Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(006)-Segment cluster 2113 (cutoff=2.0 Å)
Cluster size 42 structure(s)
Representative structure 2qbh:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence VNNNNH
Cluster members
AAUACU
1ykq:B, 28-35, 1ykq:D, 28-35, 1ykv:B, 28-35, 1ykv:D, 28-35, 1yls:B, 28-35, 1yls:D, 28-35
ACGAAA
2vhm:B, 2707-2714
AGCUUU
1nwy:0, 1987-1994
AUCAGU
1l9a:B, 117-124
CUAAUA
1vs5:A, 164-171, 1vs7:A, 164-171, 2avy:A, 164-171, 2aw7:A, 164-171, 2gy9:A, 157-164, 2gyb:A, 157-164, 2i2p:A, 164-171, 2i2u:A, 164-171, 2qal:A, 164-171, 2qan:A, 164-171, 2qb9:A, 164-171, 2qbb:A, 164-171, 2qbd:A, 164-171, 2qbf:A, 164-171, 2qbh:A, 164-171, 2qbj:A, 164-171, 2qou:A, 164-171, 2qow:A, 164-171, 2qoy:A, 164-171, 2qp0:A, 164-171, 2z4k:A, 164-171, 2z4m:A, 164-171, 3df1:A, 164-171, 3df3:A, 164-171
GCUAAU
1fka:A, 157-164, 1i94:A, 160-167
GCUGGA
2v47:A, 1181-1188, 2v49:A, 1181-1188
GGAGGA
2gyc:0, 661-668
GGAGGU
3bbo:A, 705-712
GGGAAC
3dll:X, 154-161
GUCCAA
2vhm:B, 1300-1307, 2vhn:B, 1300-1307