Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(006)-Segment cluster 271 (cutoff=3.0 Å)
Cluster size 953 structure(s)
Representative structure 1k01:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NNNNNN
Cluster members
AAACUU
2ogn:0, 2079-2086
AAAGAC
1vs6:B, 2041-2048, 1vs8:B, 2041-2048, 1vsa:w, 2057-2064, 1yhq:0, 2060-2067, 1yi2:0, 2060-2067, 1yij:0, 2060-2067, 1yjn:0, 2060-2067, 1yjw:0, 2060-2067, 2aw4:B, 2041-2048, 2awb:B, 2041-2048, 2hgj:A, 2057-2064, 2hgq:A, 2057-2064, 2i2t:B, 2041-2048, 2i2v:B, 2041-2048, 2j28:B, 2041-2048, 2qam:B, 2041-2048, 2qao:B, 2041-2048, 2qba:B, 2041-2048, 2qbc:B, 2041-2048, 2qbe:B, 2041-2048, 2qbg:B, 2041-2048, 2qbi:B, 2041-2048, 2qbk:B, 2041-2048, 2qov:B, 2041-2048, 2qox:B, 2041-2048, 2qoz:B, 2041-2048, 2qp1:B, 2041-2048, 2vhm:B, 2041-2048, 2vhn:B, 2041-2048, 2z4l:B, 2041-2048, 2z4n:B, 2041-2048, 3cc7:0, 2060-2067, 3cce:0, 2060-2067, 3ccj:0, 2060-2067, 3ccl:0, 2060-2067, 3ccm:0, 2060-2067, 3ccq:0, 2060-2067, 3ccr:0, 2060-2067, 3ccs:0, 2060-2067, 3ccu:0, 2060-2067, 3ccv:0, 2060-2067, 3cd6:0, 2060-2067, 3cpw:0, 2060-2067, 3df2:B, 2041-2048, 3df4:B, 2041-2048
AAGGGU
2b66:A, 2458-2465, 2b9n:A, 2458-2465, 2b9p:A, 2458-2465
AAUACU
1ykq:B, 28-35, 1ykq:D, 28-35
ACCUGG
1i97:A, 718-725
ACGAAA
2vhm:B, 2707-2714
ACGCUA
1vou:B, 1397-1404, 1vow:B, 1397-1404, 1vp0:B, 1397-1404
AGAACC
1xbp:0, 1602-1609
AGAAGU
2qal:A, 1426-1433, 2qan:A, 1426-1433, 2qou:A, 1426-1433, 2qow:A, 1426-1433
AGAGAA
1vor:B, 1616-1623, 1vou:B, 1616-1623, 1vow:B, 1616-1623, 1voy:B, 1616-1623, 1vp0:B, 1616-1623
AGCACA
1i95:A, 1021-1028
AGCCCU
1xnr:A, 1007-1014, 2uub:A, 1012-1019
AGCCUA
2hgu:A, 312-319
AGCCUC
1xbp:0, 797-804
AGCGAC
1n34:A, 383-390, 1yl4:A, 383-390
AGCGUU
3bbo:A, 1159-1166
AGCUUU
1nwy:0, 1987-1994
AGGAUA
1fmn:A, 7-14
AGGUUU
2b66:A, 2405-2412, 2b9n:A, 2405-2412, 2b9p:A, 2405-2412
AUAAGU
2vhm:B, 2684-2691
AUCAGU
1l9a:B, 117-124
AUCGUA
1vs6:B, 1581-1588, 1vs8:B, 1581-1588, 2aw4:B, 1581-1588, 2awb:B, 1581-1588, 2gya:0, 1518-1525, 2gyc:0, 1518-1525, 2i2t:B, 1581-1588, 2i2v:B, 1581-1588, 2j28:B, 1581-1588, 2qam:B, 1581-1588, 2qao:B, 1581-1588, 2qba:B, 1581-1588, 2qbc:B, 1581-1588, 2qbe:B, 1581-1588, 2qbg:B, 1581-1588, 2qbi:B, 1581-1588, 2qbk:B, 1581-1588, 2qov:B, 1581-1588, 2qox:B, 1581-1588, 2qoz:B, 1581-1588, 2qp1:B, 1581-1588, 2vhm:B, 1581-1588, 2vhn:B, 1581-1588, 2z4l:B, 1581-1588, 2z4n:B, 1581-1588, 3df2:B, 1581-1588, 3df4:B, 1581-1588
