairpin cluster 556 (cutoff=1.0 Å)
Cluster size 99 structure(s)
Representative structure 1vqm:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence UYCGS
Cluster members
UCCGG
1vs5:A, 1130-1136, 2avy:A, 1130-1136, 2gy9:A, 1094-1100, 2gyb:A, 1094-1100, 2qal:A, 1130-1136, 2qan:A, 1130-1136, 2qb9:A, 1130-1136, 2qbb:A, 1130-1136, 2qbh:A, 1130-1136, 2qbj:A, 1130-1136, 2qoy:A, 1130-1136, 2z4k:A, 1130-1136, 2z4m:A, 1130-1136
UUCGC
1ffk:0, 127-133, 1jj2:0, 128-134, 1k73:A, 128-134, 1k8a:A, 128-134, 1k9m:A, 128-134, 1kc8:A, 128-134, 1kd1:A, 128-134, 1kqs:0, 128-134, 1m1k:A, 128-134, 1m90:A, 128-134, 1n8r:A, 128-134, 1nji:A, 128-134, 1q7y:A, 128-134, 1q81:A, 128-134, 1q82:A, 128-134, 1q86:A, 128-134, 1qvf:0, 128-134, 1qvg:0, 128-134, 1s1i:3, 127-133, 1s72:0, 128-134, 1vq4:0, 128-134, 1vq5:0, 128-134, 1vq6:0, 128-134, 1vq7:0, 128-134, 1vq8:0, 128-134, 1vq9:0, 128-134, 1vqk:0, 128-134, 1vql:0, 128-134, 1vqm:0, 128-134, 1vqn:0, 128-134, 1vqo:0, 128-134, 1vqp:0, 128-134, 1yhq:0, 128-134, 1yi2:0, 128-134, 1yij:0, 128-134, 1yit:0, 128-134, 1yj9:0, 128-134, 1yjn:0, 128-134, 1yjw:0, 128-134, 2otj:0, 128-134, 2otl:0, 128-134, 2qa4:0, 128-134, 2qex:0, 128-134, 3cc2:0, 128-134, 3cc4:0, 128-134, 3cc7:0, 128-134, 3cce:0, 128-134, 3ccl:0, 128-134, 3ccm:0, 128-134, 3ccq:0, 128-134, 3ccr:0, 128-134, 3ccs:0, 128-134, 3ccu:0, 128-134, 3ccv:0, 128-134, 3cd6:0, 128-134, 3cma:0, 128-134, 3cme:0, 128-134, 3cpw:0, 128-134
UUCGG
1fjg:A, 1112-1118, 1hnx:A, 1112-1118, 1hnz:A, 1112-1118, 1ibl:A, 1112-1118, 1ibm:A, 1112-1118, 1j5e:A, 1112-1118, 1n32:A, 1112-1118, 1n33:A, 1112-1118, 1pns:A, 1128-1134, 1pnx:A, 1128-1134, 1s1h:A, 1113-1119, 1xnq:A, 1107-1113, 1xnr:A, 1107-1113, 1yl4:A, 1112-1118, 2b64:A, 1112-1118, 2b9m:A, 1112-1118, 2b9o:A, 1112-1118, 2e5l:A, 1113-1119, 2hgp:A, 1112-1118, 2hgr:A, 1112-1118, 2hhh:A, 1112-1118, 2uu9:A, 1112-1118, 2uub:A, 1112-1118, 2uxc:A, 1112-1118, 2vqe:A, 1112-1118, 2vqf:A, 1112-1118, 3d5a:A, 1112-1118, 3d5c:A, 1112-1118