Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(006)-Segment cluster 2767 (cutoff=2.5 Å)
Cluster size 233 structure(s)
Representative structure 3ccs:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NDDDWH
Cluster members
AAAGAC
1vs6:B, 2041-2048, 1vs8:B, 2041-2048, 1vsa:w, 2057-2064, 1vsp:w, 2057-2064, 1yhq:0, 2060-2067, 1yi2:0, 2060-2067, 1yij:0, 2060-2067, 1yjn:0, 2060-2067, 1yjw:0, 2060-2067, 2aw4:B, 2041-2048, 2awb:B, 2041-2048, 2hgj:A, 2057-2064, 2hgq:A, 2057-2064, 2hgu:A, 2057-2064, 2i2t:B, 2041-2048, 2i2v:B, 2041-2048, 2j28:B, 2041-2048, 2qam:B, 2041-2048, 2qao:B, 2041-2048, 2qba:B, 2041-2048, 2qbc:B, 2041-2048, 2qbe:B, 2041-2048, 2qbg:B, 2041-2048, 2qbi:B, 2041-2048, 2qbk:B, 2041-2048, 2qov:B, 2041-2048, 2qox:B, 2041-2048, 2qoz:B, 2041-2048, 2qp1:B, 2041-2048, 2vhm:B, 2041-2048, 2vhn:B, 2041-2048, 2z4l:B, 2041-2048, 2z4n:B, 2041-2048, 3cc7:0, 2060-2067, 3cce:0, 2060-2067, 3ccj:0, 2060-2067, 3ccl:0, 2060-2067, 3ccm:0, 2060-2067, 3ccq:0, 2060-2067, 3ccr:0, 2060-2067, 3ccs:0, 2060-2067, 3ccu:0, 2060-2067, 3ccv:0, 2060-2067, 3cd6:0, 2060-2067, 3cpw:0, 2060-2067, 3df2:B, 2041-2048, 3df4:B, 2041-2048
CAGUAC
1yhq:0, 347-354, 1yi2:0, 347-354, 1yij:0, 347-354, 1yit:0, 347-354, 1yj9:0, 347-354, 1yjn:0, 347-354, 1yjw:0, 347-354, 3cc2:0, 347-354, 3cc4:0, 347-354, 3cc7:0, 347-354, 3cce:0, 347-354, 3ccj:0, 347-354, 3ccl:0, 347-354, 3ccm:0, 347-354, 3ccq:0, 347-354, 3ccr:0, 347-354, 3ccs:0, 347-354, 3ccu:0, 347-354, 3ccv:0, 347-354, 3cd6:0, 347-354, 3cma:0, 347-354, 3cme:0, 347-354
CUGAAU
1vs6:B, 274-281, 1vs8:B, 274-281, 2aw4:B, 274-281, 2awb:B, 274-281, 2i2t:B, 274-281, 2j28:B, 274-281, 2qam:B, 274-281, 2qao:B, 274-281, 2qba:B, 274-281, 2qbe:B, 274-281, 2qbg:B, 274-281, 2qbi:B, 274-281, 2qbk:B, 274-281, 2qov:B, 274-281, 2qox:B, 274-281, 2qoz:B, 274-281, 2qp1:B, 274-281, 2z4l:B, 274-281, 2z4n:B, 274-281, 3bbx:B, 274-281, 3df2:B, 274-281, 3df4:B, 274-281
GAAAUC
1vs5:A, 601-608, 1vs7:A, 601-608, 2avy:A, 601-608, 2aw7:A, 601-608, 2i2p:A, 601-608, 2i2u:A, 601-608, 2qal:A, 601-608, 2qan:A, 601-608, 2qb9:A, 601-608, 2qbb:A, 601-608, 2qbd:A, 601-608, 2qbf:A, 601-608, 2qbh:A, 601-608, 2qbj:A, 601-608, 2qoy:A, 601-608, 2qp0:A, 601-608, 2z4k:A, 601-608, 2z4m:A, 601-608, 3df1:A, 601-608, 3df3:A, 601-608