AUGAAA
3bbn:A, 847-854
AUGCAA
1n36:A, 50-57, 2j00:A, 50-57, 2j02:A, 50-57, 2v46:A, 50-57, 2v48:A, 50-57
AUGGGA
2uxb:A, 1390-1397
AUGUGG
1fka:A, 168-175, 1i97:A, 171-178, 2b64:A, 168-175, 2b9m:A, 168-175, 2b9o:A, 168-175
CAAUGG
2f4v:A, 362-369
CACUUU
2vhp:A, 1462-1469
CCACCU
3bbo:A, 2455-2462
CCACUU
2vho:A, 1461-1468
CCAGAA
1yl3:A, 1491-1498, 2b66:A, 1491-1498, 2b9n:A, 1491-1498, 2b9p:A, 1491-1498
CCCGUA
1p9x:0, 1523-1530, 1sm1:0, 1547-1554, 1vs6:B, 334-341, 1vs8:B, 334-341, 1vsa:w, 1621-1628, 1vsa:w, 359-366, 1vsp:w, 359-366, 1xbp:0, 1547-1554, 1y69:0, 1547-1554, 2aar:0, 1547-1554, 2aw4:B, 334-341, 2awb:B, 334-341, 2b66:A, 1621-1628, 2b9n:A, 1621-1628, 2b9p:A, 1621-1628, 2d3o:0, 1547-1554, 2i2t:B, 334-341, 2i2v:B, 334-341, 2j01:A, 1538-1545, 2j01:A, 347-354, 2j03:A, 1538-1545, 2j03:A, 347-354, 2j28:B, 334-341, 2jl6:A, 1617-1624, 2jl6:A, 347-354, 2jl8:A, 1617-1624, 2jl8:A, 347-354, 2o43:A, 1547-1554, 2o44:A, 1547-1554, 2o45:A, 1544-1551, 2ogm:0, 1547-1554, 2qam:B, 334-341, 2qao:B, 334-341, 2qba:B, 334-341, 2qbc:B, 334-341, 2qbe:B, 334-341, 2qbg:B, 334-341, 2qbi:B, 334-341, 2qbk:B, 334-341, 2qov:B, 334-341, 2qox:B, 334-341, 2qoz:B, 334-341, 2qp1:B, 334-341, 2v47:A, 1538-1545, 2v49:A, 1538-1545, 2vhm:B, 334-341, 2z4l:B, 334-341, 2z4n:B, 334-341, 2zjp:X, 1525-1532, 2zjq:X, 1525-1532, 2zjr:X, 1522-1529, 3bbx:B, 334-341, 3cf5:X, 1525-1532, 3d5b:A, 1616-1623, 3d5b:A, 354-361, 3d5d:A, 1616-1623, 3d5d:A, 354-361, 3df2:B, 334-341, 3df4:B, 334-341, 3dll:X, 1525-1532
CCGAAG
1j5a:A, 867-874, 1jzy:A, 867-874, 1jzz:A, 867-874, 1k01:A, 867-874, 1p9x:0, 836-843, 1sm1:0, 859-866, 1y69:0, 859-866, 2o43:A, 859-866, 2ogn:0, 859-866, 2ogo:0, 858-865
CCGCUU
1n36:A, 390-397
CCGUGA
1n33:A, 1450-1457, 1n36:A, 1450-1457
CCUAAU
2gya:0, 226-233, 2gyc:0, 226-233
CCUCAA
1j5a:A, 261-268, 1jzx:A, 261-268, 1jzy:A, 261-268, 1jzz:A, 261-268, 1k01:A, 261-268, 1p9x:0, 259-266, 2o44:A, 259-266, 2ogn:0, 259-266
CCUGAA
2vhm:B, 2751-2758, 2vhn:B, 2751-2758, 3bbx:B, 3034-3041
