Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(006)-Segment cluster 2216 (cutoff=2.5 Å)
Cluster size 75 structure(s)
Representative structure 2qow:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NNNNNV
Cluster members
ACGCUA
1vou:B, 1397-1404, 1vow:B, 1397-1404, 1vp0:B, 1397-1404
AGAGAA
1vor:B, 1616-1623, 1vou:B, 1616-1623, 1vow:B, 1616-1623, 1voy:B, 1616-1623, 1vp0:B, 1616-1623
AGGAUA
1fmn:A, 7-14
CCUGAA
2vhm:B, 2751-2758, 2vhn:B, 2751-2758, 3bbx:B, 3034-3041
GAAGAA
1fjg:A, 400-407, 1hnw:A, 400-407, 1hnx:A, 400-407, 1hnz:A, 400-407, 1hr0:A, 400-407, 1i94:A, 403-410, 1i95:A, 403-410, 1i96:A, 403-410, 1ibk:A, 400-407, 1ibl:A, 400-407, 1ibm:A, 400-407, 1j5e:A, 400-407, 1n32:A, 400-407, 1n33:A, 400-407, 1pns:A, 404-411, 1pnx:A, 404-411, 1s1h:A, 405-412, 1vs5:A, 405-412, 1vs7:A, 405-412, 2avy:A, 405-412, 2aw7:A, 405-412, 2e5l:A, 401-408, 2hgi:A, 400-407, 2hgp:A, 400-407, 2hgr:A, 400-407, 2hhh:A, 400-407, 2j00:A, 400-407, 2j02:A, 400-407, 2jl5:A, 400-407, 2jl7:A, 400-407, 2ow8:y, 400-407, 2qal:A, 405-412, 2qan:A, 405-412, 2qb9:A, 405-412, 2qbb:A, 405-412, 2qbd:A, 405-412, 2qbf:A, 405-412, 2qbh:A, 405-412, 2qbj:A, 405-412, 2qnh:y, 400-407, 2qou:A, 405-412, 2qow:A, 405-412, 2qoy:A, 405-412, 2qp0:A, 405-412, 2uu9:A, 400-407, 2uua:A, 400-407, 2uub:A, 400-407, 2uuc:A, 400-407, 2v46:A, 400-407, 2v48:A, 400-407, 2vqe:A, 400-407, 2vqf:A, 400-407, 2z4k:A, 405-412, 2z4m:A, 405-412, 3d5a:A, 400-407, 3d5c:A, 400-407, 3df1:A, 405-412, 3df3:A, 405-412
GCUGGA
2v47:A, 1181-1188, 2v49:A, 1181-1188
GGGUGC
2vqe:A, 995-1002
UGGCGG
1n36:A, 32-39
UUCUCC
1xbp:0, 772-779