Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(006)-Segment cluster 2676 (cutoff=2.0 Å)
Cluster size 110 structure(s)
Representative structure 3cce:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NNDVAH
Cluster members
AAAGAC
1vs6:B, 2041-2048, 1vs8:B, 2041-2048, 1yhq:0, 2060-2067, 1yi2:0, 2060-2067, 1yij:0, 2060-2067, 1yjn:0, 2060-2067, 1yjw:0, 2060-2067, 2aw4:B, 2041-2048, 2awb:B, 2041-2048, 2hgj:A, 2057-2064, 2hgq:A, 2057-2064, 2hgu:A, 2057-2064, 2i2t:B, 2041-2048, 2i2v:B, 2041-2048, 2j28:B, 2041-2048, 2qam:B, 2041-2048, 2qao:B, 2041-2048, 2qba:B, 2041-2048, 2qbc:B, 2041-2048, 2qbe:B, 2041-2048, 2qbg:B, 2041-2048, 2qbi:B, 2041-2048, 2qbk:B, 2041-2048, 2qov:B, 2041-2048, 2qox:B, 2041-2048, 2qoz:B, 2041-2048, 2qp1:B, 2041-2048, 2vhm:B, 2041-2048, 2vhn:B, 2041-2048, 2z4l:B, 2041-2048, 2z4n:B, 2041-2048, 3cc7:0, 2060-2067, 3cce:0, 2060-2067, 3ccj:0, 2060-2067, 3ccl:0, 2060-2067, 3ccm:0, 2060-2067, 3ccq:0, 2060-2067, 3ccr:0, 2060-2067, 3ccs:0, 2060-2067, 3ccu:0, 2060-2067, 3ccv:0, 2060-2067, 3cd6:0, 2060-2067, 3cpw:0, 2060-2067, 3df2:B, 2041-2048, 3df4:B, 2041-2048
CUGAAU
1vs6:B, 274-281, 1vs8:B, 274-281, 2aw4:B, 274-281, 2i2t:B, 274-281, 2qam:B, 274-281, 2qao:B, 274-281, 2qba:B, 274-281, 2qbc:B, 274-281, 2qbe:B, 274-281, 2qbg:B, 274-281, 2qbi:B, 274-281, 2qbk:B, 274-281, 2qov:B, 274-281, 2qox:B, 274-281, 2qoz:B, 274-281, 2z4l:B, 274-281, 2z4n:B, 274-281, 3bbx:B, 274-281, 3df2:B, 274-281, 3df4:B, 274-281
GAAGAC
1ffk:0, 2010-2017, 1jj2:0, 2060-2067, 1k73:A, 2060-2067, 1k8a:A, 2060-2067, 1k9m:A, 2060-2067, 1kc8:A, 2060-2067, 1kd1:A, 2060-2067, 1kqs:0, 2060-2067, 1m1k:A, 2060-2067, 1m90:A, 2060-2067, 1n8r:A, 2060-2067, 1nji:A, 2060-2067, 1q7y:A, 2060-2067, 1q81:A, 2060-2067, 1q82:A, 2060-2067, 1q86:A, 2060-2067, 1qvf:0, 2060-2067, 1qvg:0, 2060-2067, 1s1i:3, 2246-2253, 1s72:0, 2060-2067, 1vq4:0, 2060-2067, 1vq5:0, 2060-2067, 1vq6:0, 2060-2067, 1vq7:0, 2060-2067, 1vq8:0, 2060-2067, 1vq9:0, 2060-2067, 1vqk:0, 2060-2067, 1vql:0, 2060-2067, 1vqm:0, 2060-2067, 1vqn:0, 2060-2067, 1vqo:0, 2060-2067, 1vqp:0, 2060-2067, 1w2b:0, 2060-2067, 1yit:0, 2060-2067, 1yj9:0, 2060-2067, 2otj:0, 2060-2067, 2otl:0, 2060-2067, 2qa4:0, 2065-2072, 2qex:0, 2060-2067, 3cc2:0, 2060-2067, 3cc4:0, 2060-2067, 3cma:0, 2060-2067, 3cme:0, 2060-2067
UCUCAU
3ccr:0, 272-279
UGUAAA
1fka:A, 417-424