CCUGUA
1j5a:A, 307-314, 1jzx:A, 307-314, 1jzy:A, 307-314, 1jzz:A, 307-314, 1k01:A, 307-314, 1njm:0, 305-312, 1njn:0, 305-312, 1njo:0, 305-312, 1njp:0, 305-312, 1nkw:0, 305-312, 1nwx:0, 305-312, 1nwy:0, 305-312, 1ond:0, 305-312, 1p9x:0, 305-312, 1pnu:0, 305-312, 1pny:0, 305-312, 1sm1:0, 305-312, 1vor:B, 305-312, 1vou:B, 305-312, 1vow:B, 305-312, 1voy:B, 305-312, 1vp0:B, 305-312, 2aar:0, 305-312, 2d3o:0, 305-312, 2o43:A, 305-312, 2o45:A, 305-312, 2ogm:0, 305-312, 2ogn:0, 305-312, 2ogo:0, 304-311, 2zjp:X, 295-302, 2zjq:X, 295-302, 2zjr:X, 295-302, 3cf5:X, 295-302, 3dll:X, 295-302
CGAAAC
2v47:A, 681-688, 2v49:A, 681-688
CGAACC
3bbo:A, 653-660
CGAAGU
1ffk:0, 293-300, 1fka:A, 1388-1395, 1jj2:0, 294-301, 1k73:A, 294-301, 1k8a:A, 294-301, 1k9m:A, 294-301, 1kc8:A, 294-301, 1kd1:A, 294-301, 1kqs:0, 294-301, 1m1k:A, 294-301, 1m90:A, 294-301, 1n33:A, 1462-1469, 1n8r:A, 294-301, 1nji:A, 294-301, 1q7y:A, 294-301, 1q81:A, 294-301, 1q82:A, 294-301, 1q86:A, 294-301, 1qvf:0, 294-301, 1qvg:0, 294-301, 1s1i:3, 293-300, 1s72:0, 294-301, 1voq:A, 1424-1431, 1vos:A, 1424-1431, 1vov:A, 1424-1431, 1vox:A, 1424-1431, 1voz:A, 1424-1431, 1vq4:0, 294-301, 1vq5:0, 294-301, 1vq6:0, 294-301, 1vq7:0, 294-301, 1vq8:0, 294-301, 1vq9:0, 294-301, 1vqk:0, 294-301, 1vql:0, 294-301, 1vqm:0, 294-301, 1vqn:0, 294-301, 1vqo:0, 294-301, 1vqp:0, 294-301, 1w2b:0, 294-301, 1yhq:0, 294-301, 1yi2:0, 294-301, 1yij:0, 294-301, 1yit:0, 294-301, 1yj9:0, 294-301, 1yjn:0, 294-301, 1yjw:0, 294-301, 2f4v:A, 1462-1469, 2otj:0, 294-301, 2otl:0, 294-301, 2qa4:0, 294-301, 2qex:0, 294-301, 2uxd:A, 1386-1393, 3bbn:A, 1374-1381, 3cc2:0, 294-301, 3cc4:0, 294-301, 3cc7:0, 294-301, 3cce:0, 294-301, 3ccj:0, 294-301, 3ccl:0, 294-301, 3ccm:0, 294-301, 3ccq:0, 294-301, 3ccr:0, 294-301, 3ccs:0, 294-301, 3ccu:0, 294-301, 3ccv:0, 294-301, 3cd6:0, 294-301, 3cma:0, 294-301, 3cme:0, 294-301, 3cpw:0, 294-301
CGCCGA
1n36:A, 1435-1442
CGCUGU
2o44:A, 1904-1911
CGGAAC
3bwp:A, 302-309
CGGAGG