GAAGAC
1ffk:0, 2010-2017, 1jj2:0, 2060-2067, 1k73:A, 2060-2067, 1k8a:A, 2060-2067, 1k9m:A, 2060-2067, 1kc8:A, 2060-2067, 1kd1:A, 2060-2067, 1kqs:0, 2060-2067, 1m1k:A, 2060-2067, 1m90:A, 2060-2067, 1n8r:A, 2060-2067, 1nji:A, 2060-2067, 1q7y:A, 2060-2067, 1q81:A, 2060-2067, 1q82:A, 2060-2067, 1q86:A, 2060-2067, 1qvf:0, 2060-2067, 1qvg:0, 2060-2067, 1s1i:3, 2246-2253, 1s72:0, 2060-2067, 1vq4:0, 2060-2067, 1vq5:0, 2060-2067, 1vq6:0, 2060-2067, 1vq7:0, 2060-2067, 1vq8:0, 2060-2067, 1vq9:0, 2060-2067, 1vqk:0, 2060-2067, 1vql:0, 2060-2067, 1vqm:0, 2060-2067, 1vqn:0, 2060-2067, 1vqo:0, 2060-2067, 1vqp:0, 2060-2067, 1w2b:0, 2060-2067, 1yit:0, 2060-2067, 1yj9:0, 2060-2067, 2otj:0, 2060-2067, 2otl:0, 2060-2067, 2qa4:0, 2065-2072, 2qex:0, 2060-2067, 3cc2:0, 2060-2067, 3cc4:0, 2060-2067, 3cma:0, 2060-2067, 3cme:0, 2060-2067
GAGUAC
1fjg:A, 860-867, 1hnw:A, 860-867, 1hnx:A, 860-867, 1hnz:A, 860-867, 1hr0:A, 860-867, 1i94:A, 863-870, 1i95:A, 863-870, 1i96:A, 863-870, 1ibk:A, 860-867, 1ibl:A, 860-867, 1ibm:A, 860-867, 1j5e:A, 860-867, 1n32:A, 860-867, 1n33:A, 860-867, 1n34:A, 860-867, 1n36:A, 860-867, 1pns:A, 880-887, 1pnx:A, 880-887, 1s1h:A, 865-872, 1voq:A, 880-887, 1vos:A, 880-887, 1vov:A, 880-887, 1vox:A, 880-887, 1voz:A, 880-887, 1vs5:A, 883-890, 1vs7:A, 883-890, 1xmo:A, 860-867, 1xmq:A, 860-867, 1xnq:A, 860-867, 1xnr:A, 860-867, 1yl3:A, 396-403, 1yl4:A, 860-867, 2avy:A, 883-890, 2aw7:A, 883-890, 2e5l:A, 861-868, 2f4v:A, 860-867, 2gy9:A, 847-854, 2hgi:A, 860-867, 2hgp:A, 860-867, 2hgr:A, 860-867, 2hhh:A, 860-867, 2i2p:A, 883-890, 2i2u:A, 883-890, 2j00:A, 860-867, 2j02:A, 860-867, 2jl5:A, 860-867, 2jl7:A, 860-867, 2ow8:y, 860-867, 2qal:A, 883-890, 2qan:A, 883-890, 2qb9:A, 883-890, 2qbb:A, 883-890, 2qbd:A, 883-890, 2qbf:A, 883-890, 2qbh:A, 883-890, 2qbj:A, 883-890, 2qnh:y, 860-867, 2qou:A, 883-890, 2qow:A, 883-890, 2qoy:A, 883-890, 2qp0:A, 883-890, 2uu9:A, 860-867, 2uua:A, 860-867, 2uub:A, 860-867, 2uuc:A, 860-867, 2uxb:A, 860-867, 2uxc:A, 860-867, 2uxd:A, 838-845, 2v46:A, 860-867, 2v48:A, 860-867, 2vqe:A, 860-867, 2vqf:A, 860-867, 2z4k:A, 883-890, 2z4m:A, 883-890, 3d5a:A, 860-867, 3d5c:A, 860-867, 3df1:A, 883-890, 3df3:A, 883-890
UGUAAA
1fka:A, 417-424