1j5a:A, 691-698, 1jzx:A, 691-698, 1jzy:A, 691-698, 1jzz:A, 691-698, 1k01:A, 691-698, 1njm:0, 686-693, 1njn:0, 686-693, 1njo:0, 686-693, 1njp:0, 686-693, 1nkw:0, 686-693, 1nwx:0, 686-693, 1nwy:0, 686-693, 1ond:0, 686-693, 1p9x:0, 663-670, 1pnu:0, 686-693, 1pny:0, 686-693, 1sm1:0, 686-693, 1y69:0, 686-693, 2aar:0, 686-693, 2d3o:0, 686-693, 2o43:A, 686-693, 2o44:A, 686-693, 2o45:A, 686-693, 2ogm:0, 686-693, 2ogn:0, 686-693, 2ogo:0, 685-692, 2zjp:X, 664-671, 2zjq:X, 664-671, 2zjr:X, 664-671, 3cf5:X, 664-671, 3dll:X, 664-671
CGGCCU
2vhn:B, 1097-1104
CGGUAA
2hgj:A, 2792-2799, 2hgq:A, 2792-2799, 2hgu:A, 2792-2799
CUAAAC
1yl3:A, 256-263
CUAAUA
1vs5:A, 164-171, 1vs7:A, 164-171, 2avy:A, 164-171, 2aw7:A, 164-171, 2gy9:A, 157-164, 2gyb:A, 157-164, 2i2p:A, 164-171, 2i2u:A, 164-171, 2qal:A, 164-171, 2qan:A, 164-171, 2qb9:A, 164-171, 2qbb:A, 164-171, 2qbd:A, 164-171, 2qbf:A, 164-171, 2qbh:A, 164-171, 2qbj:A, 164-171, 2qou:A, 164-171, 2qow:A, 164-171, 2qoy:A, 164-171, 2qp0:A, 164-171, 2z4k:A, 164-171, 2z4m:A, 164-171, 3df1:A, 164-171, 3df3:A, 164-171
CUAAUC
2jl5:A, 158-165, 2jl7:A, 158-165
CUCGUC
1vou:B, 2445-2452, 1vow:B, 2445-2452, 1voy:B, 2445-2452
CUGAAU
1vs6:B, 274-281, 1vs8:B, 274-281, 2aw4:B, 274-281, 2awb:B, 274-281, 2i2t:B, 274-281, 2i2v:B, 274-281, 2j28:B, 274-281, 2qam:B, 274-281, 2qao:B, 274-281, 2qba:B, 274-281, 2qbc:B, 274-281, 2qbe:B, 274-281, 2qbg:B, 274-281, 2qbi:B, 274-281, 2qbk:B, 274-281, 2qov:B, 274-281, 2qox:B, 274-281, 2qoz:B, 274-281, 2qp1:B, 274-281, 2z4l:B, 274-281, 2z4n:B, 274-281, 3bbx:B, 274-281, 3df2:B, 274-281, 3df4:B, 274-281
CUGGCG
1vor:B, 32-39, 1vou:B, 32-39, 1vow:B, 32-39, 1voy:B, 32-39, 1vp0:B, 32-39
CUGUAG
1xbp:0, 819-826, 2v47:A, 865-872, 2v49:A, 865-872
GAAACC
2qa4:9, 101-108
GAACCC
1vor:B, 230-237, 1vou:B, 230-237, 1vow:B, 230-237, 1voy:B, 230-237, 1vp0:B, 230-237
GAAGAC
1ffk:0, 2010-2017, 1jj2:0, 2060-2067, 1k73:A, 2060-2067, 1k8a:A, 2060-2067, 1k9m:A, 2060-2067, 1kc8:A, 2060-2067, 1kd1:A, 2060-2067, 1kqs:0, 2060-2067, 1m1k:A, 2060-2067, 1m90:A, 2060-2067, 1n8r:A, 2060-2067, 1nji:A, 2060-2067, 1q7y:A, 2060-2067, 1q81:A, 2060-2067, 1q82:A, 2060-2067, 1q86:A, 2060-2067, 1qvf:0, 2060-2067, 1qvg:0, 2060-2067, 1s1i:3, 2246-2253, 1s72:0, 2060-2067, 1vq4:0, 2060-2067, 1vq5:0, 2060-2067, 1vq6:0, 2060-2067, 1vq7:0, 2060-2067, 1vq8:0, 2060-2067, 1vq9:0, 2060-2067, 1vqk:0, 2060-2067, 1vql:0, 2060-2067, 1vqm:0, 2060-2067, 1vqn:0, 2060-2067, 1vqo:0, 2060-2067, 1vqp:0, 2060-2067, 1w2b:0, 2060-2067, 1yit:0, 2060-2067, 1yj9:0, 2060-2067, 2otj:0, 2060-2067, 2otl:0, 2060-2067, 2qa4:0, 2065-2072, 2qex:0, 2060-2067, 3cc2:0, 2060-2067, 3cc4:0, 2060-2067, 3cma:0, 2060-2067, 3cme:0, 2060-2067
GAAGCC
2d3o:0, 1804-1811
GAAGUC
2f4v:A, 1409-1416
GAAUCC
2v49:A, 293-300
GACAAA
2nz4:P, 119-126, 2nz4:Q, 119-126, 2nz4:R, 119-126, 2nz4:S, 119-126, 3bbn:A, 1189-1196
GACUAA
1vs6:B, 8-15, 1vs8:B, 8-15, 2aw4:B, 8-15, 2awb:B, 8-15, 2i2t:B, 8-15, 2i2v:B, 8-15, 2j28:B, 8-15, 2qam:B, 8-15, 2qao:B, 8-15, 2qba:B, 8-15, 2qbc:B, 8-15, 2qbe:B, 8-15, 2qbg:B, 8-15, 2qbi:B, 8-15, 2qbk:B, 8-15, 2qov:B, 8-15, 2qox:B, 8-15, 2qoz:B, 8-15, 2qp1:B, 8-15, 2vhm:B, 8-15, 2vhn:B, 8-15, 2z4l:B, 8-15, 2z4n:B, 8-15, 3df2:B, 8-15, 3df4:B, 8-15
GACUGG
2uxb:A, 1454-1461
GAGCGG
1n33:A, 1394-1401, 1n36:A, 1394-1401
GAUAAC
3ccj:0, 2344-2351
GCAACC
1i97:A, 1088-1095, 2b64:A, 1085-1092, 2b9m:A, 1085-1092, 2b9o:A, 1085-1092
GCAGGG
2hgq:A, 1499-1506, 2hgu:A, 1499-1506
GCCAAG
1gid:A, 112-119, 1gid:B, 112-119, 1hr2:A, 111-118, 1hr2:B, 112-119
GCGAAG
2aar:0, 1490-1497, 2o43:A, 1490-1497
GCGGCA
2vhm:B, 2029-2036
GCUAAU
1fka:A, 157-164, 1i94:A, 160-167
GCUCAA
2ogm:0, 1421-1428
GCUGGA
2v47:A, 1181-1188, 2v49:A, 1181-1188
GGAACU
2vhp:A, 622-629
GGAAUU
2v46:A, 651-658
GGACAA
2j00:A, 136-143, 2j02:A, 136-143
GGAGCG
1xbp:0, 1139-1146, 2o44:A, 1782-1789
GGAGGA
2gyc:0, 661-668
GGAGGU
3bbo:A, 705-712
GGCACU
1fjg:A, 1120-1127, 1hnx:A, 1120-1127, 1hr0:A, 1120-1127, 1ibl:A, 1120-1127, 1ibm:A, 1120-1127, 1j5e:A, 1120-1127, 1n32:A, 1120-1127, 1pns:A, 1136-1143, 1pnx:A, 1136-1143, 1s1h:A, 1121-1128, 1xnq:A, 1115-1122, 1yl4:A, 1120-1127, 2b64:A, 1120-1127, 2b9m:A, 1120-1127, 2b9o:A, 1120-1127, 2e5l:A, 1121-1128, 2hgi:A, 1120-1127, 2hgp:A, 1120-1127, 2hgr:A, 1120-1127, 2uu9:A, 1120-1127, 2vqe:A, 1120-1127, 2vqf:A, 1120-1127, 3d5a:A, 1120-1127, 3d5c:A, 1120-1127
GGCGCA
1yl3:A, 2599-2606
GGGAAC
3dll:X, 154-161
GGGAAG
2vhn:B, 1019-1026
GGGAGC
1i97:A, 610-617
GGGGAA
1grz:B, 182-189
GGGGCG
1i97:A, 573-580
GGGUAG
1vs6:B, 856-863, 1vs8:B, 856-863, 2aw4:B, 856-863, 2awb:B, 856-863, 2gya:0, 792-799, 2i2t:B, 856-863, 2i2v:B, 856-863, 2j28:B, 856-863, 2qam:B, 856-863, 2qao:B, 856-863, 2qba:B, 856-863, 2qbc:B, 856-863, 2qbe:B, 856-863, 2qbg:B, 856-863, 2qbi:B, 856-863, 2qbk:B, 856-863, 2qov:B, 856-863, 2qox:B, 856-863, 2qoz:B, 856-863, 2qp1:B, 856-863, 2z4l:B, 856-863, 2z4n:B, 856-863, 3bbx:B, 856-863, 3df2:B, 856-863, 3df4:B, 856-863
GGGUUU
2ogn:0, 2016-2023
GUAAAA
2gcs:B, 79-86, 2gcv:B, 79-86, 2h0s:B, 79-86, 2h0w:B, 79-86, 2h0x:B, 79-86, 2h0z:B, 79-86, 2ho6:B, 79-86, 2ho7:B, 79-86, 2z74:B, 79-86, 2z75:B, 79-86, 3b4a:B, 78-85, 3b4b:B, 79-86, 3b4c:B, 78-85
GUCCAA
2vhm:B, 1300-1307, 2vhn:B, 1300-1307
GUGCCC
1qzw:B, 37-44, 1qzw:D, 37-44, 1qzw:F, 37-44, 1qzw:H, 37-44
UAAAUA
1j5a:A, 394-401, 1jzx:A, 394-401, 1jzy:A, 394-401, 1jzz:A, 394-401, 1k01:A, 394-401, 1njm:0, 389-396, 1njn:0, 389-396, 1njo:0, 389-396, 1njp:0, 389-396, 1nkw:0, 389-396, 1nwx:0, 389-396, 1nwy:0, 389-396, 1ond:0, 389-396, 1pnu:0, 389-396, 1pny:0, 389-396, 1sm1:0, 389-396, 1vs6:B, 426-433, 1vs8:B, 426-433, 1xbp:0, 389-396, 1y69:0, 389-396, 2aar:0, 389-396, 2aw4:B, 426-433, 2awb:B, 426-433, 2d3o:0, 389-396, 2i2t:B, 426-433, 2i2v:B, 426-433, 2j28:B, 426-433, 2o43:A, 389-396, 2ogm:0, 389-396, 2ogn:0, 389-396, 2ogo:0, 388-395, 2qam:B, 426-433, 2qao:B, 426-433, 2qba:B, 426-433, 2qbc:B, 426-433, 2qbe:B, 426-433, 2qbg:B, 426-433, 2qbi:B, 426-433, 2qbk:B, 426-433, 2qov:B, 426-433, 2qox:B, 426-433, 2qoz:B, 426-433, 2qp1:B, 426-433, 2z4l:B, 426-433, 2z4n:B, 426-433, 2zjp:X, 367-374, 2zjq:X, 367-374, 2zjr:X, 367-374, 3bbx:B, 426-433, 3cf5:X, 367-374, 3df2:B, 426-433, 3df4:B, 426-433, 3dll:X, 367-374
UAAGUA
1vsa:w, 454-461, 1vsp:w, 454-461, 1yl3:A, 453-460, 2b66:A, 453-460, 2b9n:A, 453-460, 2b9p:A, 453-460, 2hgq:A, 453-460, 2j01:A, 442-449, 2j03:A, 442-449, 2jl6:A, 442-449, 2jl8:A, 442-449, 2v47:A, 442-449, 2v49:A, 442-449, 3d5b:A, 449-456, 3d5d:A, 449-456
UAAUGA
2vhm:B, 1959-1966, 2vhn:B, 1959-1966
UACCCG
1i97:A, 125-132
UAGACA
3bbo:A, 2174-2181
UAGACG
1i94:A, 633-640, 2jl5:A, 630-637, 2jl7:A, 630-637
UAGGUC
2v48:A, 805-812
UAGGUG
2hgj:A, 381-388, 2hgu:A, 381-388
UAGUAA
1y69:0, 8-15, 2aar:0, 8-15, 2o43:A, 8-15, 2o44:A, 8-15, 2o45:A, 8-15, 2ogm:0, 8-15, 2zjq:X, 8-15, 3dll:X, 8-15
UAUCGA
2fey:A, 5-12
UCAGAC
2ogm:0, 1463-1470
UCCCAA
2vhm:B, 2483-2490, 2vhn:B, 2483-2490
UCCGUA
1ffk:0, 1593-1600, 1jj2:0, 1643-1650, 1k73:A, 1643-1650, 1k8a:A, 1643-1650, 1k9m:A, 1643-1650, 1kc8:A, 1643-1650, 1kd1:A, 1643-1650, 1kqs:0, 1643-1650, 1m1k:A, 1643-1650, 1m90:A, 1643-1650, 1n8r:A, 1643-1650, 1nji:A, 1643-1650, 1q7y:A, 1643-1650, 1q81:A, 1643-1650, 1q82:A, 1643-1650, 1q86:A, 1643-1650, 1qvf:0, 1643-1650, 1qvg:0, 1643-1650, 1s1i:3, 1751-1758, 1s72:0, 1643-1650, 1vq4:0, 1643-1650, 1vq5:0, 1643-1650, 1vq6:0, 1643-1650, 1vq7:0, 1643-1650, 1vq8:0, 1643-1650, 1vq9:0, 1643-1650, 1vqk:0, 1643-1650, 1vql:0, 1643-1650, 1vqm:0, 1643-1650, 1vqn:0, 1643-1650, 1vqo:0, 1643-1650, 1vqp:0, 1643-1650, 1w2b:0, 1643-1650, 1yhq:0, 1643-1650, 1yi2:0, 1643-1650, 1yij:0, 1643-1650, 1yit:0, 1643-1650, 1yj9:0, 1643-1650, 1yjn:0, 1643-1650, 1yjw:0, 1643-1650, 2otj:0, 1643-1650, 2otl:0, 1643-1650, 2qa4:0, 1648-1655, 2qex:0, 1643-1650, 3cc2:0, 1643-1650, 3cc4:0, 1643-1650, 3cc7:0, 1643-1650, 3cce:0, 1643-1650, 3ccj:0, 1643-1650, 3ccl:0, 1643-1650, 3ccm:0, 1643-1650, 3ccq:0, 1643-1650, 3ccr:0, 1643-1650, 3ccs:0, 1643-1650, 3ccu:0, 1643-1650, 3ccv:0, 1643-1650, 3cd6:0, 1643-1650, 3cma:0, 1643-1650, 3cme:0, 1643-1650, 3cpw:0, 1643-1650
UCGGGA
1njm:0, 1472-1479, 1njn:0, 1472-1479, 1njo:0, 1472-1479, 1njp:0, 1472-1479, 1nkw:0, 1472-1479, 1nwx:0, 1472-1479, 1nwy:0, 1472-1479, 1ond:0, 1472-1479, 1pnu:0, 1488-1495, 1pny:0, 1488-1495, 2gya:0, 1445-1452, 2ogm:0, 1472-1479
UCGGUC
2vhm:B, 2551-2558, 2vhn:B, 2551-2558
UCUCAU
1yhq:0, 272-279, 1yi2:0, 272-279, 1yij:0, 272-279, 1yit:0, 272-279, 1yj9:0, 272-279, 1yjn:0, 272-279, 1yjw:0, 272-279, 3cc2:0, 272-279, 3cc4:0, 272-279, 3cc7:0, 272-279, 3cce:0, 272-279, 3ccj:0, 272-279, 3ccl:0, 272-279, 3ccm:0, 272-279, 3ccq:0, 272-279, 3ccr:0, 272-279, 3ccs:0, 272-279, 3ccu:0, 272-279, 3ccv:0, 272-279, 3cd6:0, 272-279, 3cma:0, 272-279, 3cme:0, 272-279
UGAAAC
1vor:B, 665-672, 1vou:B, 665-672, 1vow:B, 665-672, 1voy:B, 665-672, 1vp0:B, 665-672
UGAACC
1hr0:A, 427-434, 1n33:A, 427-434, 2f4v:A, 427-434
UGCGAA
2o44:A, 1796-1803
UGGAUG
1j5a:A, 24-31, 1jzx:A, 24-31, 1jzy:A, 24-31, 1jzz:A, 24-31, 1k01:A, 24-31, 1njm:0, 24-31, 1njn:0, 24-31, 1njo:0, 24-31, 1njp:0, 24-31, 1nkw:0, 24-31, 1nwx:0, 24-31, 1nwy:0, 24-31, 1ond:0, 24-31, 1pnu:0, 24-31, 1pny:0, 24-31, 1sm1:0, 24-31, 1vs6:B, 24-31, 1vs8:B, 24-31, 1vsa:w, 24-31, 1vsp:w, 24-31, 1xbp:0, 24-31, 1y69:0, 24-31, 1yl3:A, 24-31, 1z58:2, 24-31, 2aar:0, 24-31, 2aw4:B, 24-31, 2awb:B, 24-31, 2b66:A, 24-31, 2b9n:A, 24-31, 2b9p:A, 24-31, 2d3o:0, 24-31, 2gya:0, 9-16, 2gyc:0, 9-16, 2i2t:B, 24-31, 2i2v:B, 24-31, 2j01:A, 19-26, 2j03:A, 19-26, 2j28:B, 24-31, 2jl6:A, 19-26, 2jl8:A, 19-26, 2o43:A, 24-31, 2o44:A, 24-31, 2o45:A, 24-31, 2ogm:0, 24-31, 2ogn:0, 24-31, 2ogo:0, 23-30, 2qam:B, 24-31, 2qao:B, 24-31, 2qba:B, 24-31, 2qbc:B, 24-31, 2qbe:B, 24-31, 2qbg:B, 24-31, 2qbi:B, 24-31, 2qbk:B, 24-31, 2qov:B, 24-31, 2qox:B, 24-31, 2qoz:B, 24-31, 2qp1:B, 24-31, 2v47:A, 19-26, 2v49:A, 19-26, 2vhm:B, 24-31, 2vhn:B, 24-31, 2z4l:B, 24-31, 2z4n:B, 24-31, 2zjp:X, 24-31, 2zjq:X, 24-31, 2zjr:X, 24-31, 3bbx:B, 24-31, 3cf5:X, 24-31, 3d5b:A, 19-26, 3d5d:A, 19-26, 3df2:B, 24-31, 3df4:B, 24-31, 3dll:X, 24-31
UGGAUU
1ffk:0, 12-19, 1jj2:0, 12-19, 1k73:A, 12-19, 1k8a:A, 12-19, 1k9m:A, 12-19, 1kc8:A, 12-19, 1kd1:A, 12-19, 1kqs:0, 12-19, 1m1k:A, 12-19, 1m90:A, 12-19, 1n8r:A, 12-19, 1nji:A, 12-19, 1q7y:A, 12-19, 1q81:A, 12-19, 1q82:A, 12-19, 1q86:A, 12-19, 1qvf:0, 12-19, 1qvg:0, 12-19, 1s1i:3, 12-19, 1s72:0, 12-19, 1vq4:0, 12-19, 1vq5:0, 12-19, 1vq6:0, 12-19, 1vq7:0, 12-19, 1vq8:0, 12-19, 1vq9:0, 12-19, 1vqk:0, 12-19, 1vql:0, 12-19, 1vqm:0, 12-19, 1vqn:0, 12-19, 1vqo:0, 12-19, 1vqp:0, 12-19, 1w2b:0, 12-19, 1yhq:0, 12-19, 1yi2:0, 12-19, 1yij:0, 12-19, 1yit:0, 12-19, 1yj9:0, 12-19, 1yjn:0, 12-19, 1yjw:0, 12-19, 2otj:0, 12-19, 2otl:0, 12-19, 2qa4:0, 12-19, 2qex:0, 12-19, 3cc2:0, 12-19, 3cc4:0, 12-19, 3cc7:0, 12-19, 3cce:0, 12-19, 3ccj:0, 12-19, 3ccl:0, 12-19, 3ccm:0, 12-19, 3ccq:0, 12-19, 3ccr:0, 12-19, 3ccs:0, 12-19, 3ccu:0, 12-19, 3ccv:0, 12-19, 3cd6:0, 12-19, 3cma:0, 12-19, 3cme:0, 12-19, 3cpw:0, 12-19
UGGCGG
1njm:0, 2124-2131, 1njn:0, 2124-2131, 1njo:0, 2124-2131, 1njp:0, 2124-2131, 2aar:0, 2124-2131, 2ogm:0, 2124-2131, 2ogn:0, 2124-2131, 3cf5:X, 2035-2042, 3dll:X, 2035-2042
UGGUAA
2hgq:A, 8-15, 2hgu:A, 8-15
UGUAGA
2ogo:0, 2207-2214
UUAUCC
2vho:A, 1110-1117
UUCUAA
2aar:0, 2089-2096, 2o43:A, 2089-2096
UUGAAA
1xbp:0, 664